More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0186 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  68.48 
 
 		 498 aa  672    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 503 aa  1006    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  77.96 
 
 		 545 aa  761    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  80.72 
 
 		 504 aa  795    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0126  AMP-dependent synthetase and ligase  81 
 
 		 504 aa  787    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  60.04 
 
 		 504 aa  558  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5284  AMP-dependent synthetase and ligase  59.07 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  47.39 
 
 		 530 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  46.89 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  44.29 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  44.29 
 
 		 570 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  44.29 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  44.29 
 
 		 731 aa  366  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  44.29 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  44.29 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  44.29 
 
 		 521 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  43.94 
 
 		 520 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  46.15 
 
 		 520 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  45 
 
 		 520 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  44.2 
 
 		 519 aa  352  8e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 		 525 aa  350  5e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2582  AMP-dependent synthetase and ligase  45.1 
 
 		 520 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2558  AMP-dependent synthetase and ligase  44.9 
 
 		 520 aa  347  4e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1947  AMP-dependent synthetase and ligase  44.69 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  44.19 
 
 		 520 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  43.43 
 
 		 520 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  43.76 
 
 		 520 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1894  putative AMP-binding protein  40.37 
 
 		 502 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 520 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  34.9 
 
 		 504 aa  263  6.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  33.73 
 
 		 504 aa  251  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  34.39 
 
 		 507 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  34.39 
 
 		 507 aa  243  5e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  33.79 
 
 		 504 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  32.67 
 
 		 510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  32.67 
 
 		 506 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  33.47 
 
 		 506 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 507 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 520 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 525 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.74 
 
 		 513 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 585 aa  229  6e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 490 aa  230  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  32.46 
 
 		 508 aa  229  7e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  31.9 
 
 		 508 aa  228  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  34.62 
 
 		 504 aa  228  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  33.88 
 
 		 506 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  39.14 
 
 		 506 aa  228  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 500 aa  228  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 517 aa  225  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  33 
 
 		 503 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  31.3 
 
 		 503 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  32.72 
 
 		 511 aa  223  6e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  31.98 
 
 		 503 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  31.48 
 
 		 505 aa  223  9e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  33.86 
 
 		 510 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 495 aa  222  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  33.55 
 
 		 519 aa  221  3e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.04 
 
 		 568 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  33.86 
 
 		 510 aa  221  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  34.36 
 
 		 520 aa  220  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.51 
 
 		 527 aa  220  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  28.46 
 
 		 662 aa  218  2e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 504 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 519 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 501 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  32.92 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.94 
 
 		 514 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1668  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.1 
 
 		 514 aa  216  5.9999999999999996e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  32.42 
 
 		 503 aa  216  8e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  32.5 
 
 		 536 aa  216  9e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  30.31 
 
 		 504 aa  215  9.999999999999999e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 502 aa  215  1.9999999999999998e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  31.24 
 
 		 512 aa  215  1.9999999999999998e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  32.38 
 
 		 511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  29.3 
 
 		 520 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.73 
 
 		 583 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  34.07 
 
 		 509 aa  213  5.999999999999999e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 499 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.26 
 
 		 519 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.83 
 
 		 521 aa  213  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  33.8 
 
 		 539 aa  213  7e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  33.8 
 
 		 547 aa  213  1e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.85 
 
 		 516 aa  211  2e-53  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.82 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.67 
 
 		 510 aa  210  4e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2202  AMP-dependent synthetase and ligase  30.54 
 
 		 525 aa  210  5e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  35.61 
 
 		 501 aa  210  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  34.7 
 
 		 501 aa  210  6e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  29.28 
 
 		 508 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 513 aa  209  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.83 
 
 		 528 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  31.3 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  32.18 
 
 		 506 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>