More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3211 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 520 aa  1046    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 521 aa  729    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 521 aa  729    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 521 aa  729    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 731 aa  727    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2582  AMP-dependent synthetase and ligase  72.12 
 
 		 520 aa  703    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  72.39 
 
 		 520 aa  717    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  72.88 
 
 		 520 aa  743    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  77.26 
 
 		 525 aa  808    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  92.5 
 
 		 520 aa  919    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  71.4 
 
 		 570 aa  728    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  72.25 
 
 		 520 aa  700    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1947  AMP-dependent synthetase and ligase  71.15 
 
 		 520 aa  694    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  71.21 
 
 		 521 aa  729    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  72.64 
 
 		 520 aa  692    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2558  AMP-dependent synthetase and ligase  71.35 
 
 		 520 aa  695    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  73.23 
 
 		 519 aa  707    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  71.21 
 
 		 521 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  48.41 
 
 		 510 aa  455  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  45.82 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  46.51 
 
 		 530 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1894  putative AMP-binding protein  44.6 
 
 		 502 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5284  AMP-dependent synthetase and ligase  44.69 
 
 		 503 aa  371  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  43.9 
 
 		 504 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  45 
 
 		 503 aa  363  3e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  44.21 
 
 		 498 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  44.17 
 
 		 504 aa  356  5.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  43.96 
 
 		 545 aa  352  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0126  AMP-dependent synthetase and ligase  42.68 
 
 		 504 aa  347  4e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 492 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.28 
 
 		 514 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.11 
 
 		 512 aa  264  3e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 521 aa  263  4e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.75 
 
 		 512 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.79 
 
 		 510 aa  257  4e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  44.09 
 
 		 506 aa  257  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.58 
 
 		 510 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.58 
 
 		 510 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  42.27 
 
 		 508 aa  256  7e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.58 
 
 		 510 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.58 
 
 		 510 aa  256  9e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.38 
 
 		 510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.92 
 
 		 510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.57 
 
 		 510 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 521 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.17 
 
 		 510 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 518 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.38 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.49 
 
 		 515 aa  250  5e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 527 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  37.77 
 
 		 528 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 		 505 aa  249  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 500 aa  249  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 513 aa  249  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.69 
 
 		 500 aa  248  3e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 		 511 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  35.53 
 
 		 508 aa  246  8e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 525 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 506 aa  246  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.62 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  36.24 
 
 		 511 aa  244  3e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  41.58 
 
 		 506 aa  241  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 499 aa  239  8e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  34.55 
 
 		 508 aa  239  9e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.73 
 
 		 510 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  31.88 
 
 		 514 aa  238  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 		 502 aa  238  3e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 		 508 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.49 
 
 		 516 aa  236  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 		 496 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 		 5154 aa  236  7e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  36.06 
 
 		 530 aa  236  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 577 aa  236  9e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  32.99 
 
 		 496 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 		 508 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  32.44 
 
 		 496 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  35.11 
 
 		 510 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  35.33 
 
 		 519 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 590 aa  233  5e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  35.02 
 
 		 532 aa  232  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 501 aa  232  1e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  34.5 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 490 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.89 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.97 
 
 		 518 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  34.69 
 
 		 503 aa  231  3e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  38.46 
 
 		 525 aa  230  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  31.37 
 
 		 591 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  33.6 
 
 		 516 aa  230  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  39.31 
 
 		 511 aa  230  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 		 503 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 498 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1611  AMP-dependent synthetase and ligase  30.84 
 
 		 584 aa  228  1e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.187495  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 510 aa  227  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.6 
 
 		 517 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.6 
 
 		 517 aa  227  4e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>