More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1068 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008836  BMA10229_A2505  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
521 aa  1041    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2477  AMP-dependent synthetase and ligase  76.23 
 
 
520 aa  724    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0651033 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0370  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
521 aa  1041    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2582  AMP-dependent synthetase and ligase  73.7 
 
 
520 aa  719    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1068  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
731 aa  1454    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0912  AMP-binding protein  98.95 
 
 
570 aa  1128    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5890  AMP-dependent synthetase and ligase  73.75 
 
 
520 aa  728    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.188723 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0727  AMP-binding domain-containing protein  89.64 
 
 
520 aa  919    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0751  AMP-dependent synthetase and ligase  70.44 
 
 
520 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0916  AMP-binding protein  100 
 
 
521 aa  1041    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0991636  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  71.21 
 
 
520 aa  723    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0738  AMP-dependent synthetase and ligase  75.25 
 
 
519 aa  718    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107823  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1947  AMP-dependent synthetase and ligase  73.51 
 
 
520 aa  713    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2606  AMP-dependent synthetase and ligase  76.31 
 
 
520 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0119  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
521 aa  1041    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2558  AMP-dependent synthetase and ligase  73.7 
 
 
520 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  71.18 
 
 
525 aa  734    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0670  AMP-binding domain-containing protein  100 
 
 
521 aa  1041    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  46.71 
 
 
510 aa  430  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.371172  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3536  AMP-dependent synthetase and ligase  45.71 
 
 
530 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  46.63 
 
 
520 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.459173  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1894  putative AMP-binding protein  46.42 
 
 
502 aa  399  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5284  AMP-dependent synthetase and ligase  45.15 
 
 
503 aa  385  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1316  AMP-dependent synthetase and ligase  43.6 
 
 
504 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0186  AMP-dependent synthetase and ligase  44.29 
 
 
503 aa  369  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0144  AMP-dependent synthetase and ligase  44.58 
 
 
504 aa  369  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.846465  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3802  AMP-dependent synthetase and ligase  43.6 
 
 
545 aa  366  1e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7294  AMP-dependent synthetase and ligase  42.38 
 
 
498 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555041  normal  0.661427 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0126  AMP-dependent synthetase and ligase  43.96 
 
 
504 aa  360  6e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.88 
 
 
514 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.18 
 
 
512 aa  279  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  36.71 
 
 
492 aa  278  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 
521 aa  261  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  34.74 
 
 
508 aa  261  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  32.73 
 
 
510 aa  261  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.79 
 
 
525 aa  259  1e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
490 aa  259  2e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 
520 aa  259  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 
527 aa  259  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  38.89 
 
 
527 aa  258  4e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 
512 aa  256  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  34.84 
 
 
507 aa  255  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  35.47 
 
 
508 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.53 
 
 
513 aa  255  3e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 
510 aa  253  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  32.8 
 
 
496 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 
510 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 
510 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 
510 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 
510 aa  251  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.66 
 
 
510 aa  251  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5079  AMP-dependent synthetase and ligase  34.58 
 
 
511 aa  251  3e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11462  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 
504 aa  251  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  35.8 
 
 
508 aa  251  4e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01070  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.95 
 
 
516 aa  251  4e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  31.59 
 
 
514 aa  251  4e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  32.48 
 
 
496 aa  251  5e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.46 
 
 
510 aa  251  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  32.48 
 
 
496 aa  251  5e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  32.48 
 
 
496 aa  250  6e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0136  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 
520 aa  250  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.98 
 
 
510 aa  250  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.73 
 
 
510 aa  249  1e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  33.68 
 
 
498 aa  249  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.59 
 
 
510 aa  249  1e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 
499 aa  249  1e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  32.95 
 
 
518 aa  248  2e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 
506 aa  249  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 
577 aa  248  3e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  34.22 
 
 
508 aa  247  4.9999999999999997e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.47 
 
 
510 aa  246  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 
528 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.47 
 
 
515 aa  246  1.9999999999999999e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1246  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 
5154 aa  245  1.9999999999999999e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.262553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3115  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
584 aa  245  1.9999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 
549 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  42.09 
 
 
506 aa  243  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 
502 aa  243  9e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  34.57 
 
 
510 aa  243  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22810  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.78 
 
 
500 aa  242  2e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.76 
 
 
508 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  35.15 
 
 
532 aa  241  2.9999999999999997e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  35.34 
 
 
510 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2616  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.18 
 
 
568 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 
511 aa  241  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  35.77 
 
 
511 aa  241  4e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2084  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
591 aa  241  4e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.557199 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.78 
 
 
518 aa  240  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  32.33 
 
 
549 aa  240  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 
508 aa  240  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  31.94 
 
 
569 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2110  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 
549 aa  238  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.333319  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  32.69 
 
 
521 aa  238  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  34.69 
 
 
511 aa  237  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 
512 aa  237  7e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
559 aa  236  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 
590 aa  236  9e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682843  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 
511 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  32.06 
 
 
498 aa  236  1.0000000000000001e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  34.66 
 
 
505 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>