More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1192 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  100 
 
 		 1004 aa  2008    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  51.8 
 
 		 534 aa  516  1e-144  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.58 
 
 		 546 aa  431  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.41 
 
 		 547 aa  412  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.87 
 
 		 549 aa  412  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.51 
 
 		 549 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  42 
 
 		 547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  42.6 
 
 		 547 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  44.29 
 
 		 547 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.33 
 
 		 552 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  42.52 
 
 		 547 aa  396  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  42.04 
 
 		 550 aa  389  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.34 
 
 		 543 aa  373  1e-101  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  43.28 
 
 		 539 aa  366  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  39.07 
 
 		 555 aa  344  5.999999999999999e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  37.43 
 
 		 546 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  37.43 
 
 		 546 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  37.43 
 
 		 546 aa  329  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  37.24 
 
 		 546 aa  328  5e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  37.05 
 
 		 546 aa  327  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  36.36 
 
 		 566 aa  323  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  36.36 
 
 		 566 aa  323  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  36.43 
 
 		 548 aa  323  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  36.24 
 
 		 548 aa  321  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  36.05 
 
 		 548 aa  320  7e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  36.24 
 
 		 548 aa  320  7e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  36.11 
 
 		 546 aa  318  3e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  40.75 
 
 		 541 aa  303  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  35.48 
 
 		 550 aa  288  5e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  35.95 
 
 		 540 aa  278  3e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  33.15 
 
 		 549 aa  273  2e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 517 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  33.52 
 
 		 543 aa  266  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  35.18 
 
 		 503 aa  260  8e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  36.55 
 
 		 526 aa  257  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  30.95 
 
 		 542 aa  252  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 534 aa  252  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0452  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.95 
 
 		 429 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.787043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  33.07 
 
 		 500 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 500 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 500 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  34.22 
 
 		 498 aa  239  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  31.57 
 
 		 552 aa  238  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  37.94 
 
 		 503 aa  238  6e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  31.47 
 
 		 540 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  31.55 
 
 		 540 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  31.47 
 
 		 540 aa  236  2.0000000000000002e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  31.19 
 
 		 552 aa  235  3e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0385  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.95 
 
 		 429 aa  234  5e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.90821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.43 
 
 		 549 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1467  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.49 
 
 		 429 aa  233  1e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1778  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 560 aa  233  1e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198659 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 596 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0149  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.82 
 
 		 433 aa  232  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4063  AMP-binding domain protein  32.76 
 
 		 560 aa  231  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.365849  normal  0.0336017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  31.1 
 
 		 549 aa  231  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 567 aa  229  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  31.98 
 
 		 560 aa  229  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 550 aa  229  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  31.99 
 
 		 560 aa  226  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.29 
 
 		 518 aa  227  1e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  29.3 
 
 		 550 aa  227  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  31.83 
 
 		 543 aa  225  3e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 552 aa  225  3e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  29.62 
 
 		 544 aa  225  4e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  29.91 
 
 		 568 aa  224  7e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0520  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  30.57 
 
 		 429 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 520 aa  222  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.63 
 
 		 510 aa  223  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 558 aa  222  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  32.54 
 
 		 518 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  32.31 
 
 		 549 aa  221  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2679  AMP-binding domain protein  32.88 
 
 		 561 aa  221  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.180976  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3655  AMP-binding domain protein  29.75 
 
 		 565 aa  221  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0315072 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  28.75 
 
 		 549 aa  219  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  31.13 
 
 		 539 aa  220  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  27.53 
 
 		 553 aa  219  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31470  AMP-binding domain protein  32.55 
 
 		 564 aa  219  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0028776  hitchhiker  0.0000000416298 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 512 aa  219  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  30.65 
 
 		 587 aa  219  2e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 544 aa  219  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  32.41 
 
 		 550 aa  219  2.9999999999999998e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  28.6 
 
 		 547 aa  218  4e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  28.69 
 
 		 570 aa  218  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0288  AMP-binding domain protein  31.77 
 
 		 564 aa  218  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0229323  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  28.42 
 
 		 574 aa  218  4e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  30.93 
 
 		 538 aa  218  5e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  31.39 
 
 		 630 aa  218  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  32.1 
 
 		 549 aa  217  8e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1904  AMP-binding domain protein  29.16 
 
 		 573 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0548  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  31.12 
 
 		 422 aa  215  2.9999999999999995e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  28.16 
 
 		 579 aa  215  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.02 
 
 		 506 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.02 
 
 		 506 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.02 
 
 		 506 aa  215  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 525 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  28.21 
 
 		 560 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  30.88 
 
 		 562 aa  214  9e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  31.71 
 
 		 557 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 551 aa  213  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>