More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5890 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  73.89 
 
 
521 aa  748    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  73.75 
 
 
731 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  90.56 
 
 
520 aa  877    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2582  AMP-dependent synthetase and ligase  91.35 
 
 
520 aa  898    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
520 aa  1037    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  76.92 
 
 
520 aa  776    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  73.89 
 
 
570 aa  747    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  71.73 
 
 
520 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  88.25 
 
 
519 aa  853    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  73.89 
 
 
521 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  73.89 
 
 
521 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1947  AMP-dependent synthetase and ligase  91.92 
 
 
520 aa  903    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  73.89 
 
 
521 aa  748    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  72.39 
 
 
520 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  91.14 
 
 
520 aa  867    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2558  AMP-dependent synthetase and ligase  92.12 
 
 
520 aa  904    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  71.76 
 
 
525 aa  723    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  73.89 
 
 
521 aa  748    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  49.1 
 
 
530 aa  455  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  47.91 
 
 
510 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  46.72 
 
 
520 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1894  putative AMP-binding protein  48.27 
 
 
502 aa  430  1e-119  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  46.39 
 
 
504 aa  417  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  44.2 
 
 
498 aa  391  1e-107  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  44.8 
 
 
545 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  44.55 
 
 
503 aa  385  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  43.54 
 
 
504 aa  380  1e-104  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5284  AMP-dependent synthetase and ligase  44.8 
 
 
503 aa  375  1e-103  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0126  AMP-dependent synthetase and ligase  42.74 
 
 
504 aa  367  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  40.08 
 
 
492 aa  299  6e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 
521 aa  292  1e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.03 
 
 
514 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.88 
 
 
512 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 
525 aa  281  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 
512 aa  279  7e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  39.05 
 
 
499 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  36.47 
 
 
518 aa  276  5e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 
508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 
520 aa  271  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  39.05 
 
 
506 aa  271  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 
527 aa  270  2.9999999999999997e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  38.2 
 
 
506 aa  269  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  35.97 
 
 
515 aa  266  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 
521 aa  266  5e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 
513 aa  266  8e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
490 aa  266  8e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.65 
 
 
516 aa  266  8.999999999999999e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 
520 aa  263  4e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
514 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  35.32 
 
 
511 aa  260  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  37.33 
 
 
502 aa  260  4e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  38.1 
 
 
511 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  34.75 
 
 
508 aa  259  6e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 
511 aa  259  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  35.58 
 
 
510 aa  258  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  38.01 
 
 
527 aa  258  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  36.9 
 
 
584 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.29 
 
 
510 aa  257  4e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.58 
 
 
510 aa  256  5e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.59 
 
 
510 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.29 
 
 
510 aa  256  6e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  37.69 
 
 
528 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 
506 aa  256  7e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.1 
 
 
510 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.1 
 
 
510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  37.15 
 
 
5154 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.1 
 
 
510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
507 aa  255  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.19 
 
 
510 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.9 
 
 
510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.39 
 
 
510 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 
500 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  34.82 
 
 
504 aa  254  2.0000000000000002e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  32.34 
 
 
510 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 
510 aa  251  2e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 
507 aa  251  2e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.08 
 
 
568 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  35.65 
 
 
516 aa  251  2e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  37.27 
 
 
508 aa  251  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  35.27 
 
 
503 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.73 
 
 
519 aa  250  6e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.45 
 
 
518 aa  248  1e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  36.58 
 
 
2374 aa  248  2e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  37.48 
 
 
499 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  33.58 
 
 
557 aa  248  3e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 
515 aa  248  3e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
519 aa  247  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 
583 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  35 
 
 
532 aa  246  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 
504 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 
549 aa  246  9e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  36.54 
 
 
508 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 
513 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  35.02 
 
 
508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  34.43 
 
 
511 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.79 
 
 
527 aa  245  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  34.58 
 
 
503 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6735  AMP-dependent synthetase and ligase  37.06 
 
 
503 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  32.72 
 
 
496 aa  243  5e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>