More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0135 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0135  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 533 aa  1084    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1578  AMP-dependent synthetase and ligase  58.37 
 
 		 528 aa  606  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.24195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2524  AMP-dependent synthetase and ligase  43.74 
 
 		 520 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.82155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  37.65 
 
 		 499 aa  321  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 		 513 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  37.3 
 
 		 505 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 508 aa  300  6e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  35.78 
 
 		 508 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 515 aa  296  8e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  34.56 
 
 		 516 aa  295  1e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 512 aa  292  8e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  35.01 
 
 		 508 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 554 aa  280  4e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  31.33 
 
 		 496 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  31.33 
 
 		 496 aa  280  6e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  31.33 
 
 		 496 aa  278  1e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 		 496 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 501 aa  275  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.56 
 
 		 503 aa  273  5.000000000000001e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  37.52 
 
 		 620 aa  272  1e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 509 aa  266  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  35.06 
 
 		 496 aa  265  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  35.84 
 
 		 491 aa  262  1e-68  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  31.39 
 
 		 529 aa  257  3e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 517 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  33.99 
 
 		 501 aa  253  4.0000000000000004e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  35.74 
 
 		 509 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 		 518 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 517 aa  235  1.0000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1016  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 507 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745502 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 520 aa  233  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 527 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  32.81 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.2 
 
 		 517 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.2 
 
 		 517 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.2 
 
 		 517 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 520 aa  224  3e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 526 aa  223  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 528 aa  223  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 493 aa  221  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  29.68 
 
 		 560 aa  220  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  31.74 
 
 		 525 aa  219  7e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0131  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.3 
 
 		 570 aa  219  7.999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  32.26 
 
 		 576 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  30.27 
 
 		 516 aa  219  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.68 
 
 		 519 aa  219  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  31.1 
 
 		 544 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  31.46 
 
 		 576 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.44 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  31.43 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 520 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 		 525 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 		 1043 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  31.92 
 
 		 576 aa  217  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4080  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 518 aa  216  7e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.656205  normal  0.161644 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.32 
 
 		 525 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  33.11 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 511 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.4 
 
 		 518 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.75 
 
 		 513 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  28.68 
 
 		 549 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4472  AMP-dependent synthetase and ligase  32.11 
 
 		 517 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  28.6 
 
 		 550 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.09 
 
 		 525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.92 
 
 		 525 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1095  AMP-dependent synthetase and ligase  32.83 
 
 		 518 aa  213  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1034  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 512 aa  213  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0790536 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  30.92 
 
 		 575 aa  213  7e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1159  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.88 
 
 		 486 aa  213  7e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.498459  hitchhiker  0.000208098 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.5 
 
 		 592 aa  213  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  29.29 
 
 		 596 aa  212  1e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  31.46 
 
 		 577 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.2 
 
 		 553 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2485  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 534 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  32.9 
 
 		 596 aa  212  2e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  32.08 
 
 		 564 aa  211  2e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3720  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 518 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.189603  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3993  AMP-dependent synthetase and ligase  31.8 
 
 		 524 aa  211  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.968795  normal  0.880097 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3816  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 518 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0163789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0714  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.41 
 
 		 579 aa  210  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.93 
 
 		 556 aa  210  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.356608  normal  0.265858 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  29.49 
 
 		 574 aa  210  5e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  28.79 
 
 		 549 aa  210  5e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  26.96 
 
 		 587 aa  210  6e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.31 
 
 		 556 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0124  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.31 
 
 		 556 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.514213  normal  0.109541 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 		 544 aa  209  8e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  27.75 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.35 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.671788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  30.88 
 
 		 576 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 539 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.1 
 
 		 519 aa  208  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  30.52 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  29.42 
 
 		 518 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  31.67 
 
 		 538 aa  208  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  30.52 
 
 		 576 aa  208  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  30.52 
 
 		 576 aa  208  3e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  29.13 
 
 		 552 aa  207  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1676  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.93 
 
 		 526 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.591328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>