More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5284 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5284  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 503 aa  1018    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  59.92 
 
 		 545 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  60.2 
 
 		 498 aa  565  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  59.07 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  58.13 
 
 		 504 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0126  AMP-dependent synthetase and ligase  57.72 
 
 		 504 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  57.26 
 
 		 504 aa  521  1e-146  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  45.07 
 
 		 510 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  44 
 
 		 530 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 521 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  45.51 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  45.31 
 
 		 521 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 521 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 521 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  45.31 
 
 		 521 aa  385  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  45.22 
 
 		 731 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  45.11 
 
 		 520 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  44.18 
 
 		 520 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  42.77 
 
 		 525 aa  363  4e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  44.94 
 
 		 520 aa  361  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  44.51 
 
 		 520 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  44.93 
 
 		 519 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  45.18 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2582  AMP-dependent synthetase and ligase  44.58 
 
 		 520 aa  345  1e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2558  AMP-dependent synthetase and ligase  44.58 
 
 		 520 aa  344  2e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1947  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 520 aa  343  5e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  44.69 
 
 		 520 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 		 520 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1894  putative AMP-binding protein  37.76 
 
 		 502 aa  297  3e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  34.61 
 
 		 492 aa  257  3e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 495 aa  249  1e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.36 
 
 		 513 aa  243  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 585 aa  243  7.999999999999999e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 490 aa  242  1e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 525 aa  242  1e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 520 aa  240  5e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  33.26 
 
 		 504 aa  235  1.0000000000000001e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 511 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  32.94 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 504 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.26 
 
 		 506 aa  230  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  35.12 
 
 		 499 aa  229  9e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  33.13 
 
 		 510 aa  228  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  32.56 
 
 		 504 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.63 
 
 		 518 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.05 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.65 
 
 		 514 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.23 
 
 		 527 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  32.72 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 508 aa  224  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1547  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.67 
 
 		 526 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 		 507 aa  224  4e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  31.86 
 
 		 504 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2126  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.81 
 
 		 546 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0597043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 521 aa  221  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.18 
 
 		 662 aa  220  5e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1417  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.13 
 
 		 528 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  29.51 
 
 		 514 aa  219  7.999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  31.89 
 
 		 512 aa  218  1e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 513 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  31.55 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.43 
 
 		 539 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  32.85 
 
 		 508 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  33.4 
 
 		 504 aa  216  8e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 509 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 518 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  33.61 
 
 		 519 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 		 500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  30.98 
 
 		 526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.17 
 
 		 521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  33.61 
 
 		 519 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  31.56 
 
 		 507 aa  213  5.999999999999999e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 525 aa  213  9e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.17 
 
 		 553 aa  213  9e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  30.2 
 
 		 515 aa  212  1e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  29.46 
 
 		 583 aa  211  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  32.18 
 
 		 536 aa  211  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 501 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 		 490 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  33.47 
 
 		 503 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 502 aa  209  9e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1238  AMP-dependent synthetase and ligase  30.24 
 
 		 555 aa  209  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  31.55 
 
 		 521 aa  209  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  33.88 
 
 		 510 aa  208  2e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  28.99 
 
 		 520 aa  207  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  33.26 
 
 		 501 aa  207  4e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  30.4 
 
 		 584 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 517 aa  207  4e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 		 506 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 530 aa  207  5e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  27.82 
 
 		 549 aa  206  5e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  31.67 
 
 		 506 aa  207  5e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1017  O-succinylbenzoate--CoA ligase  31.03 
 
 		 552 aa  206  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  33.04 
 
 		 501 aa  206  6e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2939  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 502 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.572456  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0116  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 502 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.03 
 
 		 510 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0728  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 507 aa  206  8e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>