More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4107 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  68.99 
 
 		 549 aa  781    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  61.83 
 
 		 552 aa  690    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  72.11 
 
 		 547 aa  828    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  100 
 
 		 550 aa  1126    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  71.93 
 
 		 547 aa  828    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  59.18 
 
 		 546 aa  656    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  76.47 
 
 		 547 aa  867    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  72.66 
 
 		 547 aa  832    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  82.32 
 
 		 547 aa  935    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  51.32 
 
 		 549 aa  540  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  48.26 
 
 		 539 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.14 
 
 		 543 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  43.46 
 
 		 541 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  42.04 
 
 		 1004 aa  385  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  41.65 
 
 		 534 aa  363  4e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  38.38 
 
 		 555 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  38.96 
 
 		 546 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  38.96 
 
 		 546 aa  351  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  38.96 
 
 		 546 aa  350  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  38.78 
 
 		 546 aa  350  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  38.96 
 
 		 546 aa  349  8e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  38.59 
 
 		 548 aa  340  4e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  38.4 
 
 		 546 aa  339  9e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  38.4 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  38.4 
 
 		 548 aa  337  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  38.4 
 
 		 566 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  38.22 
 
 		 548 aa  335  9e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  38.22 
 
 		 548 aa  333  5e-90  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 		 517 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  34.69 
 
 		 550 aa  296  5e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  32.85 
 
 		 543 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 500 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 500 aa  286  5.999999999999999e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 500 aa  286  9e-76  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 540 aa  283  5.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  37.73 
 
 		 498 aa  281  3e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  34.77 
 
 		 534 aa  281  3e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  38.86 
 
 		 567 aa  280  5e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  33.08 
 
 		 549 aa  279  7e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  35.65 
 
 		 503 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.38 
 
 		 630 aa  268  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 552 aa  267  2.9999999999999995e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  36.33 
 
 		 512 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.18 
 
 		 518 aa  260  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  33.87 
 
 		 513 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  34.54 
 
 		 526 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  33.39 
 
 		 549 aa  251  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 525 aa  249  1e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 		 520 aa  247  4e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  33.03 
 
 		 549 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  34.06 
 
 		 552 aa  246  6.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.4 
 
 		 526 aa  246  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  32.3 
 
 		 576 aa  239  1e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  37.2 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  31.88 
 
 		 549 aa  238  3e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  32.14 
 
 		 542 aa  237  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  32.08 
 
 		 524 aa  236  7e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  31.25 
 
 		 550 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  32.71 
 
 		 543 aa  234  4.0000000000000004e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.05 
 
 		 552 aa  233  5e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  32.3 
 
 		 544 aa  233  7.000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  32.62 
 
 		 549 aa  233  7.000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  32.48 
 
 		 552 aa  232  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  32.49 
 
 		 562 aa  231  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  30.05 
 
 		 587 aa  231  2e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  31.04 
 
 		 553 aa  231  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.45 
 
 		 542 aa  232  2e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  32.31 
 
 		 557 aa  229  7e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 533 aa  229  1e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  29.82 
 
 		 574 aa  229  1e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  30.8 
 
 		 548 aa  229  1e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  31 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 524 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  31.77 
 
 		 521 aa  228  3e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  30.96 
 
 		 547 aa  227  4e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  31.63 
 
 		 564 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 512 aa  225  1e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  30.24 
 
 		 578 aa  225  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 541 aa  224  2e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2328  AMP-binding domain protein  31.65 
 
 		 561 aa  225  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3009  AMP-binding domain protein  31.89 
 
 		 546 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  32.59 
 
 		 550 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 550 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  31.69 
 
 		 564 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  31.89 
 
 		 546 aa  224  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29.91 
 
 		 538 aa  223  6e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  32.58 
 
 		 538 aa  223  6e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  31.82 
 
 		 557 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  29.87 
 
 		 570 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.15 
 
 		 538 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  32.35 
 
 		 550 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  28.76 
 
 		 548 aa  222  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.15 
 
 		 538 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.88 
 
 		 1043 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  31.6 
 
 		 557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  30.76 
 
 		 560 aa  222  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  32.06 
 
 		 570 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 527 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  30.24 
 
 		 574 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  31.96 
 
 		 551 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>