More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3536 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 530 aa  1090    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  56 
 
 		 510 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  49.5 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  48.2 
 
 		 498 aa  444  1e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  47.7 
 
 		 504 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  49.1 
 
 		 520 aa  438  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  47.39 
 
 		 503 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  47.79 
 
 		 545 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0126  AMP-dependent synthetase and ligase  47.49 
 
 		 504 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2558  AMP-dependent synthetase and ligase  48.9 
 
 		 520 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  48.54 
 
 		 520 aa  422  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  45.12 
 
 		 525 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2582  AMP-dependent synthetase and ligase  48.9 
 
 		 520 aa  423  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1947  AMP-dependent synthetase and ligase  48.7 
 
 		 520 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  48.1 
 
 		 519 aa  422  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  49.6 
 
 		 520 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  45.71 
 
 		 521 aa  412  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  45.71 
 
 		 731 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  45.71 
 
 		 570 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  46.51 
 
 		 520 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  46.91 
 
 		 520 aa  405  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5284  AMP-dependent synthetase and ligase  44 
 
 		 503 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  44.71 
 
 		 520 aa  393  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1894  putative AMP-binding protein  39.18 
 
 		 502 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 		 520 aa  326  5e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.7 
 
 		 506 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  33.74 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  34.34 
 
 		 508 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 502 aa  249  1e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 		 518 aa  247  3e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  36.53 
 
 		 585 aa  244  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.91 
 
 		 513 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  34.01 
 
 		 503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 506 aa  240  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 583 aa  239  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 511 aa  239  1e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 507 aa  236  6e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 512 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 507 aa  234  3e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 506 aa  233  8.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.2 
 
 		 519 aa  232  1e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  30.68 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.35 
 
 		 514 aa  231  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 501 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  32.71 
 
 		 499 aa  230  6e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.84 
 
 		 561 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.04 
 
 		 561 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.09 
 
 		 561 aa  228  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  33.33 
 
 		 506 aa  226  5.0000000000000005e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.91 
 
 		 582 aa  226  6e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  32.77 
 
 		 508 aa  226  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  31.99 
 
 		 527 aa  225  1e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  33.47 
 
 		 520 aa  226  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.91 
 
 		 563 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.91 
 
 		 563 aa  225  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 520 aa  224  2e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.91 
 
 		 563 aa  224  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  31.97 
 
 		 504 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.81 
 
 		 530 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  33.55 
 
 		 500 aa  224  3e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.91 
 
 		 582 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.36 
 
 		 512 aa  224  4e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.55 
 
 		 563 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  34.08 
 
 		 504 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.67 
 
 		 524 aa  223  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 		 526 aa  223  7e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  33.67 
 
 		 512 aa  223  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.31 
 
 		 561 aa  223  9e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  34.03 
 
 		 511 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.64 
 
 		 525 aa  222  9.999999999999999e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0662  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 548 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.27921  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.91 
 
 		 516 aa  222  9.999999999999999e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 		 506 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 504 aa  221  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 		 525 aa  220  5e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 		 485 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  33.67 
 
 		 508 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.27 
 
 		 503 aa  219  7.999999999999999e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 502 aa  219  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 512 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  30.45 
 
 		 521 aa  219  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 		 561 aa  218  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  34 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  28.34 
 
 		 514 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  32.78 
 
 		 515 aa  217  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  33.9 
 
 		 508 aa  217  5e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 519 aa  216  7e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 505 aa  216  7e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4073  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 		 535 aa  216  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0666092  normal  0.751022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  34.03 
 
 		 503 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  33.61 
 
 		 504 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.81 
 
 		 570 aa  215  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  32.17 
 
 		 516 aa  214  3.9999999999999995e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.493371 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  32.07 
 
 		 504 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>