More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0968 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0968  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 553 aa  1132    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.809053  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3476  peptide arylation protein  41.7 
 
 		 542 aa  342  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00809458  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1457  AMP-dependent synthetase and ligase  41.35 
 
 		 853 aa  330  4e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.805076  normal  0.11839 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3827  AMP-dependent synthetase and ligase  43.09 
 
 		 495 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0189445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  30.1 
 
 		 518 aa  219  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  29.84 
 
 		 517 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1918  short chain acyl-CoA synthetase  30.38 
 
 		 548 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  31.49 
 
 		 555 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01670  hypothetical protein  30.52 
 
 		 566 aa  213  9e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01659  hypothetical protein  30.52 
 
 		 566 aa  213  9e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1930  short chain acyl-CoA synthetase  30.38 
 
 		 548 aa  213  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0789974 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1494  short chain acyl-CoA synthetase  30.38 
 
 		 546 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.433242 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1904  short chain acyl-CoA synthetase  30.38 
 
 		 548 aa  212  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850786  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 557 aa  212  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1941  AMP-dependent synthetase and ligase  30.19 
 
 		 548 aa  210  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.889751  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.52 
 
 		 541 aa  210  5e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.8 
 
 		 549 aa  209  1e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.89 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 		 552 aa  203  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  28.95 
 
 		 542 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1446  short chain acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 		 546 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.191096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  32.23 
 
 		 973 aa  201  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1462  short chain acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 		 546 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1994  short chain acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 		 546 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.194812  normal  0.059614 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1822  short chain acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 		 546 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3615  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 555 aa  200  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.33 
 
 		 543 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0301  vibriobactin-specific 2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.27 
 
 		 543 aa  199  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1480  short chain acyl-CoA synthetase  29.96 
 
 		 546 aa  199  9e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.712128  normal  0.130818 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2803  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 532 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54940  putative siderophore biosynthesis enzyme  30.26 
 
 		 994 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000391308  unclonable  2.75623e-20 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 520 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.8 
 
 		 540 aa  195  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0027  AMP-dependent synthetase and ligase  28.74 
 
 		 509 aa  194  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.141316  normal  0.236103 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.11 
 
 		 538 aa  194  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.74 
 
 		 538 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.28 
 
 		 546 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.3 
 
 		 538 aa  193  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.92 
 
 		 538 aa  192  1e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.92 
 
 		 538 aa  192  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.74 
 
 		 538 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.17 
 
 		 538 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.74 
 
 		 538 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0943  AMP-dependent synthetase and ligase  28.66 
 
 		 511 aa  192  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.193061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1871  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  30.26 
 
 		 543 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.412507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.76 
 
 		 538 aa  191  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.36 
 
 		 542 aa  190  5e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  31.61 
 
 		 525 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  28.89 
 
 		 548 aa  190  7e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  27.86 
 
 		 553 aa  189  1e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4437  AMP-binding domain protein  27.79 
 
 		 540 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4524  AMP-binding domain protein  27.79 
 
 		 540 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4034  AMP-dependent synthetase and ligase  27.36 
 
 		 552 aa  187  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  30.17 
 
 		 555 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.63836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 630 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4818  AMP-binding domain protein  27.98 
 
 		 540 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0643  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 640 aa  187  6e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.597894  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4296  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.91 
 
 		 539 aa  187  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 524 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  28.49 
 
 		 543 aa  186  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 511 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2386  enterobactin synthase subunit E  29.4 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.444904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1784  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 498 aa  184  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.599535  normal  0.650207 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.22 
 
 		 547 aa  184  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 566 aa  184  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2019  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.95 
 
 		 552 aa  183  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.6073 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  27.24 
 
 		 1043 aa  183  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12527  AMP-binding domain protein  28.05 
 
 		 547 aa  183  8.000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0503764 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0620  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 562 aa  182  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0670  AMP-dependent synthetase and ligase  28.65 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  29.17 
 
 		 638 aa  182  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5287  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 550 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0153885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2821  AMP-binding domain protein  27.64 
 
 		 552 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.187557 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  25.41 
 
 		 549 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0874  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  29 
 
 		 547 aa  181  4e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  26.77 
 
 		 547 aa  181  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5000  AMP-dependent synthetase and ligase  28.62 
 
 		 550 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.106517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3008  AMP-dependent synthetase and ligase  28.31 
 
 		 555 aa  180  5.999999999999999e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  28.49 
 
 		 583 aa  180  7e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2068  AMP-binding domain protein  27.8 
 
 		 596 aa  180  8e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1028  AMP-dependent synthetase and ligase  29.78 
 
 		 548 aa  180  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.11647  hitchhiker  0.00107261 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  28.19 
 
 		 549 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 500 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  29.34 
 
 		 500 aa  180  8e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  26.45 
 
 		 538 aa  179  9e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  25.46 
 
 		 549 aa  179  9e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0752  AMP-binding domain protein  27.45 
 
 		 576 aa  179  9e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  29.55 
 
 		 503 aa  179  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  25.37 
 
 		 549 aa  179  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  27.89 
 
 		 547 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 500 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1338  AMP-dependent synthetase and ligase  26.64 
 
 		 556 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1126  enterobactin synthase subunit E  28.09 
 
 		 536 aa  178  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.893326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  27.69 
 
 		 513 aa  178  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3367  AMP-dependent synthetase and ligase  28.44 
 
 		 550 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  27.9 
 
 		 547 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0872  pyochelin biosynthesis protein PchD  28.76 
 
 		 547 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.453067  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0784  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.63 
 
 		 547 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>