More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3802 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  82.57 
 
 		 504 aa  816    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  67.47 
 
 		 498 aa  675    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 545 aa  1105    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0126  AMP-dependent synthetase and ligase  82.16 
 
 		 504 aa  804    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  77.96 
 
 		 503 aa  780    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5284  AMP-dependent synthetase and ligase  59.92 
 
 		 503 aa  580  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  59.13 
 
 		 504 aa  563  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  47.79 
 
 		 530 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  48.13 
 
 		 510 aa  444  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  44.6 
 
 		 520 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  44.2 
 
 		 521 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  44.2 
 
 		 521 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  44.2 
 
 		 731 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  44.2 
 
 		 570 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  44.2 
 
 		 521 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  44.2 
 
 		 521 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  44.2 
 
 		 521 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  43.56 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2582  AMP-dependent synthetase and ligase  45.6 
 
 		 520 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  43.02 
 
 		 519 aa  366  1e-100  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2558  AMP-dependent synthetase and ligase  45.4 
 
 		 520 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  44.79 
 
 		 520 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1947  AMP-dependent synthetase and ligase  45.19 
 
 		 520 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  44.4 
 
 		 520 aa  361  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  43.96 
 
 		 520 aa  360  3e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 520 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  42.04 
 
 		 525 aa  346  7e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1894  putative AMP-binding protein  40.24 
 
 		 502 aa  331  3e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 520 aa  295  2e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 504 aa  267  4e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 		 513 aa  261  3e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 501 aa  259  9e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 		 506 aa  256  6e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 585 aa  255  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  32.21 
 
 		 504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  33.73 
 
 		 510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  32.74 
 
 		 506 aa  249  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  34.35 
 
 		 507 aa  247  4e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  32.21 
 
 		 504 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  34.06 
 
 		 507 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 490 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.11 
 
 		 514 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 525 aa  239  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  32.66 
 
 		 506 aa  236  7e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  34.87 
 
 		 512 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  33.8 
 
 		 507 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.85 
 
 		 512 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.3 
 
 		 527 aa  235  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 516 aa  234  3e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  33.67 
 
 		 509 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  31.43 
 
 		 504 aa  233  7.000000000000001e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.58 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 492 aa  231  2e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.8 
 
 		 516 aa  229  9e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  34.5 
 
 		 502 aa  229  9e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.81 
 
 		 525 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 512 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  33.47 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 520 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 		 517 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  34 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  29.74 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.22 
 
 		 519 aa  228  2e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 495 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 505 aa  227  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 500 aa  227  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  31.89 
 
 		 508 aa  226  8e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 511 aa  226  8e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 843 aa  226  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 662 aa  225  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 504 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  34.15 
 
 		 517 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 521 aa  224  4.9999999999999996e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  31.99 
 
 		 506 aa  223  6e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  33.27 
 
 		 510 aa  223  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  29.74 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 506 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  30.44 
 
 		 508 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  33.01 
 
 		 510 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  27.71 
 
 		 518 aa  221  3e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 508 aa  220  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.43 
 
 		 513 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  32.28 
 
 		 549 aa  219  1e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.68 
 
 		 546 aa  219  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30.41 
 
 		 559 aa  219  1e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  33.98 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.63 
 
 		 510 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  30.8 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  30.2 
 
 		 548 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 499 aa  217  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  34.06 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  30.6 
 
 		 548 aa  217  4e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.55 
 
 		 503 aa  217  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 		 584 aa  216  5.9999999999999996e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.64 
 
 		 526 aa  216  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  38.29 
 
 		 507 aa  215  9.999999999999999e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  30.49 
 
 		 518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>