More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5256 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  100 
 
 		 549 aa  1128    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  56.8 
 
 		 546 aa  634  1e-180  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  52.03 
 
 		 547 aa  565  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  51.98 
 
 		 547 aa  548  1e-154  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  51.85 
 
 		 547 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  51.32 
 
 		 550 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  51.9 
 
 		 547 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  50.93 
 
 		 547 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  51.13 
 
 		 549 aa  527  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  50 
 
 		 552 aa  515  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  45.49 
 
 		 543 aa  457  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  47.61 
 
 		 539 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  43.87 
 
 		 1004 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  44.15 
 
 		 534 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  41.05 
 
 		 541 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  36.65 
 
 		 546 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  36.65 
 
 		 546 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  36.65 
 
 		 546 aa  350  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  37.05 
 
 		 555 aa  348  1e-94  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  36.47 
 
 		 546 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  36.28 
 
 		 546 aa  348  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  36.67 
 
 		 548 aa  336  7e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  36.48 
 
 		 548 aa  333  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  36.67 
 
 		 566 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  36.67 
 
 		 566 aa  332  8e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  36.29 
 
 		 546 aa  332  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 548 aa  331  2e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  36.48 
 
 		 548 aa  329  8e-89  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  34.31 
 
 		 550 aa  301  2e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  33.82 
 
 		 543 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 540 aa  293  4e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  35.86 
 
 		 517 aa  290  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 534 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  32.6 
 
 		 549 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 		 542 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 500 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 500 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 500 aa  273  8.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 		 498 aa  267  4e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 630 aa  266  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  34.27 
 
 		 518 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  33.98 
 
 		 552 aa  264  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  31.23 
 
 		 553 aa  264  3e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  35.79 
 
 		 546 aa  262  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.55 
 
 		 518 aa  262  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  34.46 
 
 		 543 aa  259  7e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 552 aa  259  7e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  34.78 
 
 		 549 aa  254  3e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 520 aa  253  5.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 549 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  34.52 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2984  AMP-binding domain protein  34.6 
 
 		 546 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.136347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 512 aa  250  5e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 560 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 		 560 aa  249  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  34.39 
 
 		 546 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  31.04 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  34.65 
 
 		 564 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  31.04 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  31.04 
 
 		 570 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.78 
 
 		 552 aa  248  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  31.13 
 
 		 547 aa  248  2e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  31.68 
 
 		 587 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  31.38 
 
 		 596 aa  248  2e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 552 aa  247  3e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 		 567 aa  247  4.9999999999999997e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  30.86 
 
 		 570 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  33.01 
 
 		 560 aa  246  6e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  30.91 
 
 		 550 aa  246  6e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  33.73 
 
 		 576 aa  246  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  32.55 
 
 		 552 aa  246  9e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  32.42 
 
 		 568 aa  246  9e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  32.9 
 
 		 576 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  32.9 
 
 		 576 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  32.9 
 
 		 576 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  32.56 
 
 		 560 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  32.9 
 
 		 570 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 551 aa  246  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  32.82 
 
 		 549 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  32.42 
 
 		 560 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  30.69 
 
 		 570 aa  245  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  33.53 
 
 		 576 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  33.53 
 
 		 576 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.07 
 
 		 544 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  32.28 
 
 		 560 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  33.07 
 
 		 576 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 576 aa  243  7e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  30.44 
 
 		 548 aa  243  7.999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  30.62 
 
 		 578 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  34.14 
 
 		 576 aa  242  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 562 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  32.23 
 
 		 549 aa  242  2e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  30.98 
 
 		 570 aa  240  4e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  32.28 
 
 		 533 aa  240  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  30.62 
 
 		 574 aa  240  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  33.01 
 
 		 575 aa  240  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 539 aa  239  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>