More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4313 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 531 aa  1059    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  68.32 
 
 		 534 aa  698    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  70.64 
 
 		 523 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  70.64 
 
 		 523 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  69.73 
 
 		 532 aa  692    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  69.52 
 
 		 533 aa  696    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 541 aa  292  9e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 526 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  38.68 
 
 		 503 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 527 aa  271  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  35.17 
 
 		 546 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  35.17 
 
 		 546 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  35.17 
 
 		 546 aa  270  4e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  34.98 
 
 		 546 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  34.98 
 
 		 546 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  34.54 
 
 		 555 aa  267  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  34.52 
 
 		 548 aa  263  6e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  34.33 
 
 		 566 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  34.33 
 
 		 566 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  34.15 
 
 		 546 aa  261  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  34.33 
 
 		 548 aa  261  3e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  33.96 
 
 		 548 aa  255  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  33.77 
 
 		 548 aa  253  5.000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.5 
 
 		 549 aa  246  8e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.02 
 
 		 543 aa  243  5e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  36.66 
 
 		 503 aa  238  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.64 
 
 		 547 aa  237  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.21 
 
 		 547 aa  238  3e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.2 
 
 		 539 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  31.48 
 
 		 543 aa  232  1e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.28 
 
 		 546 aa  231  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  32.89 
 
 		 550 aa  230  4e-59  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 498 aa  228  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.76 
 
 		 547 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33.89 
 
 		 549 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.6 
 
 		 550 aa  228  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.4 
 
 		 547 aa  227  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 540 aa  226  6e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  35.79 
 
 		 1004 aa  224  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.54 
 
 		 552 aa  224  3e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31.13 
 
 		 518 aa  223  8e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 500 aa  217  5e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  32.9 
 
 		 547 aa  216  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 500 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  34.81 
 
 		 500 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  33.71 
 
 		 512 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 534 aa  211  4e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  32 
 
 		 534 aa  210  6e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  28.15 
 
 		 549 aa  207  4e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  30.95 
 
 		 549 aa  207  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  30.04 
 
 		 552 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  30.56 
 
 		 549 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.89 
 
 		 630 aa  200  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 567 aa  199  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0704794  normal  0.0458127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  29.41 
 
 		 549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 506 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  32.93 
 
 		 517 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  34.03 
 
 		 506 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2768  AMP-dependent synthetase and ligase  37.1 
 
 		 489 aa  197  4.0000000000000005e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.997978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  33.54 
 
 		 506 aa  197  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  32.6 
 
 		 539 aa  195  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 533 aa  195  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 513 aa  195  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  33.68 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4133  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 497 aa  193  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  30.88 
 
 		 499 aa  193  6e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2660  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 510 aa  192  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.161262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 		 566 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 508 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  30.67 
 
 		 552 aa  191  4e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  31.09 
 
 		 560 aa  191  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  31.79 
 
 		 508 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4694  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 506 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.107104  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 512 aa  189  7e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5079  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 506 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.216799 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4780  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 506 aa  190  7e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  29.17 
 
 		 552 aa  189  8e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3836  AMP-dependent synthetase and ligase  33.75 
 
 		 510 aa  189  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1667  AMP-binding domain protein  29.17 
 
 		 549 aa  189  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.327549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  29.31 
 
 		 552 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  29.65 
 
 		 550 aa  188  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  31.93 
 
 		 550 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2105  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 545 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  27.27 
 
 		 554 aa  187  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  30.54 
 
 		 575 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  30.54 
 
 		 575 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  31.65 
 
 		 538 aa  187  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  30.45 
 
 		 560 aa  187  6e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  32.39 
 
 		 540 aa  186  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  31.99 
 
 		 538 aa  186  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  33.59 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0807  AMP-dependent synthetase and ligase  33.46 
 
 		 551 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.472076  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  29.72 
 
 		 553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2861  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 508 aa  184  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.213595 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 843 aa  184  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2351  acyl-CoA synthetase  32.52 
 
 		 517 aa  184  4.0000000000000006e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.197387  normal  0.399216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1609  AMP-dependent synthetase and ligase  31.21 
 
 		 527 aa  184  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  29.21 
 
 		 574 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  28.81 
 
 		 550 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  31.23 
 
 		 557 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>