More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4497 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  98.6 
 
 		 500 aa  993    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 500 aa  1004    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 500 aa  1004    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  79.64 
 
 		 503 aa  793    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  76.1 
 
 		 498 aa  744    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 		 540 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  42.58 
 
 		 541 aa  332  1e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  38.25 
 
 		 543 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.38 
 
 		 549 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  34.99 
 
 		 546 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  34.54 
 
 		 546 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  34.8 
 
 		 546 aa  287  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  34.8 
 
 		 546 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  34.8 
 
 		 546 aa  286  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  38.25 
 
 		 550 aa  286  5e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.75 
 
 		 547 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  34.04 
 
 		 548 aa  281  2e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.77 
 
 		 546 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.88 
 
 		 547 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  34.16 
 
 		 546 aa  279  6e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  33.91 
 
 		 548 aa  279  7e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  34.3 
 
 		 566 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 548 aa  279  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  34.3 
 
 		 566 aa  279  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.61 
 
 		 547 aa  277  3e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.44 
 
 		 547 aa  276  6e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  34.17 
 
 		 548 aa  276  8e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  34.1 
 
 		 555 aa  273  5.000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.48 
 
 		 549 aa  273  7e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.53 
 
 		 547 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.47 
 
 		 539 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.12 
 
 		 552 aa  258  1e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 503 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 534 aa  249  7e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  32.11 
 
 		 543 aa  247  3e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 526 aa  247  4e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 534 aa  243  5e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  33.4 
 
 		 1004 aa  236  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  34.05 
 
 		 512 aa  236  9e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  31.13 
 
 		 549 aa  232  1e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 542 aa  227  5.0000000000000005e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  31.46 
 
 		 550 aa  223  7e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 527 aa  221  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  29.45 
 
 		 517 aa  217  4e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 506 aa  212  1e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4137  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 554 aa  212  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 545 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  33.46 
 
 		 552 aa  210  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  33.06 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 524 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  33.08 
 
 		 508 aa  206  9e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 630 aa  206  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.75 
 
 		 510 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  31.09 
 
 		 550 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  30.11 
 
 		 576 aa  202  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 531 aa  202  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  29.7 
 
 		 549 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 534 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4133  AMP-dependent synthetase and ligase  33.79 
 
 		 497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  29.58 
 
 		 549 aa  200  6e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.13 
 
 		 513 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.47 
 
 		 514 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0315  AMP-dependent synthetase and ligase  29.58 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  29.31 
 
 		 549 aa  197  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 1043 aa  197  3e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  30.56 
 
 		 552 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 		 520 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 562 aa  196  6e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  35.55 
 
 		 532 aa  196  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  30.74 
 
 		 562 aa  196  7e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  28.84 
 
 		 587 aa  196  8.000000000000001e-49  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  26.41 
 
 		 518 aa  196  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.37 
 
 		 538 aa  196  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 512 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.37 
 
 		 538 aa  196  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  29.02 
 
 		 552 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.69 
 
 		 538 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.69 
 
 		 538 aa  195  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.79 
 
 		 540 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.37 
 
 		 538 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 523 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.56 
 
 		 538 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.69 
 
 		 538 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  30.77 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 523 aa  194  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  30.92 
 
 		 506 aa  194  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17630  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  30.04 
 
 		 592 aa  194  4e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.100128  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  31.4 
 
 		 511 aa  193  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3317  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 508 aa  193  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 522 aa  193  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 518 aa  193  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0102  AMP-dependent synthetase and ligase  30.02 
 
 		 520 aa  193  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13106  fatty-acid-CoA ligase fadD13  31.5 
 
 		 503 aa  193  7e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.5 
 
 		 538 aa  193  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  32.07 
 
 		 493 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.5 
 
 		 538 aa  192  9e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  30.6 
 
 		 541 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  33.65 
 
 		 507 aa  192  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  31.85 
 
 		 543 aa  192  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  34.29 
 
 		 533 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>