More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3090 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3090  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 553 aa  1118    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0770134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1545  AMP-dependent synthetase and ligase  50.45 
 
 		 549 aa  527  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0467797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  48.85 
 
 		 571 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.153732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.6 
 
 		 547 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1766  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.49 
 
 		 546 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.810333  normal  0.381602 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1035  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.65 
 
 		 547 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3918  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.13 
 
 		 549 aa  220  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.570213  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1544  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  29.89 
 
 		 547 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2287  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 517 aa  212  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4107  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.36 
 
 		 550 aa  211  3e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.71 
 
 		 547 aa  211  3e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  30.37 
 
 		 538 aa  211  4e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.36 
 
 		 547 aa  210  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0914  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  31.12 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.963611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4034  AMP-dependent synthetase and ligase  30.09 
 
 		 552 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3934  AMP-dependent synthetase and ligase  31.67 
 
 		 541 aa  206  7e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0876  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  30.97 
 
 		 543 aa  206  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  29.31 
 
 		 513 aa  203  7e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3103  AMP-dependent synthetase and ligase  29.44 
 
 		 572 aa  200  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.970442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 662 aa  199  9e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  29.1 
 
 		 538 aa  199  9e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20860  peptide arylation enzyme  29.32 
 
 		 551 aa  198  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.651422  normal  0.0115329 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8762  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.17 
 
 		 510 aa  197  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.225168 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4331  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 550 aa  196  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  27.27 
 
 		 549 aa  194  3e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2177  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.26 
 
 		 538 aa  194  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00190695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1399  short chain acyl-CoA synthetase  29.78 
 
 		 555 aa  194  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0216639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.64 
 
 		 524 aa  194  5e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2990  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.83 
 
 		 538 aa  194  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.830414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  27.27 
 
 		 549 aa  192  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6445  AMP-dependent synthetase and ligase  28.37 
 
 		 542 aa  192  1e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.607182  hitchhiker  3.41608e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2400  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.62 
 
 		 538 aa  192  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.584614  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  26.92 
 
 		 549 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0663  AMP-binding domain protein  28.01 
 
 		 547 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.390649  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0100  AMP-dependent synthetase and ligase  29.39 
 
 		 519 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4872  AMP-binding domain protein  30.69 
 
 		 549 aa  190  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21210  enterobactin synthetase component E (2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase)  29.67 
 
 		 548 aa  189  8e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0419167  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2470  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.44 
 
 		 538 aa  189  9e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00193535  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2803  AMP-dependent synthetase and ligase  29.96 
 
 		 532 aa  189  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.66 
 
 		 519 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4791  AMP-dependent synthetase and ligase  31.03 
 
 		 500 aa  189  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.743818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4933  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 		 555 aa  188  2e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.63836 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2335  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.08 
 
 		 538 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  28.06 
 
 		 518 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7687  long-chain-fatty-acid-CoA-ligase  31.27 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4966  AMP-dependent synthetase and ligase  30.3 
 
 		 503 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2816  AMP-dependent synthetase and ligase  30.73 
 
 		 566 aa  187  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.269281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 1043 aa  187  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4410  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 500 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  31.11 
 
 		 500 aa  187  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.62299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4723  AMP-binding domain protein  29.82 
 
 		 560 aa  186  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.712671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1756  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.21 
 
 		 540 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0218117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 		 498 aa  186  1.0000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5309  AMP-dependent synthetase and ligase  29.56 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0670  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 		 550 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2396  AMP-dependent synthetase and ligase  27.8 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.17 
 
 		 518 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2145  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.26 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2388  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.26 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  30.98 
 
 		 504 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  30.9 
 
 		 507 aa  184  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  31.36 
 
 		 539 aa  184  4.0000000000000006e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0175  AMP-dependent synthetase and ligase  28.96 
 
 		 557 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3844  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.46 
 
 		 565 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1884  AMP-dependent synthetase and ligase  26.69 
 
 		 495 aa  183  6e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1830  salicyl-AMP ligase  28.83 
 
 		 638 aa  183  6e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.798575  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3008  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 		 555 aa  183  6e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0424052  normal  0.64241 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5256  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  28.08 
 
 		 549 aa  183  7e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.242586  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2206  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.26 
 
 		 538 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2129  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.08 
 
 		 538 aa  182  1e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.933368  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2370  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  27.26 
 
 		 538 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1693  AMP-binding domain protein  30.98 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.301435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  27.26 
 
 		 518 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1853  short chain acyl-CoA synthetase  26.58 
 
 		 543 aa  182  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.342081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0874  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.99 
 
 		 547 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0784  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.99 
 
 		 547 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3209  AMP-binding domain protein  28.39 
 
 		 546 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.609491  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3108  AMP-binding domain protein  28.39 
 
 		 546 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580008  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.16 
 
 		 521 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.02 
 
 		 526 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1803  2,3-dihydroxybenzoate-AMP ligase  28.91 
 
 		 542 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.89 
 
 		 518 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1756  AMP-dependent synthetase and ligase  29 
 
 		 564 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.598576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3808  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.762435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2361  AMP-dependent synthetase and ligase  30.15 
 
 		 550 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.727031  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3937  AMP-binding domain protein  27.96 
 
 		 539 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.104158  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  30.07 
 
 		 579 aa  181  4e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4161  AMP-binding domain protein  29.51 
 
 		 577 aa  180  4.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0252  AMP-binding domain protein  29.07 
 
 		 564 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4056  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.9 
 
 		 565 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.602751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0057  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 487 aa  181  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0462  AMP-binding domain protein  29.62 
 
 		 564 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0365  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 524 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1340  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.9 
 
 		 565 aa  180  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0671762 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21370  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.03 
 
 		 562 aa  180  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2148  salicyl-AMP ligase  28.99 
 
 		 687 aa  180  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0537387  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1818  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 563 aa  179  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  normal  0.361334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.27 
 
 		 562 aa  179  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0156421  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3615  AMP-dependent synthetase and ligase  29.92 
 
 		 555 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>