More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3211 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 534 aa  1077    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.64 
 
 		 543 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.78 
 
 		 539 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.33 
 
 		 546 aa  297  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.02 
 
 		 547 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  33.59 
 
 		 543 aa  284  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.69 
 
 		 549 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.77 
 
 		 550 aa  281  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  32.63 
 
 		 555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.81 
 
 		 547 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.48 
 
 		 547 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.55 
 
 		 547 aa  272  1e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.09 
 
 		 547 aa  269  8e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.15 
 
 		 549 aa  267  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 534 aa  266  8.999999999999999e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  31.36 
 
 		 549 aa  264  3e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 503 aa  260  4e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  31.78 
 
 		 550 aa  258  2e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  30.99 
 
 		 546 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  30.99 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  30.99 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  30.99 
 
 		 546 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  30.8 
 
 		 546 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 500 aa  251  3e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 500 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 500 aa  249  8e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.62 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  30.5 
 
 		 548 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  30.5 
 
 		 548 aa  246  4.9999999999999997e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  29.89 
 
 		 566 aa  246  8e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  29.89 
 
 		 566 aa  246  8e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  30.1 
 
 		 546 aa  244  3e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  30.43 
 
 		 548 aa  242  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.27 
 
 		 1004 aa  242  1e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 		 498 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 540 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 541 aa  233  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 517 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.21 
 
 		 538 aa  218  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.82 
 
 		 538 aa  215  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.16 
 
 		 538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.82 
 
 		 538 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.63 
 
 		 538 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.63 
 
 		 538 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.24 
 
 		 538 aa  209  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.24 
 
 		 538 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.42 
 
 		 538 aa  208  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  29.27 
 
 		 576 aa  205  1e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 526 aa  206  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4331  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 550 aa  204  4e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  30.47 
 
 		 560 aa  203  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  30.91 
 
 		 630 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 524 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  27.7 
 
 		 547 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 503 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.02 
 
 		 540 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  30.29 
 
 		 548 aa  200  6e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4137  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 554 aa  200  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  32.53 
 
 		 549 aa  199  9e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  26.27 
 
 		 518 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 531 aa  199  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  28.68 
 
 		 544 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.58 
 
 		 538 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  30.42 
 
 		 539 aa  196  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2691  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 557 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382921  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 512 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  26.48 
 
 		 558 aa  194  5e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3850  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 550 aa  193  5e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605707  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 542 aa  193  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 550 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3615  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 555 aa  192  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  29.27 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  29.27 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  29.27 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  29.23 
 
 		 587 aa  192  2e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  29.27 
 
 		 576 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  29.27 
 
 		 570 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3476  peptide arylation protein  33.66 
 
 		 542 aa  191  2.9999999999999997e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00809458  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  29.27 
 
 		 576 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  29.36 
 
 		 576 aa  191  4e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12409  bifunctional enzyme mbtA: salicyl-AMP ligase + salicyl-S-arcp synthetase  32.05 
 
 		 565 aa  190  5e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165843  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  29.46 
 
 		 571 aa  189  9e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  28.14 
 
 		 552 aa  189  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  28.65 
 
 		 570 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  29.63 
 
 		 538 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  29.41 
 
 		 544 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.02 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.02 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.02 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  30.02 
 
 		 538 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  29.77 
 
 		 1043 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  30 
 
 		 564 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  26.75 
 
 		 549 aa  187  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  28.27 
 
 		 575 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  28.27 
 
 		 575 aa  187  5e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  27.58 
 
 		 513 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 545 aa  186  7e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>