More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2523 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  68.32 
 
 		 531 aa  698    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  78.69 
 
 		 523 aa  789    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 534 aa  1072    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  79.27 
 
 		 533 aa  795    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  78.69 
 
 		 523 aa  789    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  81.46 
 
 		 532 aa  854    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  38.87 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 526 aa  278  1e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  40.12 
 
 		 503 aa  277  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  34.72 
 
 		 555 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  33.21 
 
 		 546 aa  260  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  33.21 
 
 		 546 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  33.21 
 
 		 546 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  33.21 
 
 		 546 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  33.21 
 
 		 546 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  32.51 
 
 		 546 aa  258  3e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  32.32 
 
 		 548 aa  257  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  32.32 
 
 		 566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  32.32 
 
 		 566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  32.13 
 
 		 548 aa  254  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  33.08 
 
 		 548 aa  249  9e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  32.39 
 
 		 548 aa  248  2e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  36.57 
 
 		 527 aa  239  6.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.88 
 
 		 543 aa  230  4e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  29.74 
 
 		 543 aa  230  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.23 
 
 		 539 aa  226  7e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 503 aa  225  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  35.05 
 
 		 540 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.82 
 
 		 518 aa  224  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.23 
 
 		 550 aa  223  6e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.7 
 
 		 547 aa  218  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.69 
 
 		 549 aa  214  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 500 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.99 
 
 		 498 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 534 aa  209  7e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 500 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  33.95 
 
 		 500 aa  209  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.85 
 
 		 546 aa  209  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  27.04 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  28.89 
 
 		 550 aa  207  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  29.7 
 
 		 552 aa  205  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.74 
 
 		 1004 aa  204  3e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.49 
 
 		 547 aa  203  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.7 
 
 		 549 aa  203  5e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.04 
 
 		 547 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.94 
 
 		 547 aa  203  7e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  33.73 
 
 		 543 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 		 517 aa  200  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  33.77 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.36 
 
 		 552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  33.02 
 
 		 630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 533 aa  197  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  28.4 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 508 aa  193  7e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  30.3 
 
 		 552 aa  193  7e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.8 
 
 		 547 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.92 
 
 		 512 aa  193  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 513 aa  192  1e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  32.14 
 
 		 538 aa  192  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.99 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.99 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.99 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.08 
 
 		 567 aa  191  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  32.13 
 
 		 539 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 510 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.77 
 
 		 549 aa  191  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.66 
 
 		 553 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  31.87 
 
 		 546 aa  189  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  32.7 
 
 		 546 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  32.41 
 
 		 518 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 1043 aa  189  1e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  33.08 
 
 		 546 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  31.41 
 
 		 538 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.07 
 
 		 525 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  29.18 
 
 		 551 aa  187  4e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.93 
 
 		 520 aa  187  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.42 
 
 		 503 aa  187  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5286  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.78 
 
 		 523 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.680641  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  30.19 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  30.19 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  30.19 
 
 		 570 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 527 aa  185  2.0000000000000003e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  29.49 
 
 		 576 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 566 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  31.06 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  30.16 
 
 		 552 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  30.18 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  31.19 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  31.19 
 
 		 540 aa  184  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  30.02 
 
 		 552 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  30.72 
 
 		 574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  30.44 
 
 		 575 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  30.44 
 
 		 575 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  30 
 
 		 570 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  28.95 
 
 		 570 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  30.92 
 
 		 576 aa  183  8.000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  29.13 
 
 		 550 aa  183  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  31.02 
 
 		 575 aa  182  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  27.49 
 
 		 554 aa  182  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>