More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3657 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  78.69 
 
 		 534 aa  813    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 523 aa  1058    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  95.87 
 
 		 533 aa  981    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  70.64 
 
 		 531 aa  717    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 523 aa  1058    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  79.19 
 
 		 532 aa  802    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 503 aa  287  2.9999999999999996e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  38.68 
 
 		 541 aa  282  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 		 526 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 527 aa  263  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 546 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  33.84 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  33.65 
 
 		 546 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  33.65 
 
 		 546 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  33.27 
 
 		 555 aa  257  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 548 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  33.02 
 
 		 546 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  32.95 
 
 		 548 aa  253  7e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  32.95 
 
 		 566 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  32.95 
 
 		 566 aa  251  2e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  32.95 
 
 		 548 aa  251  3e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 548 aa  250  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.9 
 
 		 543 aa  244  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  37.38 
 
 		 540 aa  239  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.71 
 
 		 539 aa  238  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.79 
 
 		 518 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.03 
 
 		 549 aa  232  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  30.19 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.46 
 
 		 547 aa  224  2e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.22 
 
 		 547 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.23 
 
 		 549 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  35.43 
 
 		 503 aa  216  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.91 
 
 		 547 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.78 
 
 		 547 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.44 
 
 		 550 aa  212  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.37 
 
 		 546 aa  209  7e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.12 
 
 		 1004 aa  209  7e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 500 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.84 
 
 		 547 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 498 aa  206  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.44 
 
 		 552 aa  205  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 517 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  34.42 
 
 		 533 aa  204  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  28.09 
 
 		 550 aa  202  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  32.65 
 
 		 547 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  32.63 
 
 		 538 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  33.01 
 
 		 538 aa  197  3e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  28.99 
 
 		 550 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 513 aa  197  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  32.76 
 
 		 546 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  31.96 
 
 		 540 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  31.96 
 
 		 540 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.42 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  30.13 
 
 		 570 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.13 
 
 		 630 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  30.13 
 
 		 570 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  30.13 
 
 		 570 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  30.94 
 
 		 576 aa  194  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  31.96 
 
 		 540 aa  194  4e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  31.11 
 
 		 549 aa  194  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  31.58 
 
 		 562 aa  194  5e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  32.57 
 
 		 546 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 508 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  27.09 
 
 		 549 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  29.52 
 
 		 552 aa  191  2e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 563 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.48 
 
 		 1043 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  30.41 
 
 		 552 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  30.78 
 
 		 575 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  30.78 
 
 		 575 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  29 
 
 		 549 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 512 aa  189  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  28.44 
 
 		 550 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 512 aa  189  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  29.96 
 
 		 578 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  29.57 
 
 		 570 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  29.98 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  29.68 
 
 		 552 aa  187  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  29.8 
 
 		 570 aa  187  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  30.22 
 
 		 552 aa  186  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 545 aa  186  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 		 546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  30.29 
 
 		 561 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  30.43 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  29.93 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 		 554 aa  184  3e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  27.99 
 
 		 547 aa  184  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  30.41 
 
 		 575 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  29.26 
 
 		 570 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  30.4 
 
 		 575 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 506 aa  184  4.0000000000000006e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>