More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4613 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 512 aa  1032    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  65.11 
 
 		 513 aa  655    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  88.54 
 
 		 515 aa  917    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  46.48 
 
 		 554 aa  474  1e-132  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  48.04 
 
 		 499 aa  460  9.999999999999999e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  44.82 
 
 		 505 aa  394  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  42.86 
 
 		 516 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  42.75 
 
 		 508 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  43.06 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  42.69 
 
 		 508 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2524  AMP-dependent synthetase and ligase  42.55 
 
 		 520 aa  372  1e-101  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.82155 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  39.13 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  39.13 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  38.93 
 
 		 496 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  38.58 
 
 		 496 aa  363  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  43.08 
 
 		 620 aa  358  9e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  42.01 
 
 		 491 aa  356  5.999999999999999e-97  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  42.13 
 
 		 503 aa  355  1e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  42.38 
 
 		 501 aa  349  9e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 		 496 aa  348  2e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  43.14 
 
 		 509 aa  343  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.89 
 
 		 529 aa  338  9e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  40.35 
 
 		 527 aa  332  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  39.96 
 
 		 518 aa  328  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 501 aa  323  6e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.94 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.94 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.94 
 
 		 517 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 		 517 aa  319  7e-86  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  39.77 
 
 		 528 aa  318  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.88 
 
 		 514 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  36.15 
 
 		 532 aa  304  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.03 
 
 		 512 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 		 517 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  37.4 
 
 		 521 aa  297  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  39.51 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  37.89 
 
 		 511 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.32 
 
 		 525 aa  294  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.45 
 
 		 509 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.11 
 
 		 526 aa  293  5e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  37.28 
 
 		 520 aa  292  9e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.11 
 
 		 525 aa  291  1e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1578  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 		 528 aa  289  9e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.24195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.14 
 
 		 519 aa  288  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 		 1043 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  32.48 
 
 		 501 aa  287  2.9999999999999996e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  39.02 
 
 		 486 aa  287  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.92 
 
 		 526 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.45 
 
 		 525 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.27 
 
 		 512 aa  284  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 662 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  37.06 
 
 		 490 aa  283  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0135  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 533 aa  283  6.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5944  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 532 aa  282  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.713256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.37 
 
 		 526 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  38.95 
 
 		 525 aa  281  2e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.86 
 
 		 510 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.76 
 
 		 525 aa  281  3e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.68 
 
 		 525 aa  280  3e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 510 aa  281  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  35.23 
 
 		 495 aa  280  3e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 520 aa  280  4e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 510 aa  280  5e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 510 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 510 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.63 
 
 		 524 aa  280  6e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  35.67 
 
 		 503 aa  280  6e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 510 aa  280  7e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 510 aa  279  7e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.45 
 
 		 510 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.45 
 
 		 510 aa  278  2e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  38.54 
 
 		 551 aa  277  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.66 
 
 		 510 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.63 
 
 		 527 aa  276  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 		 518 aa  276  6e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  36.12 
 
 		 490 aa  276  9e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  33.45 
 
 		 587 aa  273  6e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.2 
 
 		 549 aa  273  7e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4993  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  34.06 
 
 		 481 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 		 539 aa  272  1e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  38.24 
 
 		 525 aa  272  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  34.76 
 
 		 514 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2406  AMP-dependent synthetase and ligase  35.83 
 
 		 509 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0466191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  38.83 
 
 		 512 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  34.56 
 
 		 522 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5012  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.86 
 
 		 481 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 		 526 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.38 
 
 		 510 aa  269  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4684  AMP-dependent synthetase and ligase  38.09 
 
 		 526 aa  268  1e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  34.38 
 
 		 549 aa  268  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  34.46 
 
 		 517 aa  268  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4202  acyl-CoA synthetase  37.45 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269622  hitchhiker  0.00584314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.8 
 
 		 519 aa  268  2e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.67 
 
 		 513 aa  268  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  37.5 
 
 		 508 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4585  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.66 
 
 		 482 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4982  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 482 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  37.66 
 
 		 504 aa  266  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>