More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4900 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B5484  AMP-dependent synthetase and ligase  63.31 
 
 
565 aa  717    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4900  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
561 aa  1150    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4125  AMP-dependent synthetase and ligase  59.71 
 
 
556 aa  664    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.41897  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3103  AMP-dependent synthetase and ligase  40.07 
 
 
572 aa  395  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.970442  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3777  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  37.16 
 
 
567 aa  350  5e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  39.06 
 
 
524 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  35.05 
 
 
540 aa  293  8e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 
557 aa  291  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  35.73 
 
 
543 aa  286  5e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  35.3 
 
 
538 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.94 
 
 
538 aa  286  7e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.63 
 
 
538 aa  286  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.94 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.94 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.94 
 
 
538 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.94 
 
 
538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  35.24 
 
 
542 aa  284  3.0000000000000004e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 
973 aa  284  3.0000000000000004e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4034  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 
552 aa  283  6.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.57 
 
 
538 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0872  pyochelin biosynthesis protein PchD  37.55 
 
 
547 aa  281  3e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.453067  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  36.04 
 
 
552 aa  280  7e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.38 
 
 
538 aa  280  7e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.57 
 
 
538 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
550 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09240  pyochelin biosynthesis protein PchD  36.57 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.248611  normal  0.861718 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 
550 aa  273  7e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0670  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 
550 aa  272  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168981  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3367  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
550 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  36.04 
 
 
638 aa  269  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20860  peptide arylation enzyme  34.98 
 
 
551 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651422  normal  0.0115329 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 
541 aa  266  8.999999999999999e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0614  enterobactin synthase subunit E  33.58 
 
 
536 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3008  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 
555 aa  265  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0614  enterobactin synthase subunit E  33.64 
 
 
536 aa  265  2e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00561  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase component of enterobactin synthase multienzyme complex  33.64 
 
 
536 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0649  enterobactin synthase subunit E  33.89 
 
 
536 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199158  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0679  enterobactin synthase subunit E  34 
 
 
536 aa  264  3e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.137603  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00550  hypothetical protein  33.64 
 
 
536 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3032  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.46 
 
 
536 aa  264  4e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0645  enterobactin synthase subunit E  33.46 
 
 
536 aa  264  4e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0874  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  35.48 
 
 
547 aa  264  4e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3050  enterobactin synthase subunit E  33.46 
 
 
536 aa  264  4e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0708  enterobactin synthase subunit E  33.89 
 
 
536 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0635  enterobactin synthase subunit E  33.89 
 
 
536 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63158  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0754  enterobactin synthase subunit E  33.89 
 
 
536 aa  263  6e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3420  enterobactin synthase subunit E  35.16 
 
 
542 aa  263  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00195409  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0301  vibriobactin-specific 2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.84 
 
 
543 aa  261  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0784  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  35.1 
 
 
547 aa  261  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2676  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 
991 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2148  salicyl-AMP ligase  35.1 
 
 
687 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0537387  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3399  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.86 
 
 
563 aa  259  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795488  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0496  enterobactin synthase subunit E  33.21 
 
 
536 aa  259  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2726  AMP-dependent synthetase and ligase  35.13 
 
 
558 aa  257  3e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  32.58 
 
 
994 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1689  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.55 
 
 
538 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0692  enterobactin synthase subunit E  33.52 
 
 
536 aa  256  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0785305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  34.19 
 
 
548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
566 aa  255  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01399  hypothetical protein  35.27 
 
 
539 aa  253  7e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 
532 aa  253  8.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2094  yersiniabactin synthetase, YbtE component  33.59 
 
 
525 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1126  enterobactin synthase subunit E  33.64 
 
 
536 aa  246  6e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3774  (2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate synthase  35.21 
 
 
537 aa  246  6.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 
550 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3615  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
555 aa  242  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3850  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 
550 aa  241  2e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605707  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1028  AMP-dependent synthetase and ligase  34.93 
 
 
548 aa  241  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  hitchhiker  0.00107261 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0561  enterobactin synthase subunit E  32.9 
 
 
542 aa  239  8e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1317  enterobactin synthase subunit E  33.76 
 
 
542 aa  239  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0337644  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0463  enterobactin synthase subunit E  32.78 
 
 
547 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1489  enterobactin synthase subunit E  33.58 
 
 
542 aa  236  7e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0643  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 
640 aa  236  7e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.597894  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 
558 aa  236  8e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.409597  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1338  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 
556 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  28.68 
 
 
546 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0015  enterobactin synthase subunit E  32.4 
 
 
539 aa  233  6e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  28.68 
 
 
546 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  28.68 
 
 
546 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2691  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 
557 aa  231  3e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382921  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  28.49 
 
 
546 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1751  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
538 aa  230  5e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.748681  normal  0.0123673 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0012  enterobactin synthase subunit E  32.16 
 
 
582 aa  229  9e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3471  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 
549 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3534  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 
549 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  28.13 
 
 
546 aa  228  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5941  AMP-dependent synthetase and ligase  31.82 
 
 
578 aa  227  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0214212  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3482  AMP-dependent synthetase and ligase  32.05 
 
 
549 aa  226  8e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753738  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3074  enterobactin synthase subunit E  31.73 
 
 
536 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  30.39 
 
 
555 aa  225  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2386  enterobactin synthase subunit E  32.54 
 
 
540 aa  224  4.9999999999999996e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444904  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0620  AMP-dependent synthetase and ligase  30.76 
 
 
562 aa  217  5e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3967  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 
539 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4331  AMP-dependent synthetase and ligase  32.22 
 
 
550 aa  215  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4516  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 
517 aa  213  7e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385599  normal  0.236512 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  28.49 
 
 
548 aa  212  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2597  yersiniabactin synthetase, salycilate ligase component  32.58 
 
 
522 aa  210  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  28.49 
 
 
566 aa  210  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  28.49 
 
 
566 aa  210  7e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  27.41 
 
 
528 aa  209  9e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>