More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0367 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4613  AMP-dependent synthetase and ligase  65.11 
 
 
512 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.499912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0367  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
513 aa  1042    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.379931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  63.87 
 
 
515 aa  650    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.866195  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5453  AMP-dependent synthetase and ligase  48.68 
 
 
554 aa  491  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.400076 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  45.17 
 
 
499 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  41.75 
 
 
508 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  40.48 
 
 
508 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2524  AMP-dependent synthetase and ligase  41.22 
 
 
520 aa  361  2e-98  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.82155 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  40.7 
 
 
516 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  40.16 
 
 
508 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  39.21 
 
 
503 aa  356  5e-97  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  40.24 
 
 
501 aa  352  7e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  39.92 
 
 
505 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 
509 aa  347  4e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0415  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 
620 aa  343  5e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.784497  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  41.54 
 
 
491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.0961293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1789  acyl-CoA synthetase  37.38 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0554946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2327  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.940747  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1928  acyl-CoA synthetase  37.38 
 
 
496 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.132163  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1964  acyl-CoA synthetase  37.18 
 
 
496 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000141031 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  39.53 
 
 
518 aa  333  4e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  36.95 
 
 
529 aa  332  8e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1746  acyl-CoA synthetase  36.78 
 
 
496 aa  331  2e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0311  AMP-dependent synthetase and ligase  38.36 
 
 
501 aa  329  7e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0140314 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4900  AMP-dependent synthetase and ligase  38.65 
 
 
527 aa  318  1e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309388  normal  0.552445 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4810  AMP-dependent synthetase and ligase  38.05 
 
 
528 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.672528  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  37.16 
 
 
503 aa  311  2e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.7 
 
 
517 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.7 
 
 
517 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  37.7 
 
 
517 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0047  AMP-dependent synthetase and ligase  34.48 
 
 
517 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0135  AMP-dependent synthetase and ligase  36.43 
 
 
533 aa  299  7e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1135  AMP-dependent synthetase and ligase  37.92 
 
 
517 aa  298  1e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.755647  hitchhiker  0.000174804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.63 
 
 
530 aa  296  5e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 
501 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0218  AMP-dependent synthetase and ligase  34.51 
 
 
501 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.98 
 
 
514 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.37 
 
 
512 aa  288  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1578  AMP-dependent synthetase and ligase  36.85 
 
 
528 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.24195  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1868  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.33 
 
 
525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.205754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  35.38 
 
 
662 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.41 
 
 
526 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  38.31 
 
 
539 aa  282  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 
518 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  36.95 
 
 
504 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.02 
 
 
518 aa  280  5e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  38.64 
 
 
512 aa  279  8e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 
518 aa  279  1e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1704  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  34.42 
 
 
532 aa  278  1e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.49493  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04628  acyl-CoA synthetase  35.42 
 
 
490 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.02 
 
 
518 aa  278  2e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.62 
 
 
524 aa  278  2e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.33 
 
 
525 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.87 
 
 
518 aa  277  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  36.53 
 
 
504 aa  276  7e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  36.14 
 
 
508 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.14 
 
 
519 aa  274  3e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.13 
 
 
525 aa  274  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 
520 aa  273  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 
495 aa  273  7e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.6 
 
 
518 aa  273  8.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  38.8 
 
 
502 aa  272  8.000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3076  acyl-CoA synthetase  33.59 
 
 
545 aa  272  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1488  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 
525 aa  272  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0982209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.67 
 
 
518 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1133  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 
518 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.508244  normal  0.50206 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0778  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.67 
 
 
518 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 
509 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  36.55 
 
 
509 aa  270  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0832  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.67 
 
 
518 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0876  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.67 
 
 
518 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  34.83 
 
 
1043 aa  270  5e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.48 
 
 
518 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 
525 aa  270  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4891  AMP-dependent synthetase and ligase  36.25 
 
 
520 aa  270  7e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.862065  normal  0.74496 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1666  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 
518 aa  269  8.999999999999999e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144653  normal  0.373713 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.75 
 
 
525 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  35.92 
 
 
526 aa  268  2e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  33.72 
 
 
514 aa  267  2.9999999999999995e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.97 
 
 
521 aa  267  4e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 
511 aa  266  7e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2806  acyl-CoA synthetase  34.17 
 
 
556 aa  266  8e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.688057 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1211  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.31 
 
 
527 aa  266  8.999999999999999e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
526 aa  265  1e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1595  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
519 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  35.8 
 
 
503 aa  264  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1597  AMP-dependent synthetase and ligase  36.07 
 
 
549 aa  264  3e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000318079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.99 
 
 
510 aa  264  3e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  35.7 
 
 
504 aa  264  3e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.92 
 
 
510 aa  264  4e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 
520 aa  263  4e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 
490 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.92 
 
 
510 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  34.63 
 
 
520 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.92 
 
 
510 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.92 
 
 
510 aa  263  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1865  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.21 
 
 
519 aa  263  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.975513  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 
526 aa  263  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  35.2 
 
 
566 aa  263  8e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.86 
 
 
510 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>