More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8740 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 512 aa  1027    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  42.67 
 
 		 541 aa  301  2e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.01 
 
 		 546 aa  281  1e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 497 aa  280  5e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.38 
 
 		 547 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.08 
 
 		 539 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.98 
 
 		 547 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.01 
 
 		 543 aa  269  1e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.73 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.64 
 
 		 547 aa  266  4e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 		 498 aa  264  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  32.76 
 
 		 555 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.29 
 
 		 547 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 503 aa  263  6.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.36 
 
 		 547 aa  258  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.12 
 
 		 549 aa  256  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.62 
 
 		 549 aa  255  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  31.06 
 
 		 546 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  31.06 
 
 		 546 aa  247  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  31.06 
 
 		 546 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  31.06 
 
 		 546 aa  246  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  31.06 
 
 		 546 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  30.3 
 
 		 546 aa  243  5e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 500 aa  243  6e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 500 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 526 aa  239  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  30.15 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  30.15 
 
 		 548 aa  238  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  39.21 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 548 aa  236  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  30.04 
 
 		 566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  30.04 
 
 		 566 aa  236  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.43 
 
 		 552 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  30.04 
 
 		 548 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 527 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 534 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 540 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 534 aa  223  4.9999999999999996e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.06 
 
 		 518 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  32.83 
 
 		 543 aa  219  7.999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 531 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  31.15 
 
 		 549 aa  216  7e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1689  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  34.5 
 
 		 538 aa  211  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.17 
 
 		 1004 aa  209  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  31.13 
 
 		 517 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 524 aa  205  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  31.37 
 
 		 550 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 		 555 aa  201  3e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  35.99 
 
 		 467 aa  199  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  29.47 
 
 		 843 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 513 aa  196  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.14 
 
 		 543 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.82 
 
 		 526 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.31 
 
 		 552 aa  194  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 553 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  34.1 
 
 		 566 aa  194  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  32.31 
 
 		 508 aa  194  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.77 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 542 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  30.44 
 
 		 525 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4256  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 479 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 532 aa  187  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 521 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 544 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 575 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 575 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  31.07 
 
 		 994 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 550 aa  184  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 		 500 aa  184  4.0000000000000006e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  28.12 
 
 		 547 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 533 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  28.65 
 
 		 549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.14 
 
 		 525 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 		 630 aa  183  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0872  pyochelin biosynthesis protein PchD  31.17 
 
 		 547 aa  183  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.453067  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.07 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.02 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  31.13 
 
 		 575 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  31.13 
 
 		 522 aa  181  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  29.25 
 
 		 578 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  30.44 
 
 		 543 aa  181  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  30.78 
 
 		 576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  31.44 
 
 		 564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  29.71 
 
 		 527 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 512 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  26.89 
 
 		 551 aa  181  4e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  32.56 
 
 		 534 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 575 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  29.32 
 
 		 549 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 561 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09240  pyochelin biosynthesis protein PchD  30.89 
 
 		 547 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.248611  normal  0.861718 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.08 
 
 		 514 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  29.15 
 
 		 538 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 509 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 973 aa  179  7e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  28.49 
 
 		 550 aa  180  7e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>