More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2335 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
567 aa  1100    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  40.99 
 
 
547 aa  304  3.0000000000000004e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  40.61 
 
 
547 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  40.92 
 
 
547 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  39.32 
 
 
547 aa  300  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.86 
 
 
546 aa  297  4e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  40.23 
 
 
549 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  40.08 
 
 
547 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.5 
 
 
552 aa  293  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  38.86 
 
 
550 aa  292  1e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.79 
 
 
543 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  40.35 
 
 
539 aa  277  4e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.45 
 
 
549 aa  266  1e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  34.44 
 
 
534 aa  264  4e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
546 aa  241  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
546 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
546 aa  240  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  33.2 
 
 
546 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.6 
 
 
1004 aa  239  1e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  33.4 
 
 
546 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  34.5 
 
 
555 aa  234  3e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  33.33 
 
 
543 aa  231  3e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  40.26 
 
 
541 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 
508 aa  224  4e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  32.61 
 
 
548 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  32.75 
 
 
546 aa  219  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  32.6 
 
 
517 aa  219  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  32.22 
 
 
566 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  32.22 
 
 
566 aa  218  2e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  32.22 
 
 
548 aa  218  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  29.3 
 
 
518 aa  217  5e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  32.02 
 
 
548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 
521 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
548 aa  213  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.92 
 
 
503 aa  213  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 
552 aa  211  3e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.67 
 
 
512 aa  209  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  28.94 
 
 
552 aa  207  3e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  29.01 
 
 
550 aa  207  3e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  29.52 
 
 
549 aa  206  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3066  AMP-dependent synthetase and ligase  31.18 
 
 
558 aa  206  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.479156  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  29.62 
 
 
544 aa  205  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  33.2 
 
 
518 aa  204  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4902  AMP-dependent synthetase and ligase  34.91 
 
 
501 aa  203  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  28.55 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  28.98 
 
 
549 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  32.68 
 
 
508 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  31.52 
 
 
570 aa  202  9.999999999999999e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  35.41 
 
 
531 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  30.24 
 
 
549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  32.87 
 
 
508 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  31.44 
 
 
552 aa  199  7.999999999999999e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1402  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
532 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 
541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 
630 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1614  AMP-dependent synthetase and ligase  34.57 
 
 
509 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 
558 aa  198  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000354199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  29.02 
 
 
549 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.75 
 
 
525 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  31.24 
 
 
499 aa  197  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3018  AMP-binding domain protein  31.83 
 
 
576 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3353  AMP-binding domain protein  31.83 
 
 
576 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2959  AMP-binding domain protein  31.83 
 
 
576 aa  196  6e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1584  AMP-binding domain protein  31.83 
 
 
570 aa  197  6e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 
540 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 
540 aa  197  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  34.68 
 
 
503 aa  197  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3819  O-succinylbenzoate-CoA ligase  32.14 
 
 
529 aa  196  7e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  35.29 
 
 
509 aa  196  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  30.59 
 
 
530 aa  196  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.34 
 
 
514 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  30.15 
 
 
576 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3204  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.94 
 
 
517 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.716175  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  29.28 
 
 
576 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 
534 aa  195  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3266  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.94 
 
 
517 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10141  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3215  O-succinylbenzoate-CoA ligase  33.94 
 
 
517 aa  195  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0554015  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  34.41 
 
 
534 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  32.9 
 
 
512 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4040  AMP-binding domain protein  31.65 
 
 
576 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0176  AMP-binding domain protein  31.65 
 
 
576 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.970705  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  31.69 
 
 
542 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3966  AMP-binding domain protein  31.46 
 
 
576 aa  194  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.32 
 
 
553 aa  194  5e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  31.27 
 
 
531 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  32.2 
 
 
540 aa  193  7e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  32.62 
 
 
516 aa  193  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  32.45 
 
 
526 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  28.96 
 
 
552 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 
500 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  29.67 
 
 
548 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  34.56 
 
 
500 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3306  AMP-binding domain protein  31.64 
 
 
576 aa  192  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  28.78 
 
 
552 aa  192  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.28 
 
 
513 aa  191  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 
500 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  30.62 
 
 
560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  25.36 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  30.64 
 
 
546 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0115  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.97 
 
 
556 aa  190  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>