More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4135 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  79.19 
 
 		 523 aa  792    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  81.46 
 
 		 534 aa  867    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  79.27 
 
 		 533 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  69.73 
 
 		 531 aa  705    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  79.19 
 
 		 523 aa  792    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 532 aa  1073    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  41.38 
 
 		 503 aa  295  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 526 aa  288  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  35.53 
 
 		 555 aa  277  4e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  38.55 
 
 		 541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  37.31 
 
 		 527 aa  260  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 546 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 546 aa  257  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 546 aa  257  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 546 aa  257  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 546 aa  256  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  32.32 
 
 		 548 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  32.32 
 
 		 566 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  32.32 
 
 		 546 aa  254  3e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  32.32 
 
 		 566 aa  254  3e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  32.13 
 
 		 548 aa  252  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 548 aa  247  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.46 
 
 		 539 aa  246  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  32.39 
 
 		 548 aa  246  8e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  31.63 
 
 		 543 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.22 
 
 		 543 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 503 aa  228  2e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.62 
 
 		 547 aa  228  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.3 
 
 		 518 aa  226  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.66 
 
 		 547 aa  226  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.73 
 
 		 547 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 540 aa  225  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.58 
 
 		 549 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.76 
 
 		 549 aa  223  6e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.87 
 
 		 546 aa  223  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.54 
 
 		 550 aa  216  5.9999999999999996e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 500 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 500 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 500 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.09 
 
 		 552 aa  216  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 498 aa  214  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.33 
 
 		 547 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 534 aa  212  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 552 aa  212  2e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.03 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 517 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 533 aa  205  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  34.02 
 
 		 524 aa  203  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 630 aa  202  8e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  26.35 
 
 		 549 aa  201  3e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 566 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 513 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  28.97 
 
 		 549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.54 
 
 		 1004 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  31.12 
 
 		 576 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  27.8 
 
 		 550 aa  197  5.000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 512 aa  197  6e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  31.31 
 
 		 546 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  31.32 
 
 		 575 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  31.32 
 
 		 575 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  30.87 
 
 		 546 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  30.02 
 
 		 552 aa  193  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.58 
 
 		 549 aa  193  6e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  31.51 
 
 		 538 aa  193  8e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  31.23 
 
 		 546 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  32.27 
 
 		 538 aa  192  1e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 512 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 567 aa  192  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  30.28 
 
 		 570 aa  191  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 510 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.37 
 
 		 503 aa  192  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  30.58 
 
 		 549 aa  191  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  30.93 
 
 		 575 aa  190  5e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  31.81 
 
 		 539 aa  190  5e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 575 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  30.43 
 
 		 574 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 575 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  31.18 
 
 		 549 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  30.67 
 
 		 576 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  31.67 
 
 		 562 aa  189  1e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  30.57 
 
 		 576 aa  189  1e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  31.4 
 
 		 576 aa  189  1e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  30.57 
 
 		 576 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  30.13 
 
 		 570 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  29.56 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  30.4 
 
 		 576 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  31.01 
 
 		 576 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 575 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  31.3 
 
 		 540 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  31.01 
 
 		 576 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  31.01 
 
 		 570 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  31.01 
 
 		 576 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  32.49 
 
 		 534 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 508 aa  187  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  30.93 
 
 		 540 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  30.93 
 
 		 540 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  31.54 
 
 		 560 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  29.56 
 
 		 552 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  30.62 
 
 		 570 aa  186  8e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  28.89 
 
 		 550 aa  186  9e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>