More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4305 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3821  AMP-dependent synthetase and ligase  68.67 
 
 		 473 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3807  AMP-dependent synthetase and ligase  68.67 
 
 		 473 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00941755  normal  0.205802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3895  AMP-dependent synthetase and ligase  68.67 
 
 		 473 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 467 aa  921    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4256  AMP-dependent synthetase and ligase  69.26 
 
 		 479 aa  628  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  67.97 
 
 		 471 aa  616  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  33.81 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 662 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  38.83 
 
 		 525 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 495 aa  236  8e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  36.23 
 
 		 502 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  36.67 
 
 		 522 aa  232  9e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.73 
 
 		 514 aa  231  1e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  35.79 
 
 		 503 aa  232  1e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0253  putative Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  36.65 
 
 		 519 aa  231  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 552 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.52 
 
 		 510 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 561 aa  222  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 521 aa  221  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2110  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 549 aa  221  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 553 aa  219  6e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  35.26 
 
 		 521 aa  219  6e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 516 aa  219  7e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.58 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  29.62 
 
 		 560 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 532 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1253  AMP-dependent synthetase and ligase  30.1 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1879  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1925  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 535 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0636684  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.07 
 
 		 519 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 533 aa  216  5e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1859  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 		 535 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.41558 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3898  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 553 aa  216  8e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.5 
 
 		 530 aa  216  9.999999999999999e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 523 aa  214  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  34.45 
 
 		 517 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 		 512 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 555 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 		 526 aa  213  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 499 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 507 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2035  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 		 527 aa  213  7.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.821113  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  35.47 
 
 		 585 aa  212  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 504 aa  212  1e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 		 539 aa  212  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 500 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 548 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.97 
 
 		 555 aa  212  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  27.66 
 
 		 549 aa  210  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 533 aa  210  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  29.81 
 
 		 549 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  29.81 
 
 		 549 aa  208  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 515 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.87 
 
 		 527 aa  208  1e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.46 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 590 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 559 aa  208  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4250  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 542 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0667  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 536 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  30.31 
 
 		 591 aa  208  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 561 aa  207  4e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3583  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 		 583 aa  207  4e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.77 
 
 		 559 aa  207  5e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  31.33 
 
 		 513 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.45 
 
 		 513 aa  206  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 549 aa  206  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  34.33 
 
 		 508 aa  205  1e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 584 aa  206  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.53 
 
 		 525 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.64 
 
 		 499 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  34.7 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 553 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1747  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 561 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0225164 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 501 aa  205  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 517 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0371  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 544 aa  204  3e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00566676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  28.63 
 
 		 552 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  30.33 
 
 		 506 aa  203  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 525 aa  203  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.44 
 
 		 510 aa  203  6e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4024  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 530 aa  203  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.24 
 
 		 510 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 630 aa  203  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 510 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.12 
 
 		 491 aa  202  9e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.39 
 
 		 561 aa  202  9e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2339  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.23 
 
 		 553 aa  202  9e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4115  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 		 517 aa  202  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.84 
 
 		 510 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 		 559 aa  201  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.04 
 
 		 510 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2227  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 564 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.08014  normal  0.204171 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 564 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  29.07 
 
 		 552 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.64 
 
 		 510 aa  201  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  28.13 
 
 		 552 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>