More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3934 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 541 aa  1061    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.49 
 
 		 543 aa  401  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  45.34 
 
 		 549 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.38 
 
 		 547 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.75 
 
 		 550 aa  391  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.75 
 
 		 547 aa  389  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  46.4 
 
 		 539 aa  388  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.13 
 
 		 547 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.39 
 
 		 547 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  41.34 
 
 		 549 aa  381  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  39.01 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  41.1 
 
 		 546 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  42.07 
 
 		 547 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  41.59 
 
 		 552 aa  365  1e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 		 540 aa  362  9e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  37.15 
 
 		 546 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  37.15 
 
 		 546 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  37.15 
 
 		 546 aa  357  3.9999999999999996e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  36.97 
 
 		 546 aa  355  1e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  36.6 
 
 		 546 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  36.92 
 
 		 548 aa  350  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  36.92 
 
 		 566 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  36.92 
 
 		 566 aa  350  5e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  36.73 
 
 		 548 aa  347  4e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  36.04 
 
 		 546 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  36.55 
 
 		 548 aa  343  5.999999999999999e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 		 500 aa  342  1e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 548 aa  341  2e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  42.58 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  42.58 
 
 		 500 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  42.25 
 
 		 503 aa  337  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  42.02 
 
 		 498 aa  323  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  43.54 
 
 		 526 aa  312  7.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  40.94 
 
 		 1004 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  42.67 
 
 		 512 aa  300  5e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 531 aa  299  1e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  34.83 
 
 		 543 aa  296  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  36.28 
 
 		 534 aa  293  6e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 		 534 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 552 aa  283  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  41.65 
 
 		 503 aa  281  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  38.68 
 
 		 523 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  38.68 
 
 		 523 aa  278  2e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 		 533 aa  277  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.52 
 
 		 538 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  34.48 
 
 		 550 aa  277  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 		 566 aa  276  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  37.98 
 
 		 630 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.9 
 
 		 538 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 		 542 aa  270  5e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.52 
 
 		 538 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.15 
 
 		 538 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 532 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.52 
 
 		 538 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.52 
 
 		 538 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.33 
 
 		 538 aa  267  4e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.52 
 
 		 538 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.52 
 
 		 538 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.52 
 
 		 538 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  32.22 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  36.09 
 
 		 542 aa  263  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  37.07 
 
 		 552 aa  263  6.999999999999999e-69  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  32.84 
 
 		 549 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 517 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.46 
 
 		 540 aa  259  6e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 		 524 aa  256  6e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4034  AMP-dependent synthetase and ligase  33.64 
 
 		 552 aa  253  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.39 
 
 		 518 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  31.85 
 
 		 549 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  35.82 
 
 		 543 aa  249  8e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 571 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  30.9 
 
 		 549 aa  248  2e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 513 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 		 553 aa  247  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3774  (2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate synthase  38.72 
 
 		 537 aa  247  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  32.04 
 
 		 570 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  32.47 
 
 		 575 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 		 973 aa  245  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  36.87 
 
 		 548 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0318  AMP-binding domain protein  32.65 
 
 		 571 aa  244  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.922079  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  32.29 
 
 		 575 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  36.09 
 
 		 509 aa  244  3.9999999999999997e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  32.29 
 
 		 575 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  33.92 
 
 		 538 aa  243  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5941  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 578 aa  243  9e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0214212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  32.59 
 
 		 571 aa  243  9e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  31.33 
 
 		 544 aa  243  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  32.46 
 
 		 575 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  30.73 
 
 		 552 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  34.7 
 
 		 562 aa  242  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 534 aa  242  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3850  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 550 aa  243  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605707  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  32.34 
 
 		 575 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  31.41 
 
 		 542 aa  241  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  32.16 
 
 		 575 aa  240  4e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 550 aa  240  5e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3399  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.43 
 
 		 563 aa  240  5.999999999999999e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795488  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 550 aa  239  9e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  32.41 
 
 		 578 aa  239  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 538 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>