More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2515 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2515  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
527 aa  1050    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.921526 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1228  AMP-dependent synthetase and ligase  48.01 
 
 
540 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3649  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.86 
 
 
537 aa  460  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3660  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.86 
 
 
537 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00222723  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1579  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.2 
 
 
537 aa  455  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000333435  normal  0.0479837 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3421  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.67 
 
 
537 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000306697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3382  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.67 
 
 
537 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000971977  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3332  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.67 
 
 
537 aa  457  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000121528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3316  AMP-dependent synthetase and ligase  43.48 
 
 
537 aa  457  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000368323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3690  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.67 
 
 
537 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000281571  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2108  AMP-dependent synthetase and ligase  47.65 
 
 
539 aa  455  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3641  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.67 
 
 
537 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3738  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.48 
 
 
537 aa  456  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.739742  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0159  AMP-dependent synthetase and ligase  47.4 
 
 
544 aa  448  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.109446  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2273  AMP-dependent synthetase and ligase  44.36 
 
 
533 aa  448  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0224  AMP-dependent synthetase and ligase  46.42 
 
 
549 aa  445  1e-123  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0391267  normal  0.0314439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.4 
 
 
536 aa  435  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.894837  normal  0.430514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1398  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.1 
 
 
541 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5445  AMP-dependent synthetase and ligase  43.69 
 
 
544 aa  433  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.513748  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0094  AMP-dependent synthetase and ligase  45.08 
 
 
544 aa  431  1e-119  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3348  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 
542 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2549  AMP-dependent synthetase and ligase  45.81 
 
 
550 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.798559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4882  AMP-dependent synthetase and ligase  43.02 
 
 
543 aa  430  1e-119  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.7037  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5976  AMP-dependent synthetase and ligase  43.02 
 
 
551 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.636472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1895  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.05 
 
 
547 aa  428  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1825  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.63 
 
 
584 aa  425  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.754963  normal  0.415446 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5208  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.45 
 
 
547 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.592335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2982  AMP-dependent synthetase and ligase  44.97 
 
 
537 aa  424  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.874572  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1863  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.43 
 
 
534 aa  423  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.856558  normal  0.360106 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1027  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.05 
 
 
560 aa  422  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729958  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3248  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.13 
 
 
543 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0235  AMP-dependent synthetase and ligase  45.23 
 
 
538 aa  421  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0380  putative acyl-CoA synthetase  42.97 
 
 
545 aa  422  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3198  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.13 
 
 
543 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.102582  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6172  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.88 
 
 
569 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.489705  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3186  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.13 
 
 
543 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.894285  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2358  AMP-dependent synthetase and ligase  46.33 
 
 
542 aa  419  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.594651  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1907  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.88 
 
 
569 aa  420  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.45334  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.07 
 
 
547 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.049446  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5711  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.61 
 
 
546 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11076  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.51 
 
 
543 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0440642 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4136  AMP-dependent synthetase and ligase  45.68 
 
 
587 aa  418  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.679053  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5332  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.42 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.7188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5421  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.42 
 
 
546 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8848  AMP-dependent synthetase and ligase  43.37 
 
 
541 aa  413  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  41.32 
 
 
546 aa  414  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1367  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.88 
 
 
547 aa  414  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0878998  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2171  AMP-dependent synthetase and ligase  43.26 
 
 
546 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.109477 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3973  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  45.25 
 
 
545 aa  409  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1749  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.46 
 
 
542 aa  411  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0360029  normal  0.897782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1585  AMP-dependent synthetase and ligase  43.66 
 
 
549 aa  411  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0905  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 
547 aa  410  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4358  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  44.28 
 
 
549 aa  409  1e-113  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.124731 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1925  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.73 
 
 
561 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113828  normal  0.439232 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2141  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.34 
 
 
589 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2275  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.73 
 
 
562 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0961938  normal  0.119305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1678  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.32 
 
 
545 aa  410  1e-113  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2026  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.95 
 
 
545 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.923979  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5439  medium-chain-fatty-acid-CoA ligase  42.21 
 
 
545 aa  410  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.632192  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1913  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 
549 aa  409  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000707868  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0328  AMP-dependent synthetase and ligase  42.59 
 
 
540 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2552  AMP-dependent synthetase and ligase  42.78 
 
 
575 aa  407  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.333339  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2335  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.34 
 
 
546 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1590  AMP-dependent synthetase and ligase  42.37 
 
 
547 aa  407  1.0000000000000001e-112  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0000420413  normal  0.904573 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2296  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.34 
 
 
546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3306  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.95 
 
 
545 aa  404  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.135648  normal  0.0145757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3283  AMP-dependent synthetase and ligase  41.86 
 
 
553 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1455  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.59 
 
 
542 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0933982  hitchhiker  0.0000905753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  42.72 
 
 
546 aa  403  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0626  AMP-dependent synthetase and ligase  40.3 
 
 
507 aa  399  9.999999999999999e-111  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1496  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.02 
 
 
542 aa  401  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.810818 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1439  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.16 
 
 
544 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.64772  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3375  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.16 
 
 
544 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1203  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.16 
 
 
544 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2393  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.51 
 
 
542 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0010153  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  42.83 
 
 
699 aa  400  9.999999999999999e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2639  medium-chain-fatty-acid--CoA ligase  43.43 
 
 
480 aa  401  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1930  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.16 
 
 
544 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.641249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2579  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  41.94 
 
 
542 aa  398  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.76612  normal  0.235984 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0437  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 
547 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0809367  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2946  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.87 
 
 
546 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.916006 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1837  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.91 
 
 
541 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0196277  normal  0.206597 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1843  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.75 
 
 
556 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5172  AMP-dependent synthetase and ligase  42.09 
 
 
549 aa  394  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.569954  normal  0.858795 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4824  AMP-dependent synthetase and ligase  42.01 
 
 
551 aa  393  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  0.874224 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  42.97 
 
 
552 aa  392  1e-108  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2456  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  42.18 
 
 
548 aa  391  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4392  AMP-dependent synthetase and ligase  41.59 
 
 
542 aa  391  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  41.78 
 
 
545 aa  389  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0471179  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1769  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.83 
 
 
558 aa  391  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00212051 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1799  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.23 
 
 
547 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1315  AMP-dependent synthetase and ligase  40.52 
 
 
965 aa  388  1e-106  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.689219  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2733  AMP-dependent synthetase and ligase  42.08 
 
 
542 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.996251  normal  0.088635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2845  AMP-dependent synthetase and ligase  40.92 
 
 
540 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0424  AMP-dependent synthetase and ligase  41.51 
 
 
565 aa  385  1e-106  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0622  AMP-dependent synthetase and ligase  40.45 
 
 
550 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.49286  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0495  AMP-dependent synthetase and ligase  39.2 
 
 
553 aa  383  1e-105  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.61838  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0444  AMP-dependent synthetase and ligase  40.23 
 
 
542 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2455  putative acyl-CoA synthetase  38.75 
 
 
542 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.680464  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5305  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  40.45 
 
 
549 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>