More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6445 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 542 aa  1110    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 517 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  34.08 
 
 		 546 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  34.08 
 
 		 546 aa  280  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  34.08 
 
 		 546 aa  279  8e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.51 
 
 		 549 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.15 
 
 		 546 aa  277  3e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 546 aa  277  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 546 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  33.58 
 
 		 555 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 630 aa  273  9e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.01 
 
 		 547 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.39 
 
 		 547 aa  270  4e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 548 aa  270  5e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 552 aa  269  7e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 548 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  33.21 
 
 		 546 aa  269  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  33.21 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  33.21 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.01 
 
 		 547 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 524 aa  264  4e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.27 
 
 		 547 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 		 520 aa  261  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.82 
 
 		 540 aa  260  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 541 aa  259  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.58 
 
 		 547 aa  258  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 566 aa  257  4e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 550 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  32.41 
 
 		 576 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.16 
 
 		 539 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.89 
 
 		 538 aa  250  4e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  32.58 
 
 		 575 aa  248  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.08 
 
 		 538 aa  247  3e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  31.92 
 
 		 576 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 578 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.13 
 
 		 538 aa  246  9e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  31.66 
 
 		 546 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.51 
 
 		 538 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  31.85 
 
 		 546 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  30.41 
 
 		 549 aa  246  9.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  32.04 
 
 		 575 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 525 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.7 
 
 		 538 aa  245  1.9999999999999999e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 557 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  31.73 
 
 		 576 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.7 
 
 		 538 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.33 
 
 		 549 aa  244  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.7 
 
 		 538 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.7 
 
 		 538 aa  244  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  31.85 
 
 		 575 aa  244  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  31.16 
 
 		 557 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 		 547 aa  243  5e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 571 aa  243  6e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.51 
 
 		 538 aa  243  6e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  32.17 
 
 		 557 aa  243  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 562 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.95 
 
 		 1004 aa  243  9e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  34.28 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.85 
 
 		 518 aa  242  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0874  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.98 
 
 		 547 aa  242  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 512 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 		 571 aa  242  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.153732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  32.35 
 
 		 575 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  32.46 
 
 		 539 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  31.73 
 
 		 546 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  32.79 
 
 		 543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.51 
 
 		 538 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.78 
 
 		 543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  32.12 
 
 		 570 aa  240  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  31.79 
 
 		 575 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 538 aa  240  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  31.67 
 
 		 546 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  31.61 
 
 		 575 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  31.61 
 
 		 575 aa  239  8e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  30.55 
 
 		 571 aa  239  9e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0241  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 545 aa  239  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.276778  normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  30.63 
 
 		 562 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  31.81 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0784  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.59 
 
 		 547 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 596 aa  237  5.0000000000000005e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.14 
 
 		 550 aa  237  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  32.57 
 
 		 538 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  33.4 
 
 		 638 aa  236  8e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2148  salicyl-AMP ligase  33.59 
 
 		 687 aa  236  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0537387  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.33 
 
 		 552 aa  235  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  30.94 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 500 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  30.04 
 
 		 557 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 541 aa  233  5e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 505 aa  233  5e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.5 
 
 		 512 aa  233  6e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.59 
 
 		 510 aa  233  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 544 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.29 
 
 		 552 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  30.91 
 
 		 543 aa  233  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  29.81 
 
 		 579 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>