More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4966 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  79.23 
 
 		 500 aa  791    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  80.61 
 
 		 498 aa  785    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  79.64 
 
 		 500 aa  793    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 503 aa  1001    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  79.64 
 
 		 500 aa  793    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  43.44 
 
 		 540 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  42.25 
 
 		 541 aa  326  7e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  35.81 
 
 		 546 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  35.81 
 
 		 546 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  35.81 
 
 		 546 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  35.81 
 
 		 546 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  35.81 
 
 		 546 aa  300  5e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.4 
 
 		 547 aa  293  4e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  38.78 
 
 		 549 aa  289  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  34.67 
 
 		 548 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  34.67 
 
 		 546 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  34.48 
 
 		 548 aa  284  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.74 
 
 		 546 aa  284  3.0000000000000004e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 548 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  34.67 
 
 		 548 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  34.87 
 
 		 566 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  34.64 
 
 		 555 aa  282  8.000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  34.87 
 
 		 566 aa  283  8.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.34 
 
 		 547 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.26 
 
 		 547 aa  280  4e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.33 
 
 		 543 aa  280  6e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.65 
 
 		 550 aa  278  1e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.07 
 
 		 547 aa  278  1e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.17 
 
 		 547 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.67 
 
 		 539 aa  269  8.999999999999999e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  41.21 
 
 		 503 aa  266  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.27 
 
 		 549 aa  265  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  34.11 
 
 		 534 aa  260  4e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.43 
 
 		 552 aa  258  2e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 526 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  35.31 
 
 		 512 aa  252  9.000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  33.27 
 
 		 534 aa  252  1e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.18 
 
 		 1004 aa  251  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  32.44 
 
 		 543 aa  246  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  31.44 
 
 		 549 aa  237  5.0000000000000005e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  32.05 
 
 		 550 aa  233  4.0000000000000004e-60  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  35.09 
 
 		 542 aa  232  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 		 531 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4133  AMP-dependent synthetase and ligase  36 
 
 		 497 aa  223  9e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 534 aa  216  7e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 541 aa  216  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  34.76 
 
 		 527 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  33.52 
 
 		 582 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.24 
 
 		 1043 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  34.23 
 
 		 508 aa  210  4e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  37.09 
 
 		 532 aa  211  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5871  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 545 aa  210  5e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  29.26 
 
 		 558 aa  210  6e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4137  AMP-dependent synthetase and ligase  33.08 
 
 		 554 aa  209  7e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  31.2 
 
 		 538 aa  209  7e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  32.69 
 
 		 540 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  32.69 
 
 		 540 aa  209  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.76 
 
 		 508 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  32.66 
 
 		 549 aa  207  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 511 aa  207  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 510 aa  207  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 		 517 aa  206  7e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 523 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  32.82 
 
 		 507 aa  206  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  35.28 
 
 		 523 aa  206  8e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  35.22 
 
 		 533 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  32.84 
 
 		 540 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  31.28 
 
 		 579 aa  205  2e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  29.27 
 
 		 552 aa  204  3e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  32.67 
 
 		 547 aa  204  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.8 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 		 551 aa  203  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 504 aa  203  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  31.51 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 518 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.71 
 
 		 526 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  33.91 
 
 		 524 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  29.62 
 
 		 576 aa  200  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3514  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.98 
 
 		 525 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.270509  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  29.76 
 
 		 550 aa  200  6e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.53 
 
 		 513 aa  200  6e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  29.24 
 
 		 549 aa  199  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  27.63 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  33.01 
 
 		 524 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1841  AMP-dependent synthetase and ligase  32.63 
 
 		 561 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.415178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  30.48 
 
 		 552 aa  199  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 630 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  30.36 
 
 		 562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.19 
 
 		 518 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  28.19 
 
 		 549 aa  197  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  32.76 
 
 		 552 aa  197  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 539 aa  196  6e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  26.16 
 
 		 518 aa  196  6e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  31.06 
 
 		 502 aa  196  7e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.49 
 
 		 540 aa  196  7e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3975  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.75 
 
 		 530 aa  196  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.251646  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 553 aa  196  8.000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2319  AMP-binding domain protein  31 
 
 		 565 aa  196  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.770298  normal  0.0254377 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>