More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3918 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  100 
 
 		 549 aa  1110    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  69.36 
 
 		 547 aa  788    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  70.22 
 
 		 547 aa  800    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  68.99 
 
 		 550 aa  781    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  67.89 
 
 		 547 aa  774    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  59.18 
 
 		 546 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  68.99 
 
 		 547 aa  784    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  70.72 
 
 		 547 aa  794    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  61.36 
 
 		 552 aa  674    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  51.13 
 
 		 549 aa  527  1e-148  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  49.27 
 
 		 539 aa  468  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.71 
 
 		 543 aa  437  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  43.51 
 
 		 1004 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  45.05 
 
 		 541 aa  389  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  40.15 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  37.76 
 
 		 555 aa  354  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  36.86 
 
 		 546 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  36.86 
 
 		 546 aa  335  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  36.86 
 
 		 546 aa  334  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  36.91 
 
 		 546 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  36.85 
 
 		 546 aa  333  4e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  37.38 
 
 		 548 aa  326  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  37.2 
 
 		 546 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  37.2 
 
 		 566 aa  323  6e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  37.2 
 
 		 548 aa  323  6e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  37.2 
 
 		 566 aa  323  6e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  37.01 
 
 		 548 aa  319  9e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  36.82 
 
 		 548 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 517 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  33.88 
 
 		 543 aa  303  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  34.2 
 
 		 550 aa  297  4e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  36.18 
 
 		 540 aa  290  5.0000000000000004e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  38.78 
 
 		 503 aa  289  9e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  37.03 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 		 567 aa  281  3e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.85 
 
 		 518 aa  277  4e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  37.12 
 
 		 498 aa  272  9e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  36.1 
 
 		 552 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  32.04 
 
 		 549 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 534 aa  267  5e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  35.7 
 
 		 630 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  32.54 
 
 		 553 aa  260  4e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  34.24 
 
 		 549 aa  258  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 		 513 aa  258  2e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 552 aa  256  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.9 
 
 		 542 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  33.76 
 
 		 549 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  32.6 
 
 		 568 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  36.14 
 
 		 526 aa  252  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 525 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  34.1 
 
 		 538 aa  251  2e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  34.85 
 
 		 557 aa  251  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  34.92 
 
 		 562 aa  250  5e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  31.87 
 
 		 587 aa  249  7e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  34.55 
 
 		 512 aa  249  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  32.96 
 
 		 560 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  34.12 
 
 		 557 aa  246  6.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  32.78 
 
 		 549 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 550 aa  246  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 552 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  33.7 
 
 		 557 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  34.81 
 
 		 543 aa  244  3e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 542 aa  244  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  30.13 
 
 		 558 aa  243  5e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  34.61 
 
 		 564 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  32.53 
 
 		 560 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  30.29 
 
 		 549 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  33.6 
 
 		 538 aa  241  4e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  32.72 
 
 		 560 aa  240  5e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.35 
 
 		 552 aa  239  9e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  30.29 
 
 		 549 aa  239  9e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.16 
 
 		 540 aa  239  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  34.02 
 
 		 549 aa  239  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 1043 aa  239  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 530 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0148671 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  33.15 
 
 		 562 aa  238  3e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 544 aa  237  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  29.26 
 
 		 550 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.93 
 
 		 538 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  32.36 
 
 		 576 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  32.67 
 
 		 577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  31.03 
 
 		 579 aa  236  1.0000000000000001e-60  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  31.86 
 
 		 573 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.13 
 
 		 538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  32.17 
 
 		 565 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.73 
 
 		 538 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  29.74 
 
 		 547 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 596 aa  235  2.0000000000000002e-60  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.02 
 
 		 566 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  29.74 
 
 		 549 aa  234  3e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  34.21 
 
 		 524 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  34.61 
 
 		 564 aa  233  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  32.41 
 
 		 560 aa  233  6e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  32.29 
 
 		 576 aa  233  9e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  34.25 
 
 		 564 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  32.22 
 
 		 560 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>