More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0869 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 503 aa  1021    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  47.98 
 
 		 526 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  43.28 
 
 		 527 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  40.86 
 
 		 532 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  37.67 
 
 		 555 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 		 534 aa  302  9e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  40.94 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  39.8 
 
 		 523 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  39.8 
 
 		 523 aa  297  2e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 531 aa  297  4e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  41.21 
 
 		 503 aa  292  8e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  38.75 
 
 		 533 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  37.17 
 
 		 546 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  37.17 
 
 		 546 aa  290  5.0000000000000004e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  37.17 
 
 		 546 aa  290  6e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  36.77 
 
 		 546 aa  287  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  36.97 
 
 		 546 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  36.42 
 
 		 548 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  36.42 
 
 		 548 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 500 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 500 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  38.06 
 
 		 500 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  35.56 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  38.53 
 
 		 539 aa  281  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  37.39 
 
 		 548 aa  280  6e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  36.22 
 
 		 566 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  36.22 
 
 		 566 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 548 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.45 
 
 		 543 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  38.51 
 
 		 540 aa  276  6e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  36.5 
 
 		 498 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.08 
 
 		 546 aa  275  1.0000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.86 
 
 		 547 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.4 
 
 		 550 aa  271  2e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.2 
 
 		 547 aa  263  4e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  38.11 
 
 		 1004 aa  263  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.14 
 
 		 547 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.99 
 
 		 547 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.33 
 
 		 549 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  38.76 
 
 		 512 aa  254  2.0000000000000002e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.05 
 
 		 552 aa  252  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.14 
 
 		 549 aa  249  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.98 
 
 		 547 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 524 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 534 aa  240  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  37.07 
 
 		 504 aa  238  2e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  31.22 
 
 		 553 aa  237  4e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 551 aa  233  7.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  37.26 
 
 		 553 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  31.22 
 
 		 549 aa  232  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 506 aa  231  2e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  32.52 
 
 		 517 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  30.48 
 
 		 552 aa  230  4e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  36.46 
 
 		 503 aa  230  5e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.43 
 
 		 513 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 552 aa  229  7e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  30.13 
 
 		 550 aa  228  2e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  30.98 
 
 		 552 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.69 
 
 		 518 aa  227  3e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.62 
 
 		 630 aa  227  4e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  33.26 
 
 		 546 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  33.05 
 
 		 546 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  35.73 
 
 		 522 aa  226  9e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  31.54 
 
 		 552 aa  225  1e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 532 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  34.37 
 
 		 547 aa  225  2e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 843 aa  224  3e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  30.55 
 
 		 543 aa  224  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 534 aa  224  3e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.61 
 
 		 519 aa  224  3e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 508 aa  224  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.46 
 
 		 549 aa  223  6e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  29.64 
 
 		 558 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  30.37 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  34.73 
 
 		 582 aa  222  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  31.58 
 
 		 552 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  28.84 
 
 		 554 aa  221  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  30.43 
 
 		 549 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 501 aa  220  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.83 
 
 		 510 aa  220  3.9999999999999997e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  30.46 
 
 		 549 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  30.2 
 
 		 547 aa  220  5e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4181  acyl-CoA synthetase  35.08 
 
 		 522 aa  219  1e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.273498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 544 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 525 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.04 
 
 		 500 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 541 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 508 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 544 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.56 
 
 		 510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.56 
 
 		 510 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  29.44 
 
 		 568 aa  217  4e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 520 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  32.55 
 
 		 546 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  32.92 
 
 		 560 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.98 
 
 		 510 aa  216  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 584 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>