More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1135 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
517 aa  1038    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  49.5 
 
 
527 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  48.91 
 
 
528 aa  457  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  46.98 
 
 
508 aa  428  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  46.22 
 
 
508 aa  419  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  44.02 
 
 
532 aa  417  9.999999999999999e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  45.18 
 
 
516 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  45.53 
 
 
508 aa  412  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  45.47 
 
 
490 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  38.73 
 
 
499 aa  335  2e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  40.67 
 
 
512 aa  326  8.000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  40.7 
 
 
515 aa  325  1e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  41.92 
 
 
620 aa  323  4e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 
517 aa  316  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  41.3 
 
 
501 aa  312  9e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  39.71 
 
 
505 aa  312  9e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 
513 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  41.5 
 
 
509 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  37.47 
 
 
503 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  38.04 
 
 
512 aa  297  3e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0790536 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  39.09 
 
 
520 aa  296  6e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  38.63 
 
 
501 aa  292  1e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  38.65 
 
 
529 aa  290  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  32.72 
 
 
496 aa  285  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 
554 aa  285  1.0000000000000001e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  36.59 
 
 
520 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
496 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
496 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.61 
 
 
525 aa  283  7.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  32.92 
 
 
496 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  37.79 
 
 
520 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
520 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  36.91 
 
 
515 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1016  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
507 aa  273  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0745502 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  37.74 
 
 
516 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  37.62 
 
 
509 aa  273  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  39.1 
 
 
518 aa  270  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 
1043 aa  269  8e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  33.73 
 
 
503 aa  266  7e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.19 
 
 
486 aa  265  1e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  37.9 
 
 
534 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 
492 aa  264  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.49 
 
 
509 aa  264  3e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  37.25 
 
 
511 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  36.48 
 
 
523 aa  263  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.96 
 
 
525 aa  263  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 
506 aa  262  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 
490 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.61 
 
 
527 aa  262  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.48 
 
 
525 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3890  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 
517 aa  261  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0529507  normal  0.227811 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  34.48 
 
 
504 aa  261  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.31 
 
 
519 aa  261  3e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  36.19 
 
 
520 aa  259  7e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 
521 aa  259  9e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5763  AMP-dependent synthetase and ligase  38.07 
 
 
500 aa  258  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
525 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  38.94 
 
 
491 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 
526 aa  258  2e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
501 aa  258  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
501 aa  258  3e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.15 
 
 
526 aa  257  4e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5364  acyl-CoA synthetase  37.04 
 
 
536 aa  256  7e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.868662  normal  0.0358165 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 
517 aa  256  9e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 
512 aa  256  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.39 
 
 
519 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4758  AMP-dependent synthetase and ligase  35.24 
 
 
518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.4 
 
 
518 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 
501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 
519 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.16 
 
 
530 aa  252  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.58 
 
 
525 aa  252  1e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2524  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 
520 aa  250  4e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.82155 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4075  AMP-dependent synthetase and ligase  34.94 
 
 
521 aa  250  5e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.05 
 
 
514 aa  250  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 
770 aa  249  1e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6078  acyl-CoA synthetase  36.83 
 
 
536 aa  249  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 
518 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1763  AMP-dependent synthetase and ligase  37.83 
 
 
521 aa  249  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  35.17 
 
 
518 aa  248  2e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  32.81 
 
 
518 aa  248  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4181  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 
527 aa  247  3e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.99 
 
 
524 aa  247  4e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  35.63 
 
 
530 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  36.83 
 
 
502 aa  246  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  35.97 
 
 
518 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.35 
 
 
525 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3426  AMP-binding protein  31.73 
 
 
500 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.473482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1261  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 
546 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0532703  hitchhiker  0.000000308481 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.59 
 
 
517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4691  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 
502 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.59 
 
 
517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5942  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
516 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.050377 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.59 
 
 
517 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0558  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 
584 aa  244  3e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  34.94 
 
 
512 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 
662 aa  244  3.9999999999999997e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  37.78 
 
 
485 aa  244  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5134  acyl-CoA synthetase / AMP-dependent synthetase and ligase  34.85 
 
 
517 aa  243  3.9999999999999997e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.93936 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 
518 aa  243  3.9999999999999997e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>