More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3807 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2392  AMP-dependent synthetase and ligase  72.79 
 
 
471 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.459237  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3821  AMP-dependent synthetase and ligase  99.79 
 
 
473 aa  949    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3807  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
473 aa  951    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00941755  normal  0.205802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3895  AMP-dependent synthetase and ligase  99.79 
 
 
473 aa  949    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.452933  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4256  AMP-dependent synthetase and ligase  72.2 
 
 
479 aa  654    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.1551  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4305  AMP-dependent synthetase and ligase  68.67 
 
 
467 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 
502 aa  243  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 
662 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
503 aa  233  5e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 
552 aa  233  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.533017  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 
498 aa  232  9e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.13 
 
 
585 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 
495 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 
561 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0253  putative Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  37.08 
 
 
519 aa  225  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 
525 aa  224  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0293  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 
533 aa  223  7e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.406694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0667  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 
536 aa  219  8.999999999999998e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1738  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
549 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0121059  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2035  AMP-dependent synthetase and ligase  34.19 
 
 
527 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.821113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
523 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1072  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 
532 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.334483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 
516 aa  213  4.9999999999999996e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 
522 aa  213  7e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0928  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 
553 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.12 
 
 
514 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.29 
 
 
561 aa  211  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 
520 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26260  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.19 
 
 
491 aa  210  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.420074  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 
551 aa  211  3e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 
500 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 
508 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1859  AMP-dependent synthetase and ligase  34.34 
 
 
535 aa  209  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.41558 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 
505 aa  208  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
590 aa  208  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4454  long-chain-fatty-acid-CoA ligase  31.84 
 
 
555 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.100007 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0904  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.38 
 
 
559 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.27 
 
 
518 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 
499 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.55 
 
 
525 aa  207  4e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1879  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 
535 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1925  AMP-dependent synthetase and ligase  34.14 
 
 
535 aa  207  4e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0636684  normal  0.805492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 
584 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 
525 aa  205  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 
577 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  30.53 
 
 
566 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 
520 aa  204  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 
521 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2519  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.54 
 
 
562 aa  204  3e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.13 
 
 
510 aa  204  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2110  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 
549 aa  204  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333319  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.73 
 
 
509 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 
591 aa  203  5e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.15 
 
 
561 aa  203  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4250  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 
542 aa  202  7e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 
557 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3431  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 
507 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 
630 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  32.43 
 
 
503 aa  201  3e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2551  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 
559 aa  201  3e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.083055  normal  0.0774583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.85 
 
 
555 aa  201  3e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 
561 aa  201  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5361  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 
544 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.521806  normal  0.341711 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.13 
 
 
582 aa  200  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  34.16 
 
 
507 aa  200  5e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5034  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 
517 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5826  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 
517 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 
504 aa  200  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1837  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
518 aa  200  6e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.963932  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 
539 aa  200  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.13 
 
 
561 aa  199  7e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.87 
 
 
526 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  30.83 
 
 
552 aa  199  7e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3772  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  30.94 
 
 
531 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.910601 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 
517 aa  199  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.13 
 
 
561 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6801  AMP-dependent synthetase and ligase  30.69 
 
 
540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.867252  normal  0.1235 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 
490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 
583 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.9 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6394  AMP-dependent synthetase and ligase  31.49 
 
 
517 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178832  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.15 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  31.97 
 
 
556 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.52 
 
 
521 aa  197  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.63 
 
 
513 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  29.23 
 
 
549 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4353  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 
517 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3818  AMP-dependent synthetase and ligase  32.18 
 
 
501 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  34.06 
 
 
500 aa  197  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.78 
 
 
512 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 
511 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  31.15 
 
 
549 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0265  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 
512 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.73102  normal  0.999121 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 
530 aa  196  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00649  4-coumarate-CoA ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13110)  29.96 
 
 
560 aa  196  8.000000000000001e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.74 
 
 
561 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.96 
 
 
549 aa  196  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>