More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3967 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3967  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 539 aa  1094    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  57.03 
 
 		 528 aa  600  1e-170  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2676  AMP-dependent synthetase and ligase  48.62 
 
 		 991 aa  509  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.77 
 
 		 540 aa  472  1e-132  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.58 
 
 		 538 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.38 
 
 		 538 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.58 
 
 		 538 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.19 
 
 		 538 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.19 
 
 		 538 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.81 
 
 		 538 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.91 
 
 		 538 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.19 
 
 		 538 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.81 
 
 		 538 aa  452  1e-125  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.62 
 
 		 538 aa  449  1e-125  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  45.6 
 
 		 994 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2094  yersiniabactin synthetase, YbtE component  45.81 
 
 		 525 aa  445  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  45.74 
 
 		 973 aa  443  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  45.09 
 
 		 542 aa  436  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  44.66 
 
 		 552 aa  433  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 		 550 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0670  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 		 550 aa  420  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168981  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  42.88 
 
 		 550 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  45.49 
 
 		 524 aa  421  1e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3615  AMP-dependent synthetase and ligase  41.27 
 
 		 555 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0872  pyochelin biosynthesis protein PchD  44.81 
 
 		 547 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.453067  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3367  AMP-dependent synthetase and ligase  42.69 
 
 		 550 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  42 
 
 		 543 aa  413  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3774  (2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate synthase  44.79 
 
 		 537 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09240  pyochelin biosynthesis protein PchD  44.16 
 
 		 547 aa  415  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.248611  normal  0.861718 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0620  AMP-dependent synthetase and ligase  42.94 
 
 		 562 aa  412  1e-113  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  42.3 
 
 		 638 aa  411  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5941  AMP-dependent synthetase and ligase  42.39 
 
 		 578 aa  411  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0214212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2148  salicyl-AMP ligase  41.6 
 
 		 687 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0537387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0784  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  41.6 
 
 		 547 aa  405  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4331  AMP-dependent synthetase and ligase  42.66 
 
 		 550 aa  403  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0874  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  41.85 
 
 		 547 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  42.22 
 
 		 548 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2803  AMP-dependent synthetase and ligase  41.93 
 
 		 532 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  43.39 
 
 		 566 aa  394  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2597  yersiniabactin synthetase, salycilate ligase component  43.44 
 
 		 522 aa  389  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12409  bifunctional enzyme mbtA: salicyl-AMP ligase + salicyl-S-arcp synthetase  42.48 
 
 		 565 aa  391  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3399  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  42.27 
 
 		 563 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795488  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1338  AMP-dependent synthetase and ligase  41.06 
 
 		 556 aa  389  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0301  vibriobactin-specific 2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  41.52 
 
 		 543 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  41.06 
 
 		 550 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20860  peptide arylation enzyme  41.13 
 
 		 551 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651422  normal  0.0115329 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4516  AMP-dependent synthetase and ligase  42.63 
 
 		 517 aa  380  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385599  normal  0.236512 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1689  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  41.45 
 
 		 538 aa  381  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3008  AMP-dependent synthetase and ligase  40.11 
 
 		 555 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3850  AMP-dependent synthetase and ligase  38.58 
 
 		 550 aa  373  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605707  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2426  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 525 aa  370  1e-101  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0012  enterobactin synthase subunit E  39.3 
 
 		 582 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0015  enterobactin synthase subunit E  39.11 
 
 		 539 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01399  hypothetical protein  40.08 
 
 		 539 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1028  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 		 548 aa  367  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  hitchhiker  0.00107261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  41.52 
 
 		 558 aa  369  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.409597  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3471  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3482  AMP-dependent synthetase and ligase  38.71 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753738  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3534  AMP-dependent synthetase and ligase  38.42 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  39.62 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.63836 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1632  enterobactin synthase subunit E  38.14 
 
 		 535 aa  355  8.999999999999999e-97  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2726  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 		 558 aa  355  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1317  enterobactin synthase subunit E  38.37 
 
 		 542 aa  354  2e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0337644  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4034  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 		 552 aa  353  4e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1489  enterobactin synthase subunit E  37.91 
 
 		 542 aa  349  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 557 aa  348  1e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1751  AMP-dependent synthetase and ligase  39.17 
 
 		 538 aa  347  4e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.748681  normal  0.0123673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2691  AMP-dependent synthetase and ligase  37.55 
 
 		 557 aa  347  5e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382921  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0561  enterobactin synthase subunit E  38.7 
 
 		 542 aa  344  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3420  enterobactin synthase subunit E  38.33 
 
 		 542 aa  342  7e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00195409  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3032  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  37.33 
 
 		 536 aa  342  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14201  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0614  enterobactin synthase subunit E  37.52 
 
 		 536 aa  342  1e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0645  enterobactin synthase subunit E  37.33 
 
 		 536 aa  342  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3050  enterobactin synthase subunit E  37.33 
 
 		 536 aa  342  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0463  enterobactin synthase subunit E  38.11 
 
 		 547 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00561  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase component of enterobactin synthase multienzyme complex  37.52 
 
 		 536 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0614  enterobactin synthase subunit E  37.52 
 
 		 536 aa  340  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00550  hypothetical protein  37.52 
 
 		 536 aa  340  4e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3074  enterobactin synthase subunit E  37.05 
 
 		 536 aa  340  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0679  enterobactin synthase subunit E  37.13 
 
 		 536 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.137603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1126  enterobactin synthase subunit E  37.02 
 
 		 536 aa  335  2e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0496  enterobactin synthase subunit E  37.01 
 
 		 536 aa  333  6e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0649  enterobactin synthase subunit E  36.92 
 
 		 536 aa  333  7.000000000000001e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2386  enterobactin synthase subunit E  37.36 
 
 		 540 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0635  enterobactin synthase subunit E  36.92 
 
 		 536 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0708  enterobactin synthase subunit E  36.92 
 
 		 536 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0754  enterobactin synthase subunit E  36.73 
 
 		 536 aa  331  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 541 aa  330  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0692  enterobactin synthase subunit E  36.54 
 
 		 536 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0785305 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0643  AMP-dependent synthetase and ligase  37.81 
 
 		 640 aa  325  1e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.597894  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4125  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 556 aa  247  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.41897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3103  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 572 aa  231  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.970442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4900  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 		 561 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.36 
 
 		 518 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 517 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.9 
 
 		 513 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.7 
 
 		 547 aa  204  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5484  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 565 aa  203  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 541 aa  203  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>