More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1007 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 571 aa  1155    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.153732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  49.2 
 
 		 553 aa  480  1e-134  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1545  AMP-dependent synthetase and ligase  45.45 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 		 542 aa  246  6e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.39 
 
 		 518 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 513 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  31.79 
 
 		 546 aa  233  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  31.15 
 
 		 548 aa  231  2e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.45 
 
 		 547 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  31.62 
 
 		 546 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  31.62 
 
 		 546 aa  230  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4034  AMP-dependent synthetase and ligase  30.11 
 
 		 552 aa  230  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  30.8 
 
 		 548 aa  229  7e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  31.62 
 
 		 546 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  31.62 
 
 		 546 aa  229  8e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 555 aa  229  9e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  31.22 
 
 		 546 aa  229  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.67 
 
 		 524 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  30.97 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  30.8 
 
 		 548 aa  228  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  30.97 
 
 		 566 aa  228  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.31 
 
 		 519 aa  227  4e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 		 548 aa  227  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3103  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 572 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.970442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.61 
 
 		 543 aa  224  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 		 541 aa  223  6e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 566 aa  223  9e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09240  pyochelin biosynthesis protein PchD  33.03 
 
 		 547 aa  223  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.248611  normal  0.861718 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32 
 
 		 547 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  32.12 
 
 		 538 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.68 
 
 		 520 aa  218  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  32.24 
 
 		 538 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.29 
 
 		 547 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.94 
 
 		 547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 550 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 		 524 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0872  pyochelin biosynthesis protein PchD  32.04 
 
 		 547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.453067  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1338  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  31.34 
 
 		 550 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 557 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.89 
 
 		 518 aa  213  7.999999999999999e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  30.3 
 
 		 543 aa  213  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0670  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 550 aa  213  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  32.29 
 
 		 638 aa  212  1e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.26 
 
 		 538 aa  212  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 550 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  29.78 
 
 		 539 aa  211  3e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.48 
 
 		 543 aa  211  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  28.4 
 
 		 549 aa  210  5e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.53 
 
 		 549 aa  210  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  27.35 
 
 		 552 aa  210  6e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  27.83 
 
 		 552 aa  210  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.48 
 
 		 549 aa  210  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 508 aa  210  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  28.35 
 
 		 549 aa  209  8e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.16 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2803  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 532 aa  208  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.11 
 
 		 538 aa  207  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  27.54 
 
 		 549 aa  207  5e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.7 
 
 		 518 aa  207  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.41 
 
 		 518 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.19 
 
 		 538 aa  206  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.84 
 
 		 542 aa  206  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.89 
 
 		 518 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.27 
 
 		 546 aa  206  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.86 
 
 		 518 aa  205  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 519 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 508 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2676  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 991 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.11 
 
 		 538 aa  204  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  32.66 
 
 		 508 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.11 
 
 		 538 aa  204  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.93 
 
 		 538 aa  204  4e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.11 
 
 		 538 aa  204  4e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.7 
 
 		 518 aa  204  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  31 
 
 		 548 aa  204  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.01 
 
 		 538 aa  204  5e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.91 
 
 		 540 aa  203  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.32 
 
 		 514 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 555 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.63836 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3615  AMP-dependent synthetase and ligase  30.76 
 
 		 555 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2386  enterobactin synthase subunit E  31.33 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444904  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  31.64 
 
 		 562 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.93 
 
 		 538 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.93 
 
 		 538 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.89 
 
 		 518 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  29.06 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 530 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 561 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  31.82 
 
 		 557 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.47 
 
 		 550 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 541 aa  201  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.89 
 
 		 518 aa  201  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  29.68 
 
 		 557 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0561  enterobactin synthase subunit E  29.86 
 
 		 542 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.89 
 
 		 518 aa  200  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 504 aa  200  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 507 aa  200  6e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  31.47 
 
 		 540 aa  200  7e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>