More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4256 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4256  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 479 aa  951    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  85.44 
 
 		 471 aa  792    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3807  AMP-dependent synthetase and ligase  72.2 
 
 		 473 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00941755  normal  0.205802 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3821  AMP-dependent synthetase and ligase  72.41 
 
 		 473 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3895  AMP-dependent synthetase and ligase  72.41 
 
 		 473 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  69.26 
 
 		 467 aa  628  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 		 517 aa  229  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 498 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 516 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0253  putative Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  36.7 
 
 		 519 aa  221  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 552 aa  220  3e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 525 aa  219  6e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  35.96 
 
 		 503 aa  219  1e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2110  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 549 aa  217  4e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 		 522 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 662 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 495 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 585 aa  212  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 553 aa  210  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  31.66 
 
 		 561 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4250  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 542 aa  207  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.62 
 
 		 514 aa  206  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0667  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 536 aa  206  9e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 500 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4115  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4024  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 530 aa  202  8e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 533 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 502 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 520 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1879  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 535 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1925  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 535 aa  201  3e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0636684  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 512 aa  200  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.46 
 
 		 518 aa  200  5e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 521 aa  200  5e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1859  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 535 aa  199  7.999999999999999e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.41558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.92 
 
 		 521 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.53 
 
 		 510 aa  199  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  35.1 
 
 		 498 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 548 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  30.47 
 
 		 555 aa  197  3e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 526 aa  197  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 		 555 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 		 532 aa  196  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2709  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 531 aa  196  9e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0786644  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 		 539 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.81 
 
 		 530 aa  194  3e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2450  AMP-dependent synthetase and ligase  30.61 
 
 		 517 aa  194  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.459608 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.48 
 
 		 527 aa  193  5e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  29.89 
 
 		 552 aa  192  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 507 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.47 
 
 		 559 aa  192  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  33.05 
 
 		 504 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9896  coumaryl-coa ligase  31.85 
 
 		 523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.54 
 
 		 519 aa  190  5e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 499 aa  189  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 504 aa  189  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7073  putative pimeloyl-CoA ligase pimA  31.18 
 
 		 553 aa  189  8e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.845697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2245  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00923204  normal  0.0183444 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2154  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 513 aa  188  2e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 502 aa  188  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 564 aa  188  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 		 501 aa  188  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  31.08 
 
 		 506 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19550  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.13 
 
 		 533 aa  187  3e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6801  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 540 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867252  normal  0.1235 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0992  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 		 535 aa  187  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.162534  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.19 
 
 		 486 aa  187  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0126  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 		 504 aa  187  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 513 aa  186  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 		 561 aa  186  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2975  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 551 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 630 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5361  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 544 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.521806  normal  0.341711 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 		 551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  31.08 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 505 aa  186  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 		 502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.89 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0265  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 512 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73102  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 561 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 515 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 525 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.25 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 567 aa  184  3e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.78 
 
 		 503 aa  184  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0130  AMP-dependent synthetase and ligase  33.69 
 
 		 502 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.963028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 525 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 545 aa  183  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 506 aa  183  7e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 518 aa  183  7e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.89 
 
 		 526 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.74 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  32.76 
 
 		 531 aa  182  1e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 		 583 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.86 
 
 		 491 aa  182  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  31.65 
 
 		 545 aa  181  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>