More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6815 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 526 aa  1063    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  46.22 
 
 		 527 aa  362  1e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0869  AMP-dependent synthetase and ligase  47.98 
 
 		 503 aa  356  5e-97  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.184154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  43.54 
 
 		 541 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  41.73 
 
 		 540 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  37.65 
 
 		 555 aa  280  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4313  AMP-dependent synthetase and ligase  37.82 
 
 		 531 aa  270  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2523  AMP-dependent synthetase and ligase  36.8 
 
 		 534 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.42746  normal  0.597233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4135  AMP-dependent synthetase and ligase  37.86 
 
 		 532 aa  267  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.434999 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  34.67 
 
 		 566 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  34.67 
 
 		 566 aa  261  2e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  34.8 
 
 		 548 aa  259  6e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  34.6 
 
 		 548 aa  258  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 		 548 aa  258  2e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  34.71 
 
 		 548 aa  257  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  34.6 
 
 		 546 aa  256  6e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.2 
 
 		 547 aa  256  7e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.54 
 
 		 550 aa  255  2.0000000000000002e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  35.92 
 
 		 546 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3657  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 		 523 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.497545  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  35.92 
 
 		 546 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3730  AMP-dependent synthetase and ligase  40.34 
 
 		 523 aa  254  4.0000000000000004e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.404089 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  35.92 
 
 		 546 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  35.92 
 
 		 546 aa  253  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  37.18 
 
 		 503 aa  253  6e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  35.92 
 
 		 546 aa  253  8.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3670  AMP-dependent synthetase and ligase  38.81 
 
 		 533 aa  252  9.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.75444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.14 
 
 		 549 aa  252  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.47 
 
 		 547 aa  251  2e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.09 
 
 		 543 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.3 
 
 		 539 aa  249  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  39.07 
 
 		 498 aa  249  8e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.76 
 
 		 552 aa  249  1e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.55 
 
 		 1004 aa  248  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 500 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  38.11 
 
 		 500 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 500 aa  247  4e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 517 aa  243  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.96 
 
 		 547 aa  242  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.23 
 
 		 547 aa  240  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.1 
 
 		 546 aa  239  8e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.07 
 
 		 547 aa  236  6e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  33 
 
 		 549 aa  229  9e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  35.15 
 
 		 534 aa  228  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8740  AMP-dependent synthetase and ligase  35.37 
 
 		 512 aa  222  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402683  normal  0.341368 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.55 
 
 		 518 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  32.73 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  31.29 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  32.73 
 
 		 549 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2360  AMP-dependent synthetase and ligase  35.92 
 
 		 552 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0362234 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 534 aa  206  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  30.38 
 
 		 587 aa  205  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4042  AMP-dependent synthetase and ligase  32.29 
 
 		 582 aa  204  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0775  AMP-dependent synthetase and ligase  34.35 
 
 		 583 aa  203  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.65 
 
 		 510 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  33 
 
 		 506 aa  202  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0851  acyl-CoA synthetase  33.74 
 
 		 504 aa  202  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0227528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  34.86 
 
 		 524 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 513 aa  200  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  30.57 
 
 		 558 aa  199  7e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4746  putative o-succinylbenzoate--CoA synthetase  32.69 
 
 		 601 aa  200  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0885272 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  32.01 
 
 		 513 aa  199  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  32.58 
 
 		 508 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0442  AMP-binding domain protein  31.56 
 
 		 571 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.89643  normal  0.841381 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0344  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 562 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.100012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30 
 
 		 553 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0682  AMP-dependent synthetase and ligase  29.62 
 
 		 530 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33180  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.1 
 
 		 509 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0193282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  32.4 
 
 		 525 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6078  AMP-dependent synthetase and ligase  33.06 
 
 		 553 aa  196  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.225727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  29.93 
 
 		 578 aa  196  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  31.53 
 
 		 552 aa  196  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  32.38 
 
 		 548 aa  196  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  30.58 
 
 		 549 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  30.88 
 
 		 570 aa  195  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0411  acyl-CoA synthetase  34.08 
 
 		 522 aa  194  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  31.59 
 
 		 552 aa  194  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.53 
 
 		 520 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3550  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 520 aa  193  7e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1498  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 531 aa  193  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3431  AMP-dependent synthetase and ligase  34.82 
 
 		 507 aa  193  8e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  32.86 
 
 		 524 aa  192  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0234  AMP-dependent synthetase and ligase  29.11 
 
 		 843 aa  192  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000591284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  33.76 
 
 		 487 aa  191  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  31.58 
 
 		 523 aa  192  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 506 aa  192  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  31.85 
 
 		 552 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  30.86 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 630 aa  190  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  30.26 
 
 		 552 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  33.89 
 
 		 520 aa  189  8e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  32.45 
 
 		 512 aa  189  9e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  31.11 
 
 		 560 aa  189  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1813  AMP-binding domain protein  31.64 
 
 		 560 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.258259 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5271  AMP-dependent synthetase and ligase  33.88 
 
 		 541 aa  188  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.675059 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  29.46 
 
 		 549 aa  188  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0866  AMP-dependent synthetase and ligase  31.19 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3661  AMP-binding domain protein  30.72 
 
 		 560 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000288335 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0333  AMP-binding domain protein  31.8 
 
 		 571 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>