More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12409 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2691  AMP-dependent synthetase and ligase  65.06 
 
 
557 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382921  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3471  AMP-dependent synthetase and ligase  66.73 
 
 
549 aa  704    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12409  bifunctional enzyme mbtA: salicyl-AMP ligase + salicyl-S-arcp synthetase  100 
 
 
565 aa  1125    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165843  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3482  AMP-dependent synthetase and ligase  66.73 
 
 
549 aa  705    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753738  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3534  AMP-dependent synthetase and ligase  66.73 
 
 
549 aa  704    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3850  AMP-dependent synthetase and ligase  63.57 
 
 
550 aa  674    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605707  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  51.58 
 
 
524 aa  508  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5941  AMP-dependent synthetase and ligase  50.18 
 
 
578 aa  507  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0214212  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0620  AMP-dependent synthetase and ligase  50.45 
 
 
562 aa  493  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.79 
 
 
538 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.92 
 
 
538 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  47.87 
 
 
543 aa  486  1e-136  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.36 
 
 
538 aa  485  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.79 
 
 
538 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.55 
 
 
538 aa  484  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.74 
 
 
538 aa  483  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.74 
 
 
538 aa  482  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  48.41 
 
 
548 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.92 
 
 
538 aa  483  1e-135  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.74 
 
 
538 aa  482  1e-135  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.17 
 
 
538 aa  481  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.66 
 
 
540 aa  480  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4331  AMP-dependent synthetase and ligase  50.66 
 
 
550 aa  475  1e-133  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  48.04 
 
 
542 aa  473  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  51.5 
 
 
566 aa  475  1e-132  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  48.78 
 
 
552 aa  470  1.0000000000000001e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  47.4 
 
 
994 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  49.32 
 
 
973 aa  455  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3615  AMP-dependent synthetase and ligase  45.77 
 
 
555 aa  452  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2676  AMP-dependent synthetase and ligase  45.92 
 
 
991 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  48.3 
 
 
550 aa  454  1.0000000000000001e-126  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3774  (2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate synthase  49.91 
 
 
537 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2803  AMP-dependent synthetase and ligase  47.49 
 
 
532 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0301  vibriobactin-specific 2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.04 
 
 
543 aa  443  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20860  peptide arylation enzyme  47.42 
 
 
551 aa  445  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651422  normal  0.0115329 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1028  AMP-dependent synthetase and ligase  47.72 
 
 
548 aa  436  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  hitchhiker  0.00107261 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2597  yersiniabactin synthetase, salycilate ligase component  50 
 
 
522 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3399  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.2 
 
 
563 aa  430  1e-119  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795488  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01399  hypothetical protein  41.65 
 
 
539 aa  421  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1689  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.22 
 
 
538 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4516  AMP-dependent synthetase and ligase  44.98 
 
 
517 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385599  normal  0.236512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0872  pyochelin biosynthesis protein PchD  46.1 
 
 
547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.453067  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1751  AMP-dependent synthetase and ligase  45.71 
 
 
538 aa  408  1.0000000000000001e-112  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.748681  normal  0.0123673 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  45.25 
 
 
555 aa  407  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.63836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2726  AMP-dependent synthetase and ligase  45.59 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09240  pyochelin biosynthesis protein PchD  45.52 
 
 
547 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.248611  normal  0.861718 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  41.9 
 
 
557 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  45.86 
 
 
550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  45.86 
 
 
550 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2094  yersiniabactin synthetase, YbtE component  45.33 
 
 
525 aa  409  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  46 
 
 
558 aa  405  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.409597  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0670  AMP-dependent synthetase and ligase  46.49 
 
 
550 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168981  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3367  AMP-dependent synthetase and ligase  45.68 
 
 
550 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  45.04 
 
 
638 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2148  salicyl-AMP ligase  45.44 
 
 
687 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0537387  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1338  AMP-dependent synthetase and ligase  42.19 
 
 
556 aa  396  1e-109  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0784  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.44 
 
 
547 aa  398  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3008  AMP-dependent synthetase and ligase  43.15 
 
 
555 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0874  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.87 
 
 
547 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3967  AMP-dependent synthetase and ligase  42.48 
 
 
539 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3420  enterobactin synthase subunit E  41.26 
 
 
542 aa  385  1e-106  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00195409  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0708  enterobactin synthase subunit E  41.37 
 
 
536 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0635  enterobactin synthase subunit E  41.37 
 
 
536 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63158  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0649  enterobactin synthase subunit E  41.37 
 
 
536 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199158  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0754  enterobactin synthase subunit E  41.19 
 
 
536 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1317  enterobactin synthase subunit E  43.02 
 
 
542 aa  385  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0337644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0463  enterobactin synthase subunit E  40.71 
 
 
547 aa  382  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0012  enterobactin synthase subunit E  41.14 
 
 
582 aa  379  1e-104  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0561  enterobactin synthase subunit E  41.31 
 
 
542 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3074  enterobactin synthase subunit E  40.78 
 
 
536 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0692  enterobactin synthase subunit E  41 
 
 
536 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0785305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2426  AMP-dependent synthetase and ligase  42.16 
 
 
525 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0015  enterobactin synthase subunit E  40.74 
 
 
539 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0496  enterobactin synthase subunit E  39.89 
 
 
536 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4034  AMP-dependent synthetase and ligase  37.95 
 
 
552 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00561  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase component of enterobactin synthase multienzyme complex  39.85 
 
 
536 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3032  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  39.85 
 
 
536 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0645  enterobactin synthase subunit E  39.85 
 
 
536 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0614  enterobactin synthase subunit E  39.93 
 
 
536 aa  372  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3050  enterobactin synthase subunit E  39.85 
 
 
536 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0679  enterobactin synthase subunit E  39.7 
 
 
536 aa  372  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.137603  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0614  enterobactin synthase subunit E  39.85 
 
 
536 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00550  hypothetical protein  39.85 
 
 
536 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1632  enterobactin synthase subunit E  39.32 
 
 
535 aa  367  1e-100  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233088  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1489  enterobactin synthase subunit E  41.45 
 
 
542 aa  369  1e-100  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 
528 aa  363  5.0000000000000005e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2386  enterobactin synthase subunit E  41.87 
 
 
540 aa  360  4e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444904  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1126  enterobactin synthase subunit E  39.44 
 
 
536 aa  357  3.9999999999999996e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0643  AMP-dependent synthetase and ligase  41.1 
 
 
640 aa  355  1e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.597894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 
541 aa  339  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3777  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.57 
 
 
567 aa  252  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 
517 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3103  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 
572 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.970442  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.95 
 
 
543 aa  237  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 
541 aa  233  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.48 
 
 
546 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  32.29 
 
 
546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  32.29 
 
 
546 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  32.29 
 
 
546 aa  222  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  32.29 
 
 
546 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.191096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>