More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A1462 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  82.66 
 
 		 566 aa  931    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  82.84 
 
 		 548 aa  936    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  82.66 
 
 		 566 aa  931    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  99.82 
 
 		 546 aa  1130    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  83.21 
 
 		 548 aa  937    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  82.99 
 
 		 546 aa  936    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  82.29 
 
 		 548 aa  925    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  99.82 
 
 		 546 aa  1130    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  99.27 
 
 		 546 aa  1125    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  83.39 
 
 		 548 aa  941    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  71.9 
 
 		 555 aa  833    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 546 aa  1133    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  99.45 
 
 		 546 aa  1127    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  42.28 
 
 		 543 aa  457  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  40.93 
 
 		 550 aa  422  1e-117  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  40.37 
 
 		 549 aa  416  9.999999999999999e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  39.14 
 
 		 547 aa  363  4e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  38.27 
 
 		 546 aa  360  3e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  39.78 
 
 		 552 aa  356  5e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.65 
 
 		 549 aa  350  3e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  38.96 
 
 		 550 aa  350  3e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.78 
 
 		 539 aa  348  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  38.48 
 
 		 534 aa  347  3e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  36.97 
 
 		 541 aa  344  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.95 
 
 		 547 aa  344  2.9999999999999997e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.4 
 
 		 547 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.13 
 
 		 547 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.86 
 
 		 549 aa  334  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.51 
 
 		 547 aa  333  5e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.07 
 
 		 543 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  37.43 
 
 		 1004 aa  324  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  36.27 
 
 		 518 aa  318  2e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 540 aa  310  2.9999999999999997e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 503 aa  300  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  34.38 
 
 		 574 aa  296  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  35.26 
 
 		 543 aa  292  1e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 550 aa  291  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 558 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 498 aa  290  4e-77  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 630 aa  289  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 500 aa  286  7e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 541 aa  283  5.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 552 aa  283  6.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  36.92 
 
 		 549 aa  282  9e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  32.91 
 
 		 579 aa  282  9e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 539 aa  282  1e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 		 513 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 542 aa  279  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 544 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  35.29 
 
 		 552 aa  276  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  34.62 
 
 		 570 aa  276  6e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  34.85 
 
 		 575 aa  274  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  35.09 
 
 		 576 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 553 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 562 aa  273  5.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  33.15 
 
 		 557 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  35.28 
 
 		 547 aa  272  1e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  33.83 
 
 		 539 aa  272  1e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  34.24 
 
 		 552 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  34.25 
 
 		 575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 		 550 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  32.66 
 
 		 562 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.52 
 
 		 513 aa  270  4e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.23 
 
 		 549 aa  270  4e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.25 
 
 		 530 aa  270  5.9999999999999995e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  34.36 
 
 		 552 aa  270  7e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  33.52 
 
 		 575 aa  270  7e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.56 
 
 		 520 aa  269  8e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 		 540 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  33.64 
 
 		 560 aa  269  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  32.72 
 
 		 557 aa  269  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  34.06 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.16 
 
 		 519 aa  268  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  34.73 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  34.73 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  34.29 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  33.45 
 
 		 576 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  33.45 
 
 		 576 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  34.06 
 
 		 576 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  34.47 
 
 		 662 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  32.59 
 
 		 557 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 		 540 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 566 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  33.51 
 
 		 570 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  33.14 
 
 		 540 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  33.45 
 
 		 576 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  33.64 
 
 		 576 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  33.45 
 
 		 570 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 549 aa  267  5e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  33.99 
 
 		 549 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 549 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 570 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 512 aa  266  5.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 542 aa  266  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  33.45 
 
 		 576 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  33.03 
 
 		 576 aa  266  1e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>