More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5361 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_5547  AMP-dependent synthetase and ligase  78.49 
 
 		 544 aa  845    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.730505 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6813  AMP-dependent synthetase and ligase  76.1 
 
 		 544 aa  827    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5806  AMP-dependent synthetase and ligase  74.95 
 
 		 562 aa  816    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154251  normal  0.312131 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5361  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 544 aa  1088    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.521806  normal  0.341711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1557  AMP-dependent synthetase and ligase  79.04 
 
 		 544 aa  870    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6761  AMP-dependent synthetase and ligase  79.78 
 
 		 544 aa  864    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.315927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5782  AMP-dependent synthetase and ligase  78.49 
 
 		 544 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6272  AMP-dependent synthetase and ligase  79.04 
 
 		 544 aa  870    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417798  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  49.91 
 
 		 559 aa  521  1e-146  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3427  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.88 
 
 		 546 aa  511  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.115009  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0394  AMP-dependent synthetase and ligase  48.66 
 
 		 559 aa  509  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1838  AMP-dependent synthetase and ligase  47.74 
 
 		 583 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0025116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2760  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.31 
 
 		 573 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000411499  hitchhiker  0.00194378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1828  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.74 
 
 		 583 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.325094 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4574  AMP-dependent synthetase and ligase  48.83 
 
 		 561 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3797  AMP-dependent synthetase and ligase  48.01 
 
 		 566 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.589487 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01775  acyl-CoA synthase  47.74 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1383  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.74 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0924473  normal  0.838722 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2031  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.74 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2532  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.56 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0895322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1893  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.74 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1958  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.28 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0509331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3950  AMP-dependent synthetase and ligase  48.11 
 
 		 559 aa  501  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0302713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01763  hypothetical protein  47.74 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3077  AMP-dependent synthetase and ligase  47.9 
 
 		 553 aa  503  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1314  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.28 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000394382  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2018  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.28 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.456222  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1498  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.28 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0422042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.09 
 
 		 572 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2065  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.56 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1961  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.28 
 
 		 561 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0286809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1993  AMP-dependent synthetase and ligase  47.02 
 
 		 567 aa  500  1e-140  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.196682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4543  AMP-dependent synthetase and ligase  48.01 
 
 		 562 aa  501  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3299  AMP-dependent synthetase and ligase  48.29 
 
 		 559 aa  501  1e-140  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0946  AMP-dependent synthetase and ligase  48.29 
 
 		 559 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3148  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  49.55 
 
 		 560 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2857  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.48 
 
 		 569 aa  497  1e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.11 
 
 		 562 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00382962  normal  0.913508 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6801  AMP-dependent synthetase and ligase  48.89 
 
 		 540 aa  496  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867252  normal  0.1235 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2010  AMP-dependent synthetase and ligase  47.84 
 
 		 569 aa  496  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.982062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  48.56 
 
 		 561 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3834  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.85 
 
 		 563 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.13 
 
 		 562 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2739  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.59 
 
 		 569 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2994  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  48.38 
 
 		 560 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.562113  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2231  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.57 
 
 		 572 aa  493  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00224599  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2386  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.27 
 
 		 557 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0150062  normal  0.524068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0069  AMP-dependent synthetase and ligase  47.56 
 
 		 647 aa  492  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3104  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.24 
 
 		 569 aa  492  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.31 
 
 		 562 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4549  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.57 
 
 		 565 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.835945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.57 
 
 		 565 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3482  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.93 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0194948  hitchhiker  0.00229302 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.21 
 
 		 565 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3752  AMP-dependent synthetase and ligase  46.58 
 
 		 557 aa  491  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.419437  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1761  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.27 
 
 		 557 aa  489  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0066805  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1936  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.31 
 
 		 572 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.451048  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4097  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.03 
 
 		 563 aa  485  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.21 
 
 		 565 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1934  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.64 
 
 		 558 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.015964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3572  putative long-chain-fatty-acid--CoA ligase protein  46.64 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00067  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  45.19 
 
 		 560 aa  488  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2014  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.76 
 
 		 562 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4353  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.93 
 
 		 565 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3633  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.92 
 
 		 557 aa  487  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.956552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.76 
 
 		 577 aa  485  1e-136  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000565226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1625  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.45 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000265085  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0064  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.74 
 
 		 557 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2177  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.91 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000145714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2254  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.91 
 
 		 557 aa  488  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00142452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0476  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.82 
 
 		 557 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1733  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46 
 
 		 557 aa  485  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.667013  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2125  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.76 
 
 		 562 aa  485  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0546  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.74 
 
 		 557 aa  485  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2428  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.73 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268357  normal  0.181613 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0373  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.18 
 
 		 581 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.826783  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1511  hypothetical protein  44.02 
 
 		 569 aa  482  1e-135  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0144  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.84 
 
 		 566 aa  483  1e-135  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0518  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.56 
 
 		 557 aa  484  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1831  putative long-chain fatty acyl CoA ligase  46.91 
 
 		 558 aa  482  1e-135  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.149833  normal  0.317759 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0474  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.57 
 
 		 557 aa  483  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2188  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.57 
 
 		 557 aa  485  1e-135  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  hitchhiker  0.000240143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1891  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.73 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0198205  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1864  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.73 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00374532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2804  AMP-dependent synthetase and ligase  45.54 
 
 		 552 aa  482  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.456781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0451  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.27 
 
 		 557 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.321292  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4746  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.2 
 
 		 563 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2685  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.64 
 
 		 557 aa  478  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0867888  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1472  hypothetical protein  43.76 
 
 		 569 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0413  AMP-dependent synthetase and ligase  45.89 
 
 		 579 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1898  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.73 
 
 		 557 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0400392  normal  0.937461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0952  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.38 
 
 		 563 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4074  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.64 
 
 		 561 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4225  AMP-dependent synthetase and ligase  46.96 
 
 		 561 aa  478  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1323  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.84 
 
 		 561 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2110  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.57 
 
 		 557 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000148173  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3734  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.75 
 
 		 560 aa  481  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.862355  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0428  AMP-dependent synthetase and ligase  45.89 
 
 		 579 aa  481  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0627658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2523  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  46.58 
 
 		 557 aa  480  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00313327  normal  0.944689 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2848  Long-chain-fatty-acid--CoA ligase  47.64 
 
 		 557 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>