More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0807 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
513 aa  1055    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1015  AMP-dependent synthetase and ligase  62.08 
 
 
498 aa  644    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  decreased coverage  0.00519801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 
552 aa  359  7e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  37.45 
 
 
555 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  37.13 
 
 
561 aa  349  5e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 
548 aa  332  1e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.35 
 
 
555 aa  330  4e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1821  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 
550 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 
553 aa  319  6e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  36.65 
 
 
557 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.07 
 
 
561 aa  294  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 
566 aa  295  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.96 
 
 
582 aa  293  4e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.05 
 
 
561 aa  293  7e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.58 
 
 
561 aa  291  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.77 
 
 
561 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.77 
 
 
563 aa  290  4e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.58 
 
 
563 aa  289  7e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.58 
 
 
563 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.39 
 
 
582 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.58 
 
 
563 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4754  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
573 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.548745  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.55 
 
 
561 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 
539 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.87 
 
 
510 aa  282  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  281  2e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.68 
 
 
510 aa  281  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.06 
 
 
510 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 
583 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.25 
 
 
510 aa  278  2e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.49 
 
 
510 aa  278  2e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.3 
 
 
510 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.68 
 
 
510 aa  277  3e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 
584 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
662 aa  266  5.999999999999999e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 
551 aa  265  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.73 
 
 
514 aa  263  6e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4545  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.85 
 
 
564 aa  261  1e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18473  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 
549 aa  261  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 
512 aa  260  4e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
569 aa  260  5.0000000000000005e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2635  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.15 
 
 
566 aa  259  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00000204928  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
577 aa  258  1e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
559 aa  258  1e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 
544 aa  258  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 
553 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  32.84 
 
 
549 aa  254  4.0000000000000004e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 
495 aa  253  6e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.66 
 
 
559 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0878  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.12 
 
 
567 aa  251  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0253772  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 
577 aa  251  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0823  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.65 
 
 
571 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0594953  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3663  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.56 
 
 
565 aa  250  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.717786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 
506 aa  249  7e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1312  AMP-dependent synthetase and ligase  30.71 
 
 
564 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.384847  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.15 
 
 
521 aa  249  1e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2424  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 
567 aa  248  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3157  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.46 
 
 
569 aa  247  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.61239  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 
512 aa  247  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0256  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
583 aa  246  6e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0139167 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 
584 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.02 
 
 
560 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 
561 aa  243  5e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 
498 aa  243  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  32.16 
 
 
500 aa  243  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4351  AMP-dependent synthetase and ligase  31.12 
 
 
578 aa  243  7.999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.17 
 
 
561 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.17 
 
 
561 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.17 
 
 
561 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  32.97 
 
 
560 aa  242  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.17 
 
 
561 aa  242  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 
508 aa  241  2e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.17 
 
 
561 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1683  AMP-dependent synthetase and ligase  28.73 
 
 
535 aa  239  5.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.52 
 
 
557 aa  239  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 
590 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.52 
 
 
557 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.52 
 
 
557 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  32.12 
 
 
591 aa  238  1e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0727  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.47 
 
 
568 aa  239  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0737822  normal  0.538259 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.52 
 
 
557 aa  238  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.74 
 
 
513 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1070  AMP-dependent synthetase and ligase  32.65 
 
 
565 aa  238  2e-61  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0635723  normal  0.557335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1727  AMP-dependent synthetase and ligase  31 
 
 
551 aa  238  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00049699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 
557 aa  238  3e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.33 
 
 
518 aa  237  4e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2588  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
591 aa  237  4e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.401336  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0797  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.16 
 
 
568 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.058688  normal  0.254571 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.99 
 
 
561 aa  236  6e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1725  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.4 
 
 
585 aa  236  7e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00134138  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 
557 aa  236  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.39 
 
 
568 aa  236  8e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.35 
 
 
572 aa  236  9e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3685  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 
562 aa  236  9e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354972  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3638  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 
543 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.03 
 
 
557 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 
549 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>