More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2400 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
534 aa  1084    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  51.8 
 
 
1004 aa  511  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.4 
 
 
546 aa  432  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  41.38 
 
 
547 aa  402  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  42.4 
 
 
552 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.15 
 
 
549 aa  398  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  42.61 
 
 
547 aa  395  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  41.46 
 
 
543 aa  387  1e-106  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  40.27 
 
 
547 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  41.06 
 
 
547 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  40.38 
 
 
547 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  42.61 
 
 
539 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  40.34 
 
 
549 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  42.2 
 
 
550 aa  368  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  38.84 
 
 
546 aa  353  4e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  38.65 
 
 
546 aa  352  8.999999999999999e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  38.65 
 
 
546 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  38.65 
 
 
546 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  39.17 
 
 
555 aa  352  1e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  38.65 
 
 
546 aa  352  1e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  37.81 
 
 
548 aa  349  6e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  37.74 
 
 
548 aa  349  9e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  38.07 
 
 
546 aa  348  2e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.433242 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  37.43 
 
 
548 aa  347  4e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  37.62 
 
 
548 aa  347  4e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  37.62 
 
 
566 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  37.62 
 
 
566 aa  345  1e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 
517 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
541 aa  289  1e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  34.33 
 
 
549 aa  277  3e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 
540 aa  276  8e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  32.64 
 
 
543 aa  269  7e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
534 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  33.6 
 
 
550 aa  260  4e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 
503 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 
498 aa  250  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 
552 aa  249  7e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.89 
 
 
567 aa  248  3e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 
500 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 
500 aa  247  3e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
500 aa  246  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
630 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.7 
 
 
538 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.75 
 
 
538 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.75 
 
 
538 aa  237  3e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.75 
 
 
538 aa  236  7e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.7 
 
 
538 aa  236  9e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.57 
 
 
538 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 
524 aa  234  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.3 
 
 
538 aa  233  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.3 
 
 
538 aa  233  9e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.89 
 
 
538 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  35.35 
 
 
526 aa  230  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 
542 aa  229  8e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  32.2 
 
 
552 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  32.44 
 
 
538 aa  229  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.71 
 
 
538 aa  229  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  31.38 
 
 
538 aa  228  3e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 
542 aa  224  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
566 aa  224  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.97 
 
 
552 aa  223  4.9999999999999996e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 
512 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  31.09 
 
 
549 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 
552 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.4 
 
 
540 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 
512 aa  219  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1689  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.39 
 
 
538 aa  217  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.79 
 
 
518 aa  217  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  31.12 
 
 
552 aa  216  5.9999999999999996e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  31.11 
 
 
549 aa  216  9e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  32.09 
 
 
547 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09240  pyochelin biosynthesis protein PchD  33.14 
 
 
547 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.248611  normal  0.861718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  30.94 
 
 
539 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 
1043 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20860  peptide arylation enzyme  31.79 
 
 
551 aa  213  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651422  normal  0.0115329 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  29.83 
 
 
540 aa  213  7.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3774  (2,3-dihydroxybenzoyl)adenylate synthase  33.79 
 
 
537 aa  213  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.212838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  28.01 
 
 
566 aa  212  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 
549 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 
503 aa  211  2e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  30.48 
 
 
548 aa  212  2e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4034  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 
552 aa  212  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  30.5 
 
 
544 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 
520 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.08 
 
 
525 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  29.46 
 
 
540 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  29.46 
 
 
540 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  31.03 
 
 
549 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0872  pyochelin biosynthesis protein PchD  33.33 
 
 
547 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.453067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.77 
 
 
542 aa  209  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  30.06 
 
 
550 aa  209  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2676  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 
991 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  28.57 
 
 
574 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0670  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 
550 aa  208  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168981  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 
541 aa  208  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
555 aa  208  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.63836 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  30.67 
 
 
543 aa  207  3e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 
550 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 
553 aa  207  4e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 
552 aa  206  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>