More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2953 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_2953  glycosyl transferase family protein  100 
 
 
268 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.666852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3652  glycosyl transferase family 2  58.13 
 
 
246 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0575879  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  59.68 
 
 
243 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2088  AMP-dependent synthetase and ligase  56.54 
 
 
807 aa  257  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0219  glycosyl transferase family protein  25.4 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1256  glycosyl transferase family protein  29.83 
 
 
240 aa  74.3  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000223583  normal  0.193996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1536  glycosyl transferase family 2  31.91 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0119  glycosyl transferase family protein  26.89 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1798  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.521662  normal  0.0312048 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  28.15 
 
 
233 aa  67  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  28.57 
 
 
281 aa  63.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1431  glycosyl transferase family 2  26.4 
 
 
376 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.679301 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  27.87 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1078  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
232 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0892634  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  30.85 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3671  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 
300 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.488131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 
286 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
428 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 
326 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0337  glycosyl transferase family protein  25.74 
 
 
273 aa  59.3  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3596  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
418 aa  58.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  37.18 
 
 
234 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.9 
 
 
326 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.9 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1343  glycosyl transferase family protein  31.22 
 
 
522 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0725214  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06135  putative glycosyltransferase  23.96 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.614434  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  31.31 
 
 
332 aa  58.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  29.9 
 
 
326 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1529  glycosyl transferase family 2  33 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.322486  normal  0.0695414 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1851  glycosyl transferase, group 2 family protein  33 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  30.19 
 
 
335 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0221  glycosyl transferase family protein  28.8 
 
 
368 aa  57.4  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  26.98 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3305  glycosyl transferase family protein  40.59 
 
 
342 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.240811 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4939  glycosyl transferase family protein  30.8 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  39.02 
 
 
1168 aa  56.6  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  32.71 
 
 
390 aa  56.6  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7707  glycosyl transferase family protein  27.69 
 
 
889 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.89 
 
 
1157 aa  55.8  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  31.68 
 
 
398 aa  55.8  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2119  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.67 
 
 
253 aa  56.2  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.731271 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  29.37 
 
 
304 aa  55.8  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  35.06 
 
 
345 aa  56.2  0.0000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1147  glycosyl transferase family 2  30.4 
 
 
330 aa  56.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00000120628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  34.68 
 
 
259 aa  55.8  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  33.64 
 
 
1169 aa  55.8  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2796  glycosyl transferase family 2  28.8 
 
 
445 aa  55.5  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00473291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
373 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1225  family 2 glycosyl transferase  30.63 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  28 
 
 
365 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1146  glycosyl transferase family protein  28.92 
 
 
294 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.811113 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  32.41 
 
 
397 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1461  glycosyl transferase family 2  26.83 
 
 
239 aa  54.3  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  23.66 
 
 
479 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4101  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 
390 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116147  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
317 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1836  glycosyl transferase family 2  27.8 
 
 
235 aa  53.5  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.25121  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00600  glycosyl transferase  36.15 
 
 
298 aa  53.9  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0724725 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1567  glycosyl transferase family protein  32.52 
 
 
363 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  34 
 
 
344 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02465  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  28.57 
 
 
309 aa  53.9  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.248238  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0011  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000912491 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3199  glycosyl transferase family 2  30.63 
 
 
349 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1890  glycosyl transferase family protein  22.96 
 
 
443 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4699  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
308 aa  52.8  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.252181  normal  0.0261338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  30.83 
 
 
309 aa  53.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0245  glycosyl transferase family 2  25.32 
 
 
380 aa  53.1  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0941  glycosyl transferase family 2  29.93 
 
 
376 aa  53.1  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0542  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
983 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.211097  normal  0.295918 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  39.56 
 
 
435 aa  52.8  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  26 
 
 
326 aa  52.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3922  family 2 glycosyl transferase  28.44 
 
 
334 aa  52.4  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2503  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.07 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.149147  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2548  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.07 
 
 
265 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0557  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 
250 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3992  glycosyl transferase family protein  30.16 
 
 
353 aa  52.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.562545  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0560  glycosyl transferase family protein  35.14 
 
 
225 aa  52.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2437  glycosyl transferase family 2  32.97 
 
 
357 aa  52.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2582  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
1038 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.601969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
360 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  23.32 
 
 
481 aa  52  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02661  glycosyltransferase  26.83 
 
 
248 aa  51.6  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
445 aa  51.6  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  39.42 
 
 
344 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1362  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 
324 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1330  glycosyl transferase, group 2 family protein  24.6 
 
 
294 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.472766  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  31.86 
 
 
403 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2889  glycosyltransferase-like  26.61 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0397  polysaccharide deacetylase  25.38 
 
 
1154 aa  50.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.553625 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2393  glycosyl transferase family 2  23.89 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  30.53 
 
 
302 aa  51.2  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01361  hypothetical protein  29.32 
 
 
273 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
337 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2229  glycosyl transferase family protein  26 
 
 
274 aa  50.4  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  24.88 
 
 
1002 aa  50.1  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3354  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 
789 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.558699  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 
390 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7281  glycosyl transferase family 2  44.58 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.764542  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3416  polysaccharide deacetylase  27.05 
 
 
789 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>