More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1871 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  64.1 
 
 		 552 aa  652    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  61.88 
 
 		 538 aa  697    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  61.51 
 
 		 538 aa  698    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  61.33 
 
 		 538 aa  696    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  61.69 
 
 		 538 aa  693    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  100 
 
 		 543 aa  1092    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  60.96 
 
 		 538 aa  691    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  61.51 
 
 		 538 aa  698    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  62.55 
 
 		 540 aa  697    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  63.31 
 
 		 548 aa  680    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  60.66 
 
 		 538 aa  688    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  61.33 
 
 		 538 aa  695    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  61.14 
 
 		 538 aa  691    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  61.69 
 
 		 538 aa  699    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  61.39 
 
 		 524 aa  625  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  59.44 
 
 		 542 aa  625  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20860  peptide arylation enzyme  60.45 
 
 		 551 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651422  normal  0.0115329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1689  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  58.32 
 
 		 538 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2275  AMP-dependent synthetase and ligase  57.65 
 
 		 550 aa  596  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2726  AMP-dependent synthetase and ligase  58.61 
 
 		 558 aa  573  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  57.79 
 
 		 550 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  57.89 
 
 		 550 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  57.14 
 
 		 638 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  59.37 
 
 		 558 aa  566  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.409597  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0301  vibriobactin-specific 2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  52.42 
 
 		 543 aa  565  1e-160  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3367  AMP-dependent synthetase and ligase  57.6 
 
 		 550 aa  566  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0670  AMP-dependent synthetase and ligase  57.33 
 
 		 550 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0874  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  57.47 
 
 		 547 aa  554  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2148  salicyl-AMP ligase  57.36 
 
 		 687 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0537387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0784  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  57.47 
 
 		 547 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01399  hypothetical protein  53 
 
 		 539 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5941  AMP-dependent synthetase and ligase  51.65 
 
 		 578 aa  545  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0214212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3774  (2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate synthase  54.28 
 
 		 537 aa  538  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3399  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  50.64 
 
 		 563 aa  535  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.795488  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4516  AMP-dependent synthetase and ligase  54.51 
 
 		 517 aa  537  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.385599  normal  0.236512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0872  pyochelin biosynthesis protein PchD  54.53 
 
 		 547 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.453067  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09240  pyochelin biosynthesis protein PchD  53.5 
 
 		 547 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.248611  normal  0.861718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  53.86 
 
 		 566 aa  528  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2803  AMP-dependent synthetase and ligase  52.8 
 
 		 532 aa  524  1e-147  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3615  AMP-dependent synthetase and ligase  50.28 
 
 		 555 aa  514  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2426  AMP-dependent synthetase and ligase  51.5 
 
 		 525 aa  508  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  49.62 
 
 		 994 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  54.24 
 
 		 973 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0012  enterobactin synthase subunit E  51.51 
 
 		 582 aa  503  1e-141  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1632  enterobactin synthase subunit E  48.1 
 
 		 535 aa  503  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.233088  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0463  enterobactin synthase subunit E  48.32 
 
 		 547 aa  502  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1028  AMP-dependent synthetase and ligase  54.06 
 
 		 548 aa  504  1e-141  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  hitchhiker  0.00107261 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3008  AMP-dependent synthetase and ligase  50.75 
 
 		 555 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0015  enterobactin synthase subunit E  51.32 
 
 		 539 aa  499  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3074  enterobactin synthase subunit E  49.34 
 
 		 536 aa  501  1e-140  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1751  AMP-dependent synthetase and ligase  48.99 
 
 		 538 aa  500  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.748681  normal  0.0123673 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2676  AMP-dependent synthetase and ligase  48.22 
 
 		 991 aa  492  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0561  enterobactin synthase subunit E  48.88 
 
 		 542 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00561  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase component of enterobactin synthase multienzyme complex  47.78 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3032  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  47.84 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.14201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0645  enterobactin synthase subunit E  47.84 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0614  enterobactin synthase subunit E  47.78 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0614  enterobactin synthase subunit E  47.84 
 
 		 536 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0679  enterobactin synthase subunit E  47.57 
 
 		 536 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.137603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3050  enterobactin synthase subunit E  47.84 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00550  hypothetical protein  47.78 
 
 		 536 aa  489  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0496  enterobactin synthase subunit E  47.87 
 
 		 536 aa  487  1e-136  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12409  bifunctional enzyme mbtA: salicyl-AMP ligase + salicyl-S-arcp synthetase  47.87 
 
 		 565 aa  480  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.165843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2386  enterobactin synthase subunit E  48.9 
 
 		 540 aa  481  1e-134  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3420  enterobactin synthase subunit E  47.55 
 
 		 542 aa  479  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00195409  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0649  enterobactin synthase subunit E  47.77 
 
 		 536 aa  475  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199158  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1489  enterobactin synthase subunit E  48.7 
 
 		 542 aa  474  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0951931  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0754  enterobactin synthase subunit E  47.77 
 
 		 536 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0635  enterobactin synthase subunit E  47.77 
 
 		 536 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.63158  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0708  enterobactin synthase subunit E  47.77 
 
 		 536 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  48.45 
 
 		 555 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.63836 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0692  enterobactin synthase subunit E  47.4 
 
 		 536 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0785305 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1317  enterobactin synthase subunit E  48.15 
 
 		 542 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0337644  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0620  AMP-dependent synthetase and ligase  49.26 
 
 		 562 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1126  enterobactin synthase subunit E  47.03 
 
 		 536 aa  466  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1338  AMP-dependent synthetase and ligase  47.3 
 
 		 556 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0643  AMP-dependent synthetase and ligase  49.45 
 
 		 640 aa  465  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.597894  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4034  AMP-dependent synthetase and ligase  45.11 
 
 		 552 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2094  yersiniabactin synthetase, YbtE component  50.1 
 
 		 525 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3482  AMP-dependent synthetase and ligase  46.48 
 
 		 549 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.753738  normal  0.317812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  46.58 
 
 		 541 aa  446  1.0000000000000001e-124  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3471  AMP-dependent synthetase and ligase  46.57 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.164344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  44.01 
 
 		 557 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3534  AMP-dependent synthetase and ligase  46.57 
 
 		 549 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.820035 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3850  AMP-dependent synthetase and ligase  45.22 
 
 		 550 aa  444  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605707  normal  0.319664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2597  yersiniabactin synthetase, salycilate ligase component  48.12 
 
 		 522 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2691  AMP-dependent synthetase and ligase  45.44 
 
 		 557 aa  435  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382921  normal  0.272175 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4331  AMP-dependent synthetase and ligase  47.01 
 
 		 550 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  39.57 
 
 		 528 aa  402  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3967  AMP-dependent synthetase and ligase  42 
 
 		 539 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3103  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 		 572 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.970442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4900  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 561 aa  286  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3777  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  36.19 
 
 		 567 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4125  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 556 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.41897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5484  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 		 565 aa  257  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.96 
 
 		 546 aa  257  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  34.69 
 
 		 555 aa  257  5e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 552 aa  246  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  34.01 
 
 		 546 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  31.97 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>