More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3476 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_3476  peptide arylation protein  100 
 
 
542 aa  1050    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00809458  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  50.85 
 
 
853 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0968  AMP-dependent synthetase and ligase  41.7 
 
 
553 aa  343  5e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.809053  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3827  AMP-dependent synthetase and ligase  51.28 
 
 
495 aa  296  9e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189445  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  31.59 
 
 
555 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3211  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
534 aa  197  6e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.155051  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  30.99 
 
 
517 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 
525 aa  192  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 
520 aa  190  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.27 
 
 
549 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  28.73 
 
 
548 aa  187  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.56 
 
 
547 aa  186  8e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  28.55 
 
 
548 aa  186  9e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  28.73 
 
 
566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 
548 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  28.7 
 
 
546 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  28.73 
 
 
566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  28.87 
 
 
553 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  28.73 
 
 
548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.19 
 
 
518 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.94 
 
 
549 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 
542 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2803  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
532 aa  182  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  29.43 
 
 
546 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  33.66 
 
 
524 aa  182  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  29.62 
 
 
546 aa  181  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  29.43 
 
 
546 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  29.43 
 
 
546 aa  180  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  30.22 
 
 
543 aa  179  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2094  yersiniabactin synthetase, YbtE component  31.07 
 
 
525 aa  179  9e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  26.89 
 
 
549 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  29.43 
 
 
546 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  26.82 
 
 
549 aa  179  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09310  short chain acyl-CoA synthetase  28.97 
 
 
549 aa  178  3e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  normal  0.513679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.99 
 
 
547 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4086  AMP-dependent synthetase and ligase  32.1 
 
 
527 aa  177  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432912  normal  0.782905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3615  AMP-dependent synthetase and ligase  32.31 
 
 
555 aa  177  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  26.44 
 
 
549 aa  177  6e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 
533 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  31.13 
 
 
538 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 
552 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.5 
 
 
547 aa  175  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  28.46 
 
 
552 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.46 
 
 
546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  29.03 
 
 
495 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  33.6 
 
 
973 aa  174  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08690  short chain acyl-CoA synthetase  28.65 
 
 
550 aa  173  5.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0212832  normal  0.531653 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  27.07 
 
 
547 aa  171  2e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  29.01 
 
 
550 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.14 
 
 
543 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1442  AMP-binding domain protein  26.95 
 
 
550 aa  171  3e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.684137  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  30.69 
 
 
540 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  30.69 
 
 
540 aa  171  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  31.49 
 
 
994 aa  170  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  26.63 
 
 
549 aa  170  6e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1338  AMP-dependent synthetase and ligase  31.01 
 
 
556 aa  170  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2676  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 
991 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6815  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 
526 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  27.17 
 
 
552 aa  169  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4037  AMP-dependent synthetase and ligase  26.88 
 
 
558 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0518356  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1362  AMP-dependent synthetase and ligase  31.47 
 
 
542 aa  168  2e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00632075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  30.78 
 
 
544 aa  169  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  30.28 
 
 
540 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  29.71 
 
 
576 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.19 
 
 
550 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3290  AMP-binding domain protein  29.42 
 
 
575 aa  167  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.55 
 
 
552 aa  167  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2941  acyl-CoA synthetase  28.68 
 
 
557 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.581775  normal  0.0544542 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3008  AMP-dependent synthetase and ligase  32.02 
 
 
555 aa  166  9e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1862  AMP-dependent synthetase and ligase  25.81 
 
 
554 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000194856  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2947  AMP-binding domain protein  29.42 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.768033  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0108  AMP-binding domain protein  29.42 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.969616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0108  AMP-binding domain protein  29.8 
 
 
575 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480818  normal  0.901201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3458  acyl-CoA synthetase  28.7 
 
 
562 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.220235 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1627  AMP-dependent synthetase and ligase  28.06 
 
 
571 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0099  AMP-binding domain protein  29.48 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3103  AMP-dependent synthetase and ligase  29.94 
 
 
550 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8985  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0124  AMP-binding domain protein  29.8 
 
 
575 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1121  AMP-binding domain protein  29.01 
 
 
548 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.131488  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  25.93 
 
 
544 aa  164  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0779  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.89 
 
 
518 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.746675  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 
566 aa  164  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  28.29 
 
 
498 aa  164  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6769  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 
507 aa  163  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147424  normal  0.533441 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  26.89 
 
 
549 aa  163  9e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  28.77 
 
 
1043 aa  163  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  27.03 
 
 
552 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3892  AMP-binding domain protein  29.02 
 
 
576 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.239396  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2311  acyl-CoA synthetase  28.82 
 
 
557 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.462118  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4871  AMP-dependent synthetase and ligase  29.74 
 
 
506 aa  162  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 
541 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  30.29 
 
 
630 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0643  AMP-dependent synthetase and ligase  30.62 
 
 
640 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.597894  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  27.38 
 
 
513 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  29.06 
 
 
515 aa  162  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  26.8 
 
 
538 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.76 
 
 
518 aa  161  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.18 
 
 
538 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2479  acyl-CoA synthetase  28.63 
 
 
557 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.282098  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.94 
 
 
518 aa  160  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>