More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4086 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 527 aa  1049    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  46.22 
 
 		 526 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  43.28 
 
 		 503 aa  331  2e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 531 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.14 
 
 		 547 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.88 
 
 		 543 aa  257  4e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.07 
 
 		 547 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  38.39 
 
 		 533 aa  249  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 546 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 546 aa  249  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 546 aa  248  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 546 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 546 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  39.43 
 
 		 523 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  39.43 
 
 		 523 aa  246  6e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 532 aa  246  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.31 
 
 		 547 aa  244  3e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 		 506 aa  243  7e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.95 
 
 		 539 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  37.19 
 
 		 534 aa  239  9e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.22 
 
 		 550 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  35.52 
 
 		 500 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.09 
 
 		 518 aa  233  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 500 aa  232  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  39.52 
 
 		 541 aa  232  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  35.59 
 
 		 503 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 555 aa  231  3e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 540 aa  231  3e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.47 
 
 		 549 aa  226  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 517 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.75 
 
 		 547 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 525 aa  223  6e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  31.03 
 
 		 548 aa  223  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  31.03 
 
 		 548 aa  223  6e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  30.71 
 
 		 566 aa  223  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  30.96 
 
 		 546 aa  223  9e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  30.71 
 
 		 566 aa  223  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  36.45 
 
 		 498 aa  223  9e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.53 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  33.84 
 
 		 551 aa  222  9.999999999999999e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.21 
 
 		 549 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.78 
 
 		 552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 548 aa  221  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.96 
 
 		 513 aa  220  6e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.21 
 
 		 559 aa  219  1e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  30.52 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0025  Rossmann fold nucleotide-binding protein-like protein  32.93 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  31.27 
 
 		 543 aa  217  4e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 570 aa  216  8e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 582 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.42 
 
 		 547 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.5 
 
 		 583 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 512 aa  214  2.9999999999999995e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  29.72 
 
 		 549 aa  213  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 520 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 530 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.91 
 
 		 579 aa  212  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 525 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 507 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 552 aa  210  4e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.5 
 
 		 526 aa  210  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 		 499 aa  210  6e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 		 556 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 		 556 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.69 
 
 		 556 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 509 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 843 aa  209  1e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 		 502 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0967  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 525 aa  209  1e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 501 aa  209  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.25 
 
 		 503 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 		 570 aa  207  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  33.81 
 
 		 512 aa  206  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  32.71 
 
 		 503 aa  206  9e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2522  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 534 aa  206  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 559 aa  206  1e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 542 aa  206  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1823  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 590 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340501  normal  0.0118022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 504 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  31.13 
 
 		 511 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3129  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.22 
 
 		 530 aa  204  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  31.78 
 
 		 482 aa  204  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 553 aa  204  3e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 508 aa  204  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.88 
 
 		 526 aa  203  5e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 503 aa  203  7e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  34.18 
 
 		 1004 aa  203  7e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 525 aa  203  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  32.1 
 
 		 536 aa  203  8e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 542 aa  202  9e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  32.92 
 
 		 504 aa  202  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.67 
 
 		 525 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  33.79 
 
 		 601 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>