More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2396 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
552 aa  1143    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.51 
 
 
543 aa  297  4e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  34.09 
 
 
555 aa  293  6e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  32.9 
 
 
546 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  32.9 
 
 
546 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  32.9 
 
 
546 aa  283  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  32.54 
 
 
546 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  32.72 
 
 
546 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.14 
 
 
539 aa  280  3e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
541 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  32.58 
 
 
548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.56 
 
 
552 aa  273  6e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  32.4 
 
 
548 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  32.4 
 
 
548 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
542 aa  269  8e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
548 aa  269  8.999999999999999e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  32.18 
 
 
566 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  32.18 
 
 
566 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  32.16 
 
 
546 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.83 
 
 
550 aa  267  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 
557 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.65 
 
 
538 aa  264  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.71 
 
 
538 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 
524 aa  262  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.27 
 
 
538 aa  261  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
525 aa  260  4e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 
520 aa  259  6e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.1 
 
 
549 aa  259  7e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.41 
 
 
546 aa  258  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.65 
 
 
538 aa  258  3e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.9 
 
 
538 aa  258  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.53 
 
 
547 aa  257  4e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  32.75 
 
 
544 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
517 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.81 
 
 
549 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.46 
 
 
538 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  32.34 
 
 
638 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  31.91 
 
 
547 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.21 
 
 
538 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.46 
 
 
538 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.46 
 
 
538 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  31.74 
 
 
549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 
554 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.75 
 
 
553 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  31.55 
 
 
549 aa  252  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 
541 aa  251  2e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.71 
 
 
538 aa  251  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.2 
 
 
540 aa  250  6e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.24 
 
 
547 aa  249  9e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  31.41 
 
 
550 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  31.67 
 
 
549 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.27 
 
 
547 aa  246  6e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  31.66 
 
 
560 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.02 
 
 
543 aa  246  9e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  31.48 
 
 
549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  31.48 
 
 
549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 
534 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.25 
 
 
518 aa  244  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.15 
 
 
547 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5941  AMP-dependent synthetase and ligase  30.65 
 
 
578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0214212  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.63 
 
 
547 aa  244  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01399  hypothetical protein  31.27 
 
 
539 aa  243  6e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
550 aa  243  7e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  31.04 
 
 
552 aa  242  1e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
630 aa  243  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  31.28 
 
 
550 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0670  AMP-dependent synthetase and ligase  31.05 
 
 
550 aa  240  5.999999999999999e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168981  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  31.56 
 
 
548 aa  240  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 
552 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.92 
 
 
542 aa  239  9e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0874  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.75 
 
 
547 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
561 aa  239  1e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  30.55 
 
 
550 aa  239  1e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3367  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 
550 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0784  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.75 
 
 
547 aa  237  4e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  30.92 
 
 
546 aa  236  7e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  31.31 
 
 
546 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2148  salicyl-AMP ligase  31.75 
 
 
687 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0537387  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.26 
 
 
532 aa  235  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09240  pyochelin biosynthesis protein PchD  32.7 
 
 
547 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.248611  normal  0.861718 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 
973 aa  234  2.0000000000000002e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  31.12 
 
 
546 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  27.94 
 
 
543 aa  234  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 
511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  30.24 
 
 
549 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0872  pyochelin biosynthesis protein PchD  32.39 
 
 
547 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.453067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 
843 aa  233  5e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  31.62 
 
 
574 aa  232  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  31.3 
 
 
578 aa  232  2e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  27.72 
 
 
550 aa  231  2e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  31.65 
 
 
552 aa  231  2e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  29.24 
 
 
549 aa  231  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  31.17 
 
 
552 aa  231  3e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
566 aa  231  4e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  31.42 
 
 
570 aa  230  4e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  30.29 
 
 
548 aa  230  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  30.23 
 
 
994 aa  229  7e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  28.68 
 
 
1043 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 
558 aa  229  9e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 
555 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.64241 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>