More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1947 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  71.15 
 
 		 520 aa  716    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  87.67 
 
 		 520 aa  850    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  73.51 
 
 		 521 aa  740    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  73.51 
 
 		 731 aa  739    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  91.92 
 
 		 520 aa  921    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  73.51 
 
 		 521 aa  740    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  76.35 
 
 		 520 aa  766    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  70.58 
 
 		 520 aa  697    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  85.55 
 
 		 519 aa  833    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  73.51 
 
 		 521 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1947  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 520 aa  1033    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2582  AMP-dependent synthetase and ligase  98.08 
 
 		 520 aa  1007    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  73.51 
 
 		 570 aa  738    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  88.44 
 
 		 520 aa  842    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  73.51 
 
 		 521 aa  740    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2558  AMP-dependent synthetase and ligase  99.81 
 
 		 520 aa  1031    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  72.35 
 
 		 525 aa  718    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  73.51 
 
 		 521 aa  740    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  48.7 
 
 		 530 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  46.6 
 
 		 510 aa  436  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  46.79 
 
 		 520 aa  435  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1894  putative AMP-binding protein  46.79 
 
 		 502 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  46.39 
 
 		 504 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  44.08 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  44.44 
 
 		 498 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  45.19 
 
 		 545 aa  378  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  44.69 
 
 		 503 aa  375  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5284  AMP-dependent synthetase and ligase  44.38 
 
 		 503 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0126  AMP-dependent synthetase and ligase  43.27 
 
 		 504 aa  363  6e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  37.8 
 
 		 492 aa  298  1e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  36.35 
 
 		 521 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.33 
 
 		 514 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 		 527 aa  276  4e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.37 
 
 		 525 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  38.02 
 
 		 499 aa  273  6e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 		 512 aa  271  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.91 
 
 		 512 aa  270  5e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 520 aa  270  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  35.08 
 
 		 518 aa  266  8e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  35.54 
 
 		 508 aa  265  2e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 513 aa  262  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  36.92 
 
 		 502 aa  261  3e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.36 
 
 		 490 aa  261  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  43.85 
 
 		 506 aa  260  5.0000000000000005e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  39.76 
 
 		 528 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  38.34 
 
 		 527 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  34.82 
 
 		 504 aa  258  1e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.14 
 
 		 516 aa  259  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  34.98 
 
 		 515 aa  257  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  36.95 
 
 		 506 aa  257  3e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  36.62 
 
 		 507 aa  257  4e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  34.55 
 
 		 508 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 511 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 		 510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 508 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 		 510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 		 520 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.52 
 
 		 510 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 		 510 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.52 
 
 		 510 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.52 
 
 		 510 aa  253  6e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  37.42 
 
 		 5154 aa  253  6e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 500 aa  253  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.71 
 
 		 510 aa  253  7e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 506 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.24 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.91 
 
 		 510 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 521 aa  252  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  35.83 
 
 		 532 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  34.83 
 
 		 516 aa  250  4e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.88 
 
 		 568 aa  249  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  34.13 
 
 		 557 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 		 511 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  36.06 
 
 		 503 aa  248  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  37.09 
 
 		 2374 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  32.27 
 
 		 514 aa  247  3e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  35.51 
 
 		 504 aa  247  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 508 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.71 
 
 		 518 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 539 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.69 
 
 		 499 aa  247  4.9999999999999997e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 		 511 aa  246  8e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  37.4 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 		 508 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  35.66 
 
 		 510 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  35.61 
 
 		 504 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 515 aa  245  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 495 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 		 485 aa  244  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  36.01 
 
 		 512 aa  243  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 510 aa  243  5e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 519 aa  243  5e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 549 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 		 584 aa  243  6e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  31.87 
 
 		 510 aa  243  7e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  31.63 
 
 		 496 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  31.63 
 
 		 496 aa  242  9e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 527 aa  242  1e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2963  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 551 aa  242  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000191926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>