More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1904 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  97.99 
 
 		 566 aa  1080    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  98.72 
 
 		 548 aa  1120    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  82.29 
 
 		 546 aa  941    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  82.1 
 
 		 546 aa  941    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  97.99 
 
 		 566 aa  1080    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  98.54 
 
 		 548 aa  1116    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  82.29 
 
 		 546 aa  945    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  96.51 
 
 		 546 aa  1060    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 548 aa  1137    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  82.29 
 
 		 546 aa  942    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  82.29 
 
 		 546 aa  942    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  98.72 
 
 		 548 aa  1120    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  71.8 
 
 		 555 aa  816    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  40.19 
 
 		 550 aa  426  1e-118  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  38.79 
 
 		 543 aa  424  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  38.97 
 
 		 549 aa  405  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  38.55 
 
 		 546 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  39.66 
 
 		 547 aa  366  1e-100  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  39.07 
 
 		 552 aa  358  1.9999999999999998e-97  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2400  AMP-dependent synthetase and ligase  37.05 
 
 		 534 aa  348  1e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0669706  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  38.22 
 
 		 550 aa  346  7e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  36.36 
 
 		 541 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.48 
 
 		 549 aa  343  5e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.31 
 
 		 547 aa  337  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.18 
 
 		 539 aa  337  3.9999999999999995e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.71 
 
 		 547 aa  336  7e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  36.69 
 
 		 547 aa  335  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  37.01 
 
 		 549 aa  332  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  35.65 
 
 		 547 aa  326  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  34.57 
 
 		 543 aa  320  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.43 
 
 		 1004 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  33.59 
 
 		 518 aa  309  9e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3489  AMP-dependent synthetase and ligase  34.72 
 
 		 540 aa  302  1e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  36.15 
 
 		 630 aa  289  8e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  32.58 
 
 		 552 aa  288  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  35.16 
 
 		 543 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  34.67 
 
 		 503 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  34.12 
 
 		 513 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  33.15 
 
 		 553 aa  286  8e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 500 aa  284  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 500 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 500 aa  282  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  35.39 
 
 		 541 aa  281  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 542 aa  279  9e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  34.31 
 
 		 552 aa  278  1e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  35.33 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  32.81 
 
 		 574 aa  276  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  33.76 
 
 		 547 aa  276  6e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  35.2 
 
 		 549 aa  276  7e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  32.95 
 
 		 539 aa  276  9e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  34.77 
 
 		 549 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  33.72 
 
 		 550 aa  275  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 539 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  32.97 
 
 		 575 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0610  AMP-binding domain protein  33.01 
 
 		 570 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  33.78 
 
 		 538 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  33.39 
 
 		 575 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01449  AMP-binding domain protein  32.42 
 
 		 579 aa  273  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.300352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  31.6 
 
 		 558 aa  273  7e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  33.85 
 
 		 498 aa  273  7e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0108  AMP-binding domain protein  32.78 
 
 		 575 aa  273  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  33.33 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  35.47 
 
 		 549 aa  272  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  33.64 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 549 aa  271  2e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  34.08 
 
 		 544 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  33.89 
 
 		 552 aa  271  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  32.57 
 
 		 538 aa  268  2e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  33.46 
 
 		 549 aa  268  2e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0042  AMP-binding domain protein  33.03 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  31.72 
 
 		 550 aa  268  2e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  33.03 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  33.03 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34080  AMP-binding domain protein  33.97 
 
 		 552 aa  268  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  33.21 
 
 		 575 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  32.02 
 
 		 540 aa  267  5e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2475  AMP-binding domain protein  31.99 
 
 		 574 aa  266  5e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0776889  normal  0.707205 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  32.29 
 
 		 578 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1963  AMP-binding domain protein  33.87 
 
 		 560 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.17114  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  32.02 
 
 		 540 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  32.02 
 
 		 540 aa  266  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  32.97 
 
 		 575 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5134  AMP-binding domain protein  33.27 
 
 		 518 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0657606  normal  0.735688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  31.63 
 
 		 570 aa  265  1e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2285  AMP-binding domain protein  31.8 
 
 		 570 aa  266  1e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0389499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  34.71 
 
 		 526 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2357  AMP-binding domain protein  31.99 
 
 		 570 aa  263  4e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0641132  normal  0.0814981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  31.44 
 
 		 570 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2014  AMP-dependent synthetase and ligase  31.98 
 
 		 542 aa  263  4.999999999999999e-69  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.534696  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  31.44 
 
 		 570 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  31.44 
 
 		 570 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.27 
 
 		 519 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  32.78 
 
 		 552 aa  262  1e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1679  AMP-binding domain protein  31.19 
 
 		 570 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0154  AMP-dependent synthetase and ligase  32.72 
 
 		 566 aa  262  2e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0473  AMP-binding domain protein  32.78 
 
 		 568 aa  262  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.25 
 
 		 1043 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  32.71 
 
 		 538 aa  261  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1467  AMP-binding domain protein  33.02 
 
 		 578 aa  261  3e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  32.78 
 
 		 562 aa  260  4e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>