More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3834 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  68.99 
 
 
506 aa  716    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  64.61 
 
 
501 aa  668    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  64.61 
 
 
501 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  69.58 
 
 
504 aa  745    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  100 
 
 
504 aa  1037    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  64.21 
 
 
503 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  60.12 
 
 
504 aa  620  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  58.96 
 
 
504 aa  614  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  58.63 
 
 
508 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  57.65 
 
 
510 aa  599  1e-170  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  57.57 
 
 
504 aa  595  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  58.76 
 
 
503 aa  596  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  55.98 
 
 
511 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  55.78 
 
 
503 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  57.03 
 
 
507 aa  580  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  56.57 
 
 
503 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  56.72 
 
 
507 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  54.98 
 
 
505 aa  575  1.0000000000000001e-163  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  55.4 
 
 
510 aa  571  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  55.16 
 
 
506 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  55.21 
 
 
510 aa  570  1e-161  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  54.37 
 
 
518 aa  565  1e-160  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  56.06 
 
 
510 aa  559  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  58.39 
 
 
509 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  55.25 
 
 
504 aa  548  1e-154  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  53.48 
 
 
504 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  54.03 
 
 
509 aa  533  1e-150  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  56.49 
 
 
526 aa  524  1e-147  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  55.37 
 
 
536 aa  516  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  54.04 
 
 
512 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  52.59 
 
 
517 aa  511  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  53.39 
 
 
506 aa  512  1e-144  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  53.42 
 
 
501 aa  510  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  53.42 
 
 
519 aa  510  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  53.21 
 
 
519 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  56.9 
 
 
517 aa  503  1e-141  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  54.58 
 
 
511 aa  500  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  51.95 
 
 
506 aa  501  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  54.75 
 
 
485 aa  495  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  55.7 
 
 
500 aa  496  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  50.2 
 
 
507 aa  493  9.999999999999999e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  52.9 
 
 
539 aa  487  1e-136  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  51.42 
 
 
547 aa  483  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  50 
 
 
530 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  50.62 
 
 
510 aa  447  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  44.1 
 
 
507 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  44.07 
 
 
504 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  41.31 
 
 
502 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  38.61 
 
 
553 aa  309  6.999999999999999e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  38.12 
 
 
507 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  37.14 
 
 
525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 
561 aa  300  4e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 
582 aa  300  4e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.06 
 
 
561 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  36.52 
 
 
566 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  36.51 
 
 
539 aa  298  1e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 
563 aa  298  2e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 
563 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.25 
 
 
561 aa  298  2e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.04 
 
 
561 aa  297  3e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.86 
 
 
561 aa  294  3e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4638  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.06 
 
 
582 aa  292  8e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4422  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.06 
 
 
563 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.841946  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  35.63 
 
 
561 aa  292  1e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4763  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.06 
 
 
563 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.491645  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  36.99 
 
 
569 aa  292  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  35.87 
 
 
559 aa  289  7e-77  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  36.33 
 
 
514 aa  289  8e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 
557 aa  287  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  36.08 
 
 
520 aa  286  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  37.01 
 
 
513 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2858  AMP-dependent synthetase and ligase  37.61 
 
 
485 aa  283  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34 
 
 
510 aa  283  7.000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34 
 
 
510 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34 
 
 
510 aa  281  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.8 
 
 
510 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4160  AMP-dependent synthetase and ligase  36.21 
 
 
499 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.365856  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 
492 aa  281  2e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  39.79 
 
 
480 aa  281  2e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34 
 
 
510 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.6 
 
 
510 aa  281  2e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 
510 aa  280  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.8 
 
 
510 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.23 
 
 
500 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.8 
 
 
510 aa  280  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.8 
 
 
510 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 
512 aa  280  4e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
506 aa  280  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.94 
 
 
510 aa  279  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 
577 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.305311  hitchhiker  0.00000703503 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  34.09 
 
 
495 aa  278  1e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  36.02 
 
 
503 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  35.48 
 
 
521 aa  278  2e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.96 
 
 
502 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  35.57 
 
 
514 aa  276  5e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.22 
 
 
512 aa  276  7e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  35.88 
 
 
510 aa  275  1.0000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.5 
 
 
521 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
498 aa  274  3e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  34.66 
 
 
493 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>